Klonlama vektörü ile ekspresyon vektörü arasındaki temel fark, klonlama vektörünün konak hücreye yabancı bir DNA parçası taşıması ve ekspresyon vektörünün genlerin proteinlere ekspresyonunu kolaylaştırmasıdır.
Vektör moleküler biyolojide önemli bir terimdir. Rekombinant DNA teknolojisinde, bir vektörün ana rolü, bir konakçı hücreye eklenecek faydalı bir DNA fraksiyonuna bir taşıma modu sağlamaktır. Ayrıca, yabancı bir DNA fragmanını, eksprese edilmek veya çoğ altılmak üzere yapay olarak bir konakçı hücreye taşımak için kullanılan bir DNA molekülüdür. En çok kullanılan vektörler plazmitler, viral vektörler, kozmitler ve yapay kromozomlardır. Klonlama vektörü ve ifade vektörü, uygulamalarına göre sınıflandırılan iki tür vektördür.
Klonlama Vektörü Nedir?
Klonlama vektörü, yabancı bir DNA molekülü eklemek için kullanılabilen ve klonlama amacıyla bir konakçıya yerleştirilebilme özelliğine sahip olan bir DNA fraksiyonudur. Bir klonlama vektörünün ideal bir özelliği, kısıtlama enzimi tedavisi ve ligasyon enzimi tedavisi ile DNA fragmanının kolayca eklenmesi/çıkarılmasıdır. Bu açıdan, sıklıkla kullanılan klonlama vektörleri, genetiğiyle oynanmış plazmitlerdir.
Şekil 01: Vektör Klonlama
Bir klonlama vektörünün çoklu klonlama sitesi, seçilebilir bir işaretleyici geni ve bir raportör geni olmalıdır. Bir klonlama alanının amacı, klonlamanın gerçekleşmesi için bir yer sağlamaktır. Seçilebilir bir işaretleyici gen, klonlamadan sonra başarılı rekombinantların belirlenmesine yardımcı olur ve bir raportör gen, klonlamadan sonra rekombinantlar arasında doğru rekombinantın taranmasına ve tanımlanmasına izin verir. Klonlama vektörü, yabancı DNA'nın kodladığı bir proteini ifade etmeye mutlaka yardımcı olmaz. Böylece klonlama vektörünün tek amacı yabancı DNA'yı konakçıya taşımaktır.
İfade Vektörü nedir?
İfade yapısı olarak da adlandırılan ekspresyon vektörü, konak hücre içindeki proteinlerin ekspresyonu için kullanılan bir vektör türüdür. Herhangi bir vektör gibi, bu da bir çoklu klonlama bölgesi, bir işaretleyici gen ve bir haberci genin ana kısımlarını içermelidir. Vektör, konakçıya yeni bir gen sokar ve konakçının protein sentez mekanizmasını kullanarak genin konakçıya eksprese edilmesini sağlar. Ayrıca, başlangıçtaki odak noktası, kararlı m-RNA yapmak ve böylece proteinler yapmaktır. İyi bir örnek, insülinin ticari üretimidir. İnsülin geni bir bakteriyel plazmide verilir ve E. coli'ye geri eklenir.coli bakteri gövdesi, plazmitlerin çoğalmasına izin verir ve E. coli'nin büyümesine izin verir, toplanıp kullanılabilen insülin salgılar.
Şekil 02: İfade Vektörü
Ayrıca, bir ekspresyon vektörünün güçlü bir promotör bölgesi, doğru bir translasyon başlatma dizisi ve doğru bir sonlandırıcı kodon ve bir diziye sahip olması gerekir. Ekspresyon vektörleri, insülin, büyüme hormonu, antibiyotikler, aşılar, antikorlar üretmek gibi farmasötik endüstrisi için peptit ve protein üretiminde çok sayıda uygulamaya sahiptir. Ayrıca ekspresyon vektörleri, gıda ve giysi endüstrilerinde enzim üretimine yardımcı olur. Sadece bu değil, altın pirinç, böceklere dirençli bitkiler, herbisite dirençli bitkiler vb. gibi transgenik bitkilerin üretilmesinde ekspresyon vektörleri esastır.
Klonlama Vektörü ve İfade Vektörü Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Klonlama vektörü ve ekspresyon vektörü, rekombinant DNA teknolojisi ve genetik mühendisliğinde kullandığımız iki tür vektördür.
- Her ikisi de bir işaretleyici gen ve bir haberci gen içerir.
- Ayrıca, birden çok klonlama sitesinden oluşurlar.
- Ayrıca, bir çoğ altma kaynağına ve kendi kendini çoğ altma yeteneğine sahiptirler.
Klonlama Vektörü ile İfade Vektörü Arasındaki Fark Nedir?
Klonlama vektörü, yabancı bir DNA parçasını konakçı hücreye taşıyan küçük bir DNA molekülüdür, ekspresyon vektörü ise genlerin girişini, ekspresyonunu ve proteinlerin üretimini kolaylaştıran bir vektör türüdür. Bu, klonlama vektörü ile ifade vektörü arasındaki temel farktır. Ayrıca, klonlama vektörü ile ekspresyon vektörü arasındaki bir diğer önemli fark, bir klonlama vektörünün bir konakçıya yabancı bir DNA fragmanı sokması, ekspresyon vektörlerinin ise ilgili proteini üreterek eklenen geni eksprese etmesidir.
Ayrıca, klonlama vektörü bir replikasyon kaynağından, kısıtlama sitelerinden ve seçilebilir bir işaretçiden oluşur. İfade vektörü güçlendiriciler, promotör bölgesi, sonlandırma kodonu, transkripsiyon başlatma dizisi, bir replikasyon orijini, kısıtlama bölgeleri ve seçilebilir bir işaretleyici içerir. Bu nedenle, bu aynı zamanda klonlama vektörü ile ekspresyon vektörü arasındaki farktır. Ayrıca plazmitler, bakteriyofajlar, bakteriyel yapay kromozomlar, kozmidler, memeli yapay kromozomları, maya yapay kromozomu vb. klonlama vektörlerinin örnekleridir. Bu arada, ifade vektörleri çoğunlukla plazmitlerdir.
Özet – Vektör Klonlama ve İfade Vektörü
Moleküler biyolojideki işlevlerine göre, klonlama vektörü ve ekspresyon vektörü olmak üzere iki tür vektör vardır. Klonlama vektörü, yabancı DNA'yı konak hücreye ileten küçük bir DNA molekülüdür. Plazmitler, bakteriyofajlar, bakteriyel yapay kromozomlar, kozmidler ve memeli yapay kromozomları gibi farklı klonlama vektörleri vardır. Buna karşılık, bir ekspresyon vektörü, ilgili geni konak hücreye sokan ve protein ürününü elde etmek için gen ekspresyonunu kolaylaştıran bir plazmittir. Ekspresyon vektörleri plazmitlerdir. Bu nedenle, klonlama vektörü ile ifade vektörü arasındaki farkın özeti budur.
