Alfa ve beta sarmalı arasındaki temel fark, bu yapıları geliştirirken oluşturdukları Hidrojen bağı türüne dayanır. Alfa sarmalları moleküller arası hidrojen bağları oluştururken beta sarmalları moleküller arası hidrojen bağları oluşturur.
Karmaşık proteinlerin dört yapısal organizasyon düzeyi vardır - birincil, ikincil, üçüncül ve dördüncül. Proteinlerin ikincil yapıları, farklı yönlerde peptit zincirlerini oluşturur. Peptit zincirleri, peptit bağları ile bağlanan amino asit dizilerinden oluşur. Bu nedenle proteinlerde alfa sarmalı ve beta sarmalı olmak üzere iki ana ikincil yapı vardır. Ayrıca beta dönüşü ve firkete yapıları olarak adlandırılan başka ikincil yapılar da vardır. Temel olarak, bu makale alfa ve beta sarmalı arasındaki farka odaklanmaktadır.
Alfa Sarmalı nedir?
Proteinlerin dört yapısal organizasyon düzeyi vardır. Bunlardan alfa sarmalı, proteinlerin en yaygın ikincil yapısıdır. Ve bu yapı, merkezi bir eksen etrafına sarılmış bir çubuk gibi görünür. Ayrıca, alfa sarmalı sağ elle kullanılan bir sarmaldır. Ancak, solak sarmallar da mevcut olabilir. Burada, amino terminalinden karboksi terminaline peptit bağları oluşur. Amino asitler, bu peptit bağları aracılığıyla birbirine bağlanır. Molekül içi hidrojen bağları, alfa sarmalının oluşmasının ana nedenidir.
Şekil 01: Alfa Sarmalı
Alfa sarmalının düzenlenmesi, proteinin hidrofilik ve hidrofobik doğasına bağlıdır. Amino asit dizisi yüksek sayıda hidrofilik R (değişken) grubundan oluşuyorsa, R grupları sulu faza yönelir. Değişken gruplar hidrofobik ise, ortamın hidrofobik fazına çıkacaklardır. Her iki senaryoda da, R grupları sarmal yapının dışına doğru uzanıyor gibi görünmektedir. Bu yapısal özelliklerinden dolayı alfa sarmalı mutasyonlara karşı daha dirençlidir. Böylece, Hidrojen bağlarının varlığı alfa sarmalının yapısını stabilize eder. Hidrojen bağlarının gelişmesi için 3,6 tortu gerektiğinden, bir alfa sarmalında dönüş başına ortalama 3,6 tortu vardır. Kollajen ve keratin gibi bazı yapısal proteinler alfa sarmalları bakımından zengindir.
Beta Sarmalı nedir?
Bir beta sarmalı, bir proteinin en yaygın ikinci ikincil yapısıdır. Alfa sarmalı kadar yaygın olmasa da beta sarmalının varlığı da protein yapısında büyük rol oynar. Beta sarmalının oluşumu, ya paralel ya da anti-paralel biçimde düzenlenmiş iki beta yaprağı aracılığıyla gerçekleşir. Bu tabakalar daha sonra sarmal bir yapı oluşturur. İki yaprak ipliği arasındaki moleküller arası Hidrojen bağları, bir beta sarmalının oluşumuna yardımcı olur.
Şekil 02: Beta Sarmalı
Beta sarmalları, bağlama düzenlerine bağlı olarak hem sağ hem de sol elle olabilir. Bir beta sarmalı oluştururken, iki beta yaprağının değişken grupları sarmalın çekirdeği içinde yer alacaktır. Bu nedenle beta yapraklarını oluşturan grupların çoğu hidrofobik işlevlere sahiptir.
Alfa sarmalının aksine, 17 kalıntı Beta sarmalında bir dönüş oluşturur. Metal iyonları, Beta sarmalının oluşumunu aktive etme yeteneğine sahiptir. Alfa sarmalına benzer şekilde, Hidrojen bağları Beta sarmalının yapısını korumayı destekler. Karbonik anhidraz enzimi ve pektat liyaz, beta sarmalları açısından zengin iki proteindir.
Alfa ve Beta Helix Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Alpha ve Beta Helix, proteinlerin iki ikincil yapısıdır.
- Amino asitler, her iki ikincil yapının da monomeridir.
- Ayrıca, alfa ve beta sarmallarının kimyasal bileşenleri karbon, hidrojen, oksijen, nitrojen ve kükürttür.
- Ayrıca, her iki ikincil yapı da daha üst düzey bir organizasyona dönüşür.
- Ayrıca, ikisi de hidrojen bağları ile stabilize edilir.
- Her iki yapıda da hidrofobiklik, amino asitlerin R gruplarının varlığı ile belirlenir.
Alfa ve Beta Helix Arasındaki Fark Nedir?
Alfa ve beta sarmalı arasındaki temel fark, gösterdikleri hidrojen bağı türüdür. Alfa sarmalı moleküller arası hidrojen bağını gösterirken beta sarmalı moleküller arası hidrojen bağını gösterir. Ek olarak, alfa sarmalı sağ elli bir sarmal oluştururken, beta sarmalı hem sağ hem de sol elli sarmallar oluşturabilir. Yani bu aynı zamanda alfa ve beta sarmalı arasındaki önemli bir farktır.
Ayrıca, alfa ve beta sarmalı arasındaki diğer bir fark, alfa sarmalı oluşumunun amino asit dizisinin bükülmesiyle gerçekleşmesidir, oysa beta sarmalı oluşumunda iki beta yaprağı paralel veya anti-paralel olarak birbirine bağlanır. sarmal yapıyı oluşturur.
Aşağıdaki bilgi grafiği, alfa ve beta sarmalı arasındaki farkla ilgili daha fazla bilgi sunar.
Özet – Alfa ve Beta Helix
Hem alfa sarmalları hem de beta sarmalları, karmaşık protein yapılarının tanımlanmasında ve çıkarılmasında önemlidir. Her iki tip de proteinlerin ikincil yapılarıdır. Bununla birlikte, alfa sarmalı, amino asit dizilerinin sarmal bir bükülmesidir. Buna karşılık, beta sarmalı oluşumu, paralel veya anti-paralel beta tabakalarının Hidrojen bağı yoluyla gerçekleşir. Ayrıca, Hidrojen bağı alfa sarmalı biçiminde molekül içi iken, hidrojen bağı beta sarmalı biçiminde moleküller arasıdır. Ayrıca, bu yapıların her ikisi de proteinin hidrofobikliğini belirleyen bir R grubuna sahiptir. Böylece, bu alfa ve beta sarmalı arasındaki farkı özetler.
