QTL ve GWAS arasındaki temel fark, analizde kullanılan dizilerin türüne bağlıdır. QTL, poligenik kalıtımla ilişkili fenotipik özellikleri analiz etmek için bağlantı gen lokuslarını kullanırken GWAS, belirli bir durumun tek nükleotid polimorfizmlerini analiz etmek için tüm genom dizilerini kullanır.
QTL haritaları ve GWAS, farklı özellikler için genetik analizlerde önemli bir rol oynamaktadır. Ayrıca etiyolojisi bilinmeyen çeşitli hastalık durumlarının analizinde önemlidirler. Ek olarak, sıralama her iki teknikte de önemli bir rol oynar. Bu teknikler, daha fazla doğruluk ve hassasiyet için diğer yüksek verimli tekniklerle birleştirilebilir.
QTL nedir?
QTL, Niceliksel Özellik Yeri anlamına gelir. Fenotipik bir özellikle ilişkili DNA bölgesidir. Genel olarak, bir QTL poligenik etkilere yol açar. QTL'lerin dağılımı değişir ve QTL'lerin sayısı, belirli bir fenotipik özelliğin varyasyon derecesini gösterir. Ayrıca, genellikle ayrık özellikleri değil, altında yatan sürekli özellikleri kodlarlar.
QTL bölgelerinin tanımlanması üzerine, belirli bir QTL alanının sıralanması önemlidir. Ayrıca, araştırma ve araştırmaları kolaylaştırmak için, ortak QTL bölgelerinin dizi verilerinin dizilenmesi ve saklanması biyoinformatiğin katılımıyla gerçekleşir. Bu tekniğe QTL eşleme diyoruz. Ardından, QTL bölge dizileriyle bir veritabanı oluşturulur.
Şekil 01: QTL Tarama
Ayrıca, QTL dizilerinin uygulamaları esas olarak dizi benzerliğinin belirlenebildiği BLAST aracına dayanır. Organizmalar arasındaki ilişkileri anlamada önemlidir. Ayrıca, belirli bir poligenik fenotipin karmaşıklığının belirlenmesinde önemlidir. Ayrıca belirli bir özelliğin evrimini de belirler.
Şu anda, QTL analizi, DNA mikrodizileri gibi diğer yüksek verimli tekniklerle birleştirilmiştir. Bu, fenotipin ifade analizinde önemlidir. QTL bölgeleri farklı türlerin birçok önemli özelliğinden sorumlu olduğundan, şu anda bilim adamları QTL veritabanını geliştirmekle çok ilgileniyorlar.
GWAS nedir?
GWAS, Genome Wide Association Study anlamına gelir. Aynı zamanda tüm genom ilişkilendirme çalışmalarına atıfta bulunur. Bu çalışmalar esas olarak gözlemsel çalışmalara odaklanmaktadır. Genellikle belirli bir özellik ile ilişkili farklı bireylerin genetik varyantlarını analiz eder. Ayrıca, tüm genom GWAS analizi için önemlidir.
Şekil 02: GWAS
GWAS, çeşitli hastalık koşullarıyla ilişkili tek nükleotid polimorfizmlerinin analizinde önemli bir araçtır. Bu aynı zamanda geniş bir popülasyonda farklı tek nükleotid polimorfizmlerinin karşılaştırmalı bir çalışmasıdır. Ayrıca GWAS'ın çalışma örneklemi çok yüksek; bu nedenle, kesitsel bir kohort çalışması biçimini de alır.
Ayrıca, ilk GWAS çalışması miyokard enfarktüsü ve miyokard enfarktüsü ile ilişkili genlerin analizi ile ilgili olarak yapılmıştır. Şu anda GWAS, etiyolojisi bilinmeyen karmaşık hastalıkların genetik arka planını belirlemede önemli bir rol oynamaktadır.
QTL ve GWAS Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Analiz için DNA dizileri verilerine güvenirler.
- Her ikisi de çeşitli karakterlerin genetik geçmişleriyle ilişkilidir.
- Ayrıca, sonuçları çıkarmak ve yorumlamak için biyoinformatik araçlara ihtiyaç duyarlar.
- Büyük popülasyonlar üzerinde yapılırlar.
QTL ve GWAS Arasındaki Fark Nedir?
QTL, bağlantılı gen lokuslarını kullanarak poligenik kalıtımla ilişkili fenotipik özellikleri analiz ederken GWAS, tüm genom dizilerini kullanarak belirli bir durumun tek nükleotid polimorfizmlerini analiz eder. Bu nedenle, QTL ve GWAS arasındaki temel fark budur. QTL haritalama, tüm genom dizilimini gerektirdiğinden, GWAS'a göre nispeten daha az karmaşık bir tekniktir.
Aşağıdaki infografik, QTL ve GWAS arasındaki farkı tablo şeklinde özetler.
Özet – QTL ve GWAS
QTL haritalaması ve GWAS, çeşitli fenotipik özelliklerin genetik arka planını belirlemede önemli bir rol oynar. Ayrıca farklı hastalıkların genetik arka planını analiz etmede yardımcı olurlar. QTL haritalaması, sürekli özelliklerden sorumlu bağlantı genlerini haritalandırır ve ayrıca poligenik kalıtım genlerinin haritalanmasını içerir. GWAS ise tek nükleotid polimorfizmleri için tüm genom analizi ile gerçekleşir. Ayrıca, bu daha büyük bir popülasyonda gerçekleşir. Bu nedenle, QTL ve GWAS arasındaki farkın özeti budur.
