Aday gen ile GWAS arasındaki temel fark, aday gen yaklaşımının az sayıda önceden belirlenmiş ilgi konusu gen içindeki genetik varyasyonu araştırması, GWAS ise belirli bir hastalık durumunun arkasındaki ortak bir genetik varyasyon için tüm genomu araştırmasıdır.
Aday gen yaklaşımı ve genom çapında ilişkilendirme çalışmaları (GWAS), hastalıklara genetik yatkınlığı saptamak için önemli olan iki yöntemdir. Aday gen yaklaşımı, önceden belirlenmiş az sayıda gene dayanırken, GWAS tüm genomu test etmeye dayanır. Bu nedenle aday gen yaklaşımı, GWAS'ın aksine, hastalıkla ilgili genlerin önceden bilinmesini gerektirir.
Aday Gen nedir?
Aday gen yaklaşımı, önceden belirlenmiş ilgili genlerdeki genetik varyasyon ile fenotipler veya hastalık durumları arasındaki ilişkiyi araştıran tekniklerden biridir. Bu yaklaşımda, genin söz konusu özellik veya hastalık üzerindeki biyolojik fonksiyonel etkisi hakkında önceden bilgi sahibi olmak gerekir. Bu bilgiye dayanarak, az sayıda gen seçilir ve genetik varyasyon için analiz edilir.
Şekil 01: Aday Gen Yaklaşımı
Bu yaklaşımda genlerin seçimi, söz konusu hastalıkla biyolojik, fizyolojik ve fonksiyonel alaka düzeyine göre yapılır. Bu yaklaşım genellikle bir vaka kontrol çalışması olarak tasarlanmıştır.
GWAS nedir?
GWAS, Genom Çapında İlişkilendirme Çalışması anlamına gelir. Aynı zamanda tüm genom ilişkilendirme çalışmalarına atıfta bulunur. Bu çalışmalar esas olarak gözlemsel çalışmalara odaklanmaktadır. Genellikle belirli bir özellik ile ilişkili farklı bireylerin genetik varyantlarını analiz ederler. GWAS analizi için tüm genom önemlidir.
GWAS, çeşitli hastalık koşullarıyla ilişkili tek nükleotid polimorfizmlerinin analizinde önemli bir araçtır. Geniş bir popülasyonda farklı tek nükleotid polimorfizmlerinin karşılaştırmalı bir çalışmasıdır. GWAS'ın çalışma örneklemi çok yüksektir; bu nedenle, kesitsel bir kohort çalışması biçimini de alır.
Şekil 02: GWAS
İlk GWAS çalışması miyokard enfarktüsü ve miyokard enfarktüsü ile ilişkili genlerin analizi ile ilgili olarak yapılmıştır. Şu anda GWAS, etiyolojisi bilinmeyen karmaşık hastalıkların genetik arka planını belirlemede önemli bir rol oynamaktadır.
Aday Gen ve GWAS Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Hem aday gen yaklaşımı hem de GWAS, hastalığın genotipi ve fenotipi arasındaki genetik ilişkiyi analiz eden tekniklerdir.
- Her iki yaklaşım da hastalığa yatkınlığın genetik temelini anlamaya yardımcı olur.
Aday Gen ile GWAS Arasındaki Fark Nedir?
Aday gen yaklaşımı, aday genlere veya önceden belirlenmiş genlere dayanırken, GWAS tüm genomu temel alır. Bu, aday gen ile GWAS arasındaki temel farktır. Ayrıca aday gen yaklaşımında, GWAS'ta ihtiyaç duyulmazken genlerin seçimi gereklidir.
Ayrıca aday gen yaklaşımı, hastalıkla ilgili genler hakkında önceden bilgi sahibi olmayı gerektirirken GWAS için gerekli değildir.
Aşağıdaki infografik, aday gen ve GWAS arasındaki farkla ilgili daha ayrıntılı bir karşılaştırma sağlar.
Özet – Aday Gen vs GWAS
Aday gen ve GWAS iki gen ilişkilendirme çalışmasıdır. Aday gen yaklaşımı, az sayıda önceden belirlenmiş gen içindeki hastalıkla ilişkili genetik varyasyona odaklanır. Buna karşılık, GWAS, tüm genom içindeki hastalıkla ilişkili genetik varyasyonu araştırır. Bu, aday gen ile GWAS arasındaki temel farktır. Her iki yöntem de hastalığa yatkınlığın genetik temelini anlamada önemlidir.
