Grup I ve grup II intronları arasındaki temel fark, grup I intronlarında birleştirme reaksiyonunun bir guanozin kofaktörü tarafından başlatılması, grup II intronlarında ise birleştirme reaksiyonunun dahili adenozin tarafından başlatılmasıdır.
Pre-mRNA, hem intronları hem de eksonları olan birincil transkripttir. Pre-mRNA, çeviriden önce mRNA'ya dönüşmelidir. RNA eklenmesi veya mRNA öncesi eklenmesi, bu tür bir transkripsiyon sonrası modifikasyondur. RNA eklemede, intronlar pre-mRNA molekülünden çıkarılır ve eksonlar birleştirilir. Grup I ve Grup II intronları, kendi kendini ekleyen intronlardır. Herhangi bir başka enzimin yardımı olmadan pre-mRNA molekülünden ayrılırlar. Bu nedenle, pre-mRNA'dan kendi birleşmelerini katalize eden RNA enzimleri veya ribozimlerdir. Ayrıca, hareketli elemanlar olarak işlev görme yeteneğine de sahiptirler. Ekleme sırasında, intronu çıkarmak ve ekzonları bağlamak için bir dizi trans-esterifikasyon reaksiyonu gerçekleşir. Bu ribozimler, bakteriler, arkeler ve ökaryotlar dahil olmak üzere her üç alanda da mevcuttur.
Grup I İntronları nedir?
Grup I intronları, bakterilerde, bakteriyofajlarda ve ökaryotlarda (organellar ve nükleer genomlar) bulunan kendi kendini ekleyen ribozimlerin bir türüdür. Temel genlerde bulunurlar. Pre-mRNA molekülünden kendi birleşmelerini katalize edebilirler. Grup I intronları birkaç yüz ila üç bin nükleotid içerebilir. Ayrıca, organizmalar arasında çok az dizi benzerliği sergilerler.
Şekil 01: Grup I İntronları
İkincil yapılar dört kısa bölgede yüksek oranda korunmuştur. Eklemenin iki transesterifikasyon reaksiyon aşaması vardır. Grup I intronları, 5P ek yerinde bir Guanozin kofaktörünün 3' hidroksilinin nükleofilik saldırısıyla ekleme mekanizmasını başlatır.
Grup II İntronlar nelerdir?
Grup II intronları, üç alanın tümüne ait organizmalarda bulunan bir tür kendi kendini ekleyen intronlardır. Pre-mRNA'dan kendi ekleme reaksiyonlarını katalize eden ribozimlerdir. rRNA, tRNA ve protein kodlayan genlerde bulunurlar. Ancak grup I intronların aksine nükleer genomlarda bulunmazlar.
Şekil 02: Grup II İntronları
Grup II intronları, grup I intronlarına benzer iki transesterifikasyon adımı yoluyla eklemeyi katalize eder. Bu enzimler, dallanma bölgesi adenosinin 2' OH'sinin 5' ek bağlantısına nükleofilik saldırısı ile ekleme reaksiyonunu başlatır. Ekleme reaksiyonları sırasında, grup II intronları kement benzeri bir yapı oluşturur. Ayrıca, intron ekleme GTP'nin yokluğunda gerçekleşir.
Grup I ve Grup II İntronlar Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Grup I ve grup II intronlar, iki tür RNA enzimidir, farklı mekanizmalarla kendi birleşmelerini katalize eden ribozimlerdir.
- Onlar büyük ribozimlerdir.
- Her ikisi de üç alanda da bulunur.
- Onlar mobil öğelerdir.
- Ayrıca rRNA, tRNA ve protein kodlayan genlerde bulunurlar.
- Her iki enzim de biyoteknolojide ve moleküler tıpta hedeflenen gen nakavt/knock-down, gen iletimi veya gen terapi sistemleri için araç olarak kullanılıyor.
Grup I ve Grup II İntronlar Arasındaki Fark Nedir?
Grup I intronları bakteri, bakteriyofaj ve ökaryotik organel ve nükleer genomlarda bulunan ribozimlerdir. Grup II intronlar bakteri, arke ve ökaryotik organellerde bulunan ribozimlerdir. Ayrıca, grup I intronları, 5P ek yerinde bir guanozin kofaktörünün 3' hidroksilinin nükleofilik saldırısı ile ekleme reaksiyonunu başlatırken, grup II intronları, dal bölgesi adenosinin 2' OH'sinin nükleofilik saldırısı ile ekleme reaksiyonunu başlatır. 5' ek yeri. Bu, grup I ve grup II intronları arasındaki temel farktır.
Ayrıca, grup II intronları ekleme sırasında kement benzeri bir yapı oluştururken grup I intronları oluşmaz. Dolayısıyla bu, grup I ve grup II intronları arasındaki bir başka önemli farktır. Ayrıca, grup I intronları ökaryotik nükleer genomlarda bulunurken, grup II intronları ökaryotik nükleer genomlarda bulunmaz.
Aşağıdaki Infographic, yan yana karşılaştırma için grup I ve grup II intronları arasındaki farkları tablo biçiminde listeler.
Özet – Grup I ve Grup II İntronlar
Grup I ve II intronları, intronları birincil transkriptten ayırmak için bir transesterifikasyon reaksiyonunu katalize eden büyük ribozimlerdir. Her üç alanda da bulunurlar. Her ikisi de hareketli genetik elementlerdir. Ayrıca biyoteknoloji ve moleküler tıpta araç olarak kullanılırlar. Bununla birlikte, grup I intronları, 5P ek yerinde bir guanozin kofaktörünün 3' OH'sinin nükleofilik saldırısı ile ekleme reaksiyonunu başlatır. Ancak, grup II intronları, dallanma bölgesi adenosinin 2' OH'sinin 5' ek bağlantısı üzerindeki nükleofilik saldırısı ile ekleme reaksiyonunu başlatır. Ayrıca, grup II intronları ekleme sırasında kement benzeri bir yapı oluştururken grup I intronlar kement benzeri bir yapı oluşturmaz. Böylece, grup I ve grup II intronları arasındaki farkın özeti budur.
