Transpozon ve Retrotranspozon
Transpozonlar ve retrotranspozonlar DNA'nın genetik bileşenleridir ve aralarında büyük farklar vardır. Bu genetik materyallerin yüzde mevcudiyeti türler arasında değişir ve işlevleri, mutasyonlar ve diğer fenotipik olarak önemli değişikliklerle organizmanın kaderini belirler. Transpozonlar ve retrotranspozonlar, DNA zincirlerinde bulunan belirli genlerin genleri veya koleksiyonlarıdır ve konumlarındaki değişiklikler bu sonuçların ana nedenleri olmuştur. Ancak bu makale, bu genlerin işlevlerini kısaca tartışmayı amaçlamaktadır ve transpozonlar ve retrotranspozonlar arasında bir karşılaştırma sunmaktadır.
Transpozon nedir?
Transpozonlar, DNA zincirinin yerini kes ve yapıştır mekanizması şeklinde değiştirme yeteneğine sahip ilginç DNA parçaları veya segmentleridir. Transpozonların bu hareketli doğası nedeniyle, bunlar atlama genleri olarak bilinir. Transpozonlar, Sınıf I Transpozonlar ve Sınıf II Transpozonlar olarak bilinen iki ana tiptedir. Genellikle, Sınıf II tipine transpozonlar, Sınıf I tipine ise retrotranspozonlar denir. Mobil DNA segmentlerinin kesilmesi ve yapıştırılması işlemleri enzim transpozazı tarafından düzenlenir. Enzim, transpozonun her iki ucuna bağlanır ve DNA zincirinin fosfodiester bağlarını keser, transpozonu izole eder, hedef bölgeye taşır ve yeni konuma bağlanır. Bununla birlikte, bazı transpozonlar sadece baz dizilerinin hedef bölge ile uyumsuzluğundan dolayı sadece belirli yerlere hareket edebildiğinden, bu işlemi anlamak ilginçtir. Tek bir ipliğin bir ucu diğer tek ipliğin diğer ucu ile aynı baz dizisine sahip olan genler, yapışkan kenarlı transpozonlardır, çünkü bunlar hedef DNA zincirinin bölgelerine yapışkan uçlardakiyle aynı baz dizilimi ile bağlanabilirler.. Ancak genlerin bu hareketliliği, organizmanın fenotipinde olduğu gibi genotipte de değişikliklere neden olabilir. Bilim adamları, transpozonlar hakkında icat ettiler ve tercih edilen kişiselleştirmelere göre genetiği değiştirilmiş gıdalar ve organizmalar daha sonra kullanıma sunuldu. Yüksek verimli tarımsal ürünler, tıbbi özelliklere sahip antibiyotikler, çiftlik hayvanları, 1940'larda Barbara McClintock tarafından transpozonların icadından sonra avantajlı olarak geliştirilen ürünlerden bazılarıydı.
Retrotranspozon nedir?
Retrotranspozonlar Sınıf I transpozonlardır ve bunlar kopyala ve yapıştır mekanizmasıyla genomda hareket eder. Retrotranspozonların hareketlilik mekanizması, DNA zincirinin gen bölümünün RNA'ya kopyalanması, RNA kopyasının hedef bölgeye aktarılması, RNA dizisinin ters transkriptaz kullanılarak tekrar DNA'ya transkripsiyonu ve insersiyon gibi birkaç ana adımı içerir. genin, genomun DNA zincirinin yeni konumuna. Bu retrotranspozonların iki ucu genellikle yaklaşık 1000 baz çifti ile uzun terminal tekrarlarına sahiptir ve bunlar bu genlerin tanımlama özellikleri olarak kullanılır. Bu genler genom içinde kolaylıkla amplifiye edilir ve insan genomundaki retrotranspozonların yüzdesi yaklaşık %50'dir. AIDS, HIV ve T hücreli lösemi virüsünün nedensel virüsü RNA genomlarında retrotranspozonlara sahip olduğundan bunlar oldukça tehlikeli olabilir. Aslında bu virüsler, retrotranspozonları ters transkriptaz ve integraz kullanarak insan DNA ipliklerinin herhangi bir yerine bağlayabilir. İntegraz enzimi, Sınıf II transpozonlarda transpozaz ile aynı şekilde çalışır.
Transpozon ve Retrotranspozon arasındaki fark nedir?
• Transpozonlar Sınıf II atlama genleridir, retrotranspozonlar ise Sınıf I kategorisine girer.
• Transpozonlar, transpozaz enzimi ile işlev görürken, retrotranspozonlar, ters transkriptaz ve integraz olarak bilinen iki ana enzimin kullanımıyla işlev görür.
• Terminal uçları, retrotranspozonlarda transpozonlardan çok daha uzundur.
• Transpozonlar orijinden kesilir ve hedefe yapıştırılır; tersine, retrotranspozonlar orijinden RNA'ya kopyalanır ve hedefe kopyalanır.
• Retrotranspozonların hareketi RNA'yı içerir ancak transpozonları içermez.
