Anahtar Fark – Plazmid ve Transpozon
Bakteriler kromozomal ve kromozomal olmayan DNA içerir. Kromozomal DNA, bakterilerin büyümesinde önemli bir rol oynar. Kromozomal olmayan DNA, bakterinin hayatta kalması için gerekli genleri kodlamaz. Bir plazmit, bir tür prokaryotik kromozomal olmayan DNA'dır. Bakterilere ek genetik avantajlar sağlayan küçük, dairesel çift sarmallı DNA'lardır. Transpozon, genom içinde yeni pozisyonlara hareket edebilen bir DNA dizisidir. Bakterilerin mobil genetik materyali olarak da bilinirler. temel fark plazmid ve transpozon arasında plazmid bakteri içinde bağımsız olarak çoğalan kromozomal olmayan bir DNA iken transpozon bakteri genomu içinde yer değiştiren ve kromozomun genetik dizisini değiştiren bir kromozomal DNA segmentidir.
Plazmit nedir?
Plazmid, prokaryotların kromozom dışı bir DNA'sıdır. Bakteri kromozomundan bağımsız olarak çoğalabilir. Bir bakterinin içinde birkaç plazmit bulunabilir. Plazmitler kapalı dairesel DNA parçalarıdır ve boyutları küçüktür. Plazmit DNA, bakterinin hayatta kalması için gerekli olmayan birkaç gen taşır. Ancak plazmitlerdeki bu genler bakterilere antibiyotik direnci, herbisit direnci, ağır metal toleransı vb. gibi ek genetik avantajlar sağlar. F faktör plazmitleri adı verilen özel plazmitler, cinsel bir üreme yöntemi olan bakteri konjugasyonunda görev alır.
Plazmitler, rekombinant DNA teknolojisinde ve gen klonlamada vektörler olarak kullanılır. Plazmitler, onları genetik mühendisliğinde rekombinant vektörler olarak kullanılmaya uygun kılan özel özelliklere sahiptir. Replikasyon orijini, seçilebilir işaretleyici genler, çift sarmallı doğa, küçük boyut ve çoklu klonlama bölgeleri içerirler. Araştırmacılar, plazmit DNA'yı kolayca açabilir ve rekombinant DNA yapmak için istenen DNA parçalarını veya genleri plazmitlere ekleyebilir. Ayrıca rekombinant plazmitin konak bakteriye dönüşümü diğer vektörlere göre daha kolaydır.
Şekil 01: Plazmitler
Transpozon nedir?
A transpozon, bakteri genomu içinde yer değiştirebilen bir DNA parçası veya dizisidir. Hareketli DNA dizileridir. Genomun yeni yerlerine taşınırlar. Bu hareketler, bakteri genomunun dizilişinde değişiklikler yaparak genetik bilgide önemli değişikliklere neden olur. Bakterilerde yeni genetik diziler oluşturmaktan sorumlu olan transpoze edilebilir genetik elementlerdir. Transpozonlar ilk olarak 1940'lı yıllarda Barbara McClintock tarafından mısırla yapılan deneyler sonucunda keşfedilmiş ve çalışmaları nedeniyle Nobel Ödülü'ne layık görülmüştür.
Transpozonlara bazen sıçrayan genler denir, çünkü bu atlama dizileri genlerin transkripsiyonunu bloke edebilir ve bakterinin genetik materyalini yeniden düzenleyebilir. İlaç direnci, antibiyotik direnç genlerinin plazmitler ve kromozomlar arasındaki hareketinden de sorumludurlar.
Taşımak ve yerleştirmek için kullandıkları mekanizmaya bağlı olarak iki tür transpozon vardır. Bunlar sınıf I transpozon (retrotranspozonlar) ve sınıf II transpozondur (DNA transpozonları). Sınıf I transpozonlar 'kopyala ve yapıştır' mekanizmasını kullanırken, sınıf II transpozonlar 'kes ve yapıştır mekanizması' kullanır.
Transpozon bir plazmitten kromozoma veya iki plazmit arasında hareket edebilir. Bu hareketler nedeniyle, genler bakteri türleri arasında karışır. Bu nedenle, transpozonlar genetik mühendisliğinde genetik dizileri kaldırmak ve organizmalara entegre etmek için vektörler olarak kullanılır.
Şekil 02: Bakteriyel bir DNA transpozonu
Plazmid ve Transpozon arasındaki fark nedir?
Plazmid ve Transpozon |
|
| Plazmid, bakterilerin küçük dairesel çift sarmallı kromozomal olmayan DNA'sıdır. | Transpozon, genom içinde yeni yerlere hareket edebilen bir DNA parçasıdır. |
| Kendi Kendini Çoğ altma | |
| Plazmitler kromozomal DNA'dan bağımsız olarak çoğalabilir. | Transpozonlar bağımsız olarak çoğalamazlar. |
| Özel Özellikler Kodlanmış | |
| Plazmitler, antibiyotik direnci ve virülans gibi çeşitli özellikler sağlar. | Transpozonlar özel özellikleri kodlamaz. |
| Vektör Olarak Kullan | |
| Plazmitler, genetik mühendisliğinde rekombinant DNA yapmak için vektörler olarak kullanılır. | Transpozonlar ayrıca genetik mühendisliğinde eklemeli mutajenez için vektörler olarak kullanılır. |
| Sıradaki Mutasyonlar ve Değişiklikler | |
| Plazmitler önemli mutasyonlara neden olamaz ve genom dizisini ve boyutunu değiştiremez. | Transpozisyon, önemli mutasyonlar yaratabilir ve genom dizisini ve boyutunu değiştirebilir. |
Özet – Plazmid ve Transpozon
Plazmid, bakterilerde yaygın olarak bulunan kromozom dışı bir DNA'dır. Bakteriyel kromozomal DNA'dan bağımsız olarak çoğalma yeteneğine sahiptir. Plazmitler, bakterilere genetik avantajlar ekleyen genler içerir. Bununla birlikte, plazmit DNA, bakterilerin hayatta kalması için gerekli değildir. Transpozonlar, genom içinde bir yerden yeni bir yere atlayan hareketli genetik elemanlardır. Mutasyonlara neden olabilir ve genomun boyutunu ve sırasını değiştirebilirler. Plazmid ve transpozon arasındaki fark budur.
