DNA ve RNA izolasyonu arasındaki temel fark, DNA izolasyonunun biyolojik bir hücreden DNA adı verilen bir nükleik asit türünün ekstrakte edildiği bir prosedürken, RNA izolasyonu ise RNA adı verilen bir nükleik asit türünün çıkarıldığı bir prosedürdür. biyolojik bir hücreden çıkarılır.
Nükleik asit izolasyonu, çok çeşitli akış aşağı uygulamalarda başlangıç noktasıdır. Başlangıç numunelerindeki yüksek kaliteli nükleik asit, sonraki akış aşağı uygulamaların başarısı için önemli bir faktördür. Nükleik asit izolasyonu, farklı aşağı akış uygulama adımları için kullanılabilen bir saflık numunesinde nükleik asit elde etmek için bir dizi adım olarak tanımlanabilir. Nükleik asit ekstraksiyonunun amacı, hücre zarını parçalamak ve DNA veya RNA gibi saf nükleik asitler elde etmek için lipitlerin ve proteinlerin maksimum eliminasyonunu sağlamaktır.
DNA İzolasyonu Nedir?
DNA izolasyonu, biyolojik bir hücreden DNA adı verilen bir nükleik asit türünün ekstrakte edildiği rutin bir prosedürdür. DNA izolasyonu, kandan, donmuş doku örneklerinden ve parafin doku bloklarından DNA ekstraksiyonu yapılarak gerçekleştirilir. DNA izolasyonunda hücre lizizi, DNA ekstraksiyonu ve çökeltme dahil olmak üzere üç ana adım vardır. Hücre lizizinde, bir numunedeki hücreler, genellikle öğütme veya vorteksleme gibi fiziksel yollarla birbirinden ayrılır ve tuz içeren bir çözeltiye konur. Genellikle tuzdaki pozitif yüklü sodyum iyonları, DNA'nın omurgası boyunca uzanan negatif yüklü fosfat gruplarının korunmasına yardımcı olur. Daha sonra hücre zarı ve çekirdeğindeki lipidleri parçalamak için bir deterjan eklenir ve bu zarlar bozuldukça DNA'yı serbest bırakır.
Şekil 01: DNA İzolasyonu
DNA ekstraksiyonu, temiz bir DNA örneği elde etmek için gerçekleştirilir. Genellikle, DNA ile ilişkili proteinleri ve diğer hücresel proteinleri parçalamak için bir proteaz enzimi eklenir. Ayrıca, hücresel kalıntıların bir kısmı numuneyi süzerek uzaklaştırılabilir. Son olarak, DNA alkol kullanılarak çöktürülür. Ayrıca çok fazla DNA varsa işlem sonunda cimri beyaz bir çökelti görülebilir.
RNA İzolasyonu Nedir?
RNA izolasyonu, biyolojik bir hücreden RNA adı verilen bir nükleik asit türünün ekstrakte edildiği bir prosedürdür. Bu prosedür, genellikle RNA'yı bozan hücre ve dokularda ribonükleaz enzimlerinin varlığı ile karmaşık hale gelir. Moleküler biyolojide numunelerden RNA'yı izole etmek için guanidinyum-tiyosiyanat-fenol-kloroform ekstraksiyonu gibi çeşitli yöntemler kullanılır.
Şekil 02: RNA İzolasyonu
RNA izolasyonu genellikle hücre parçalanması ve homojenleştirilmesi, biyokimyasal süreçlerin söndürülmesi, nükleik asit bölünmesi, RNA alınması, ham saflaştırma ve RNA kalitesinin değerlendirilmesi dahil olmak üzere birkaç adımdan oluşur. Filtre kağıdı bazlı liziz ve elüsyon yöntemi, RNA ekstraksiyonunda yüksek verim kapasitesine sahiptir. Ayrıca sıvı nitrojen içinde havan ve tokmak kullanarak RNA ekstraksiyonu da ribonükleaz aktivitesini engellediği için çok faydalı bir yöntemdir.
DNA ve RNA İzolasyonu Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- DNA ve RNA izolasyonu iki tip nükleik asit izolasyon prosedürüdür.
- Her iki prosedür de hücre parçalama, ekstraksiyon ve saflaştırma gibi benzer temel adımlara sahiptir.
- Bu prosedürler, bir dizi aşağı akış uygulamasına sahip önemli nükleik asit türlerini izole eder.
- Laboratuvar kurulumlarında gerçekleştirilirler.
- Üretim kitleri kullanılarak yapılabilir.
DNA ve RNA İzolasyonu Arasındaki Fark Nedir?
DNA izolasyonunda biyolojik bir hücreden DNA adı verilen bir nükleik asit türü ekstrakte edilirken, RNA izolasyonunda biyolojik bir hücreden RNA adı verilen bir nükleik asit türü ekstrakte edilir. Dolayısıyla, bu DNA ve RNA izolasyonu arasındaki temel farktır. Ayrıca, DNA izolasyonu normalde pH 7 ila 8 civarında gerçekleştirilir, oysa RNA izolasyonu normalde pH 4.5 civarında gerçekleştirilir.
Aşağıdaki infografik, DNA ve RNA izolasyonu arasındaki farkları yan yana karşılaştırma için tablo halinde sunar.
Özet – DNA ve RNA İzolasyonu
DNA ve RNA izolasyonu iki tip nükleik asit izolasyon prosedürüdür. DNA izolasyonu, DNA'nın biyolojik bir hücreden ekstrakte edildiği bir prosedürdür. RNA izolasyonu, RNA'nın biyolojik bir hücreden ekstrakte edildiği bir prosedürdür. DNA ve RNA izolasyonu arasındaki temel fark budur.
