Anahtar Farkı – YAC ve BAC Vektörleri
Vektörler moleküler klonlamada kullanılır. Bir vektör, yabancı genetik materyali başka bir hücreye taşımak için bir araç gibi davranan bir DNA molekülü olarak tanımlanabilir. Yabancı DNA içeren bir vektör, rekombinant DNA olarak bilinir ve onu konukçu organizma içinde kopyalama ve ifade etme yeteneğine sahip olmalıdır. Maya yapay kromozomu (YAC) ve bakteriyel yapay kromozom (BAC), klonlamada yer alan iki tür vektördür. temel fark YAC ve BAC arasında YAC, maya hücrelerine büyük genetik materyal segmentleri eklemek için belirli bir maya kromozomu bölgesi kullanan yapay olarak oluşturulmuş bir vektör sistemi iken BAC, belirli bir E bölgesi kullanan yapay olarak oluşturulmuş bir vektör sistemidir. E. coli hücrelerine büyük DNA segmentleri eklemek için coli kromozomu.
YAC vektörleri nelerdir?
YAC (Maya yapay kromozomu), büyük bir yabancı DNA segmenti taşıma ve maya hücreleri içinde çoğalma yeteneğine sahip, yapay olarak oluşturulmuş bir kromozomdur. Bir sentromere, telomerlere ve aynı zamanda replikasyon ve stabilite için gerekli olan otonom replike dizilere sahiptir. YAC, aynı zamanda, onu etkili bir klonlama vektörü yapmak için seçici bir işaretleyici veya işaretleyiciler ve kısıtlama bölgeleri taşımalıdır. 1000 kb ile 2000 kb arasında değişen büyük bir dizi YAC'a eklenebilir ve mayaya aktarılabilir. YAC'nin dönüşüm verimliliği çok düşük.
Şekil 01: YAC Vektör
BAC Vektörleri nedir?
Bakteriyel yapay kromozom (BAC), moleküler klonlama için yapay olarak oluşturulmuş bir kromozomdur. E. coli F plazmidinin belirli bölgelerine sahiptir ve dairesel ve süper sarmaldır. BAC, DNA parçalarını bakterilere, özellikle E. coli'ye klonlamak için geliştirilmiştir. 300 kb'a kadar olan DNA parçalarını taşıyabilir. YAC ile karşılaştırıldığında, BAC klonlama uçları boyut olarak daha küçüktür. BAC'ler 1992'de geliştirildi ve stabilitesi ve yapım kolaylığı nedeniyle hala popüler. BAC'ler ayrıca aşı geliştirmede de faydalıdır.
Şekil 02: Moleküler klonlamada BAC Vektörü
YAC ve BAC Vektörleri arasındaki fark nedir?
YAC ve BAC Vektörleri |
|
| YAC, klonlama amacıyla maya DNA'sının kullanıldığı, genetiğiyle oynanmış bir kromozomdur. | BAC, klonlama amacıyla E. coli DNA'sını kullanan, genetiğiyle oynanmış bir DNA molekülüdür. |
| Cinsiyet | |
| YAC'ler, büyük genomik DNA parçalarını mayaya klonlamak için tasarlandı. | BAC'ler, büyük genomik parçaları Escherichia coli'ye klonlamak için geliştirildi. |
| Uzunluk Ekle | |
| YAC'ler megabaz boyutunda genomik ekler içerebilir.(1000 kb – 2000 kb). | BAC'ler 200–300 kb veya daha az ekleri taşıyabilir. |
| İnşaat | |
| YAC DNA'nın bozulmadan saflaştırılması zordur ve YAC vektör sistemi oluşturmak için yüksek konsantrasyon gerektirir. | BAC'nin bozulmadan saflaştırılması kolaydır ve kolayca oluşturulabilir. |
| Kimerizm | |
| YAC'ler genellikle kimeriktir. | BAC'ler nadiren kimeriktir. |
| İstikrar | |
| YAC kararsız. | BAC kararlı. |
| Değişiklikler | |
| Maya rekombinasyonu çok uygundur ve her zaman aktif kalır. Bu nedenle, bir YAC'de silmeler ve diğer yeniden düzenlemeler oluşturabilir. | E. coli rekombinasyonu önlenir ve gerektiğinde açılır. Bu nedenle, BAC'lerde istenmeyen yeniden düzenlemeleri az altır. |
| Bakım | |
| Rekombinant YAC'leri manipüle etmek genellikle sonraki manipülasyon için YAC'nin E. coli'ye aktarılmasını gerektirir. Bu nedenle zahmetli bir işlemdir. | BAC modifikasyonu doğrudan E. coli'de gerçekleşir. Yani DNA transferine gerek yok. Bu nedenle süreç zahmetli değildir. |
Özet – YAC ve BAC Vektörleri
YAC, büyük DNA parçalarını konakçı organizmaya klonlama yeteneği nedeniyle klonlama süreçlerinde önemli bir araştırma aracı haline geldi. Bununla birlikte, YAC'lerin vektörler olarak yapım zorlukları, kimerizm, kararsızlık vb. gibi dezavantajları vardır. Bu nedenle, bilim adamları bu sorunların üstesinden gelmek için BAC vektörleri geliştirdiler. BAC, E. coli kromozomunun belirli bölgeleri kullanılarak oluşturulmuştur. Kararlı bir vektördür ve kolayca oluşturulabilir. Bununla birlikte, BAC'ın işleyebileceği DNA uzunluğu, YAC'ınkinden 20 kat daha azdır. YAC ve BAC vektör sistemleri arasındaki fark budur. Günümüzde laboratuvarlarda BAC, YAC'a göre daha çok tercih edilmektedir.
