Anahtar Farkı – Transkripsiyon ve Ters Transkripsiyon
Transkripsiyon ve çeviri, gen ekspresyonunda yer alan iki ana süreçtir. Fonksiyona ve kullanılan enzime göre iki farklı transkripsiyon türü olabilir. Bunlar transkripsiyon ve ters transkripsiyondur. Transkripsiyonda, bir DNA şablonu kullanılarak bir mRNA molekülü oluşturulur ve kullanılan enzim RNA polimerazdır. Çoğunlukla retrovirüsler tarafından kullanılan ters transkripsiyon, bir RNA şablonu kullanılarak tamamlayıcı bir DNA zincirinin (cDNA) oluşumunu içerir. Ters transkripsiyonda kullanılan enzim ters transkriptazdır. Bu, transkripsiyon ve ters transkripsiyon arasındaki temel farktır.
Transkripsiyon nedir?
Transkripsiyon, gen ifadesinin ilk adımı olarak kabul edilir. Bu süreç, bir genin DNA dizisini kopyalayarak bir mRNA molekülü yapımında yer alır. Gen ifadesinin nihai sonucu, işlevsel bir molekülün - bir proteinin - yapılmasıdır. Ökaryotlarda, çeviri süreci başlamadan önce, transkriptler farklı işlem adımlarından geçecektir. Transkripsiyonda kullanılan anahtar enzim RNA polimerazdır. Tamamlayıcı bir mRNA zincirini sentezlemek için tek sarmallı bir DNA şablonu kullanır. RNA polimeraz, 3' ucuna yeni nükleotidler ekleyerek 5' ila 3' yönünde çalışır.
Şekil 01: Transkripsiyon
Transkripsiyon 03 adımdan oluşan bir süreçtir: başlatma, uzama ve sonlandırma. Ökaryotik transkripsiyon, prokaryotik transkripsiyondan biraz daha ileri düzeydedir. Prokaryotik transkripsiyonun başlatma aşaması sırasında, RNA polimeraz, promotör olarak bilinen bir DNA dizisi olan genin özel bir bölgesine bağlanır. RNA polimeraz daha sonra çift sarmallı yapının iki tek sarmal halinde ayrılmasını kolaylaştırır, bu da transkripsiyon için tek sarmallı bir şablon sağlar. Uzama sırasında, RNA polimeraz, tamamlayıcı baz eşleşmesine göre nükleotidler ekleyerek, tek iplikli DNA'nın (şablon iplik) dizisini okur. Bu işlem 5'ten 3'e kadar gerçekleşir. Transkript, tek bir istisna dışında, timin yerine baz urasil varlığı ile DNA'nın kodlama zincirine benzer aynı genetik bilgiye sahip olacaktır. Gende bulunan bir sonlandırıcı dizi işlemi sonlandıracaktır. Transkript, RNA polimerazdan çıkarılacak ve doğrudan mRNA olarak hareket edecektir. Ökaryotik transkripsiyon, birincil transkript ön mRNA oluşturulduktan sonra birkaç farklı adım içerir. Ön mRNA zincirine bir 5' başlık ve bir 'poli A' kuyruğu eklenir. Ön mRNA ayrıca, kodlamayan bölgeleri (intronlar) ortadan kaldıran ve sonunda işlevsel bir proteini kodlayacak olan kodlama bölgelerini (eksonlar) tutan ekleme olarak bilinen bir süreçten geçer.
Ters Transkripsiyon Nedir?
Ters transkripsiyon, tamamlayıcı bir DNA'nın (cDNA) sentezinin bir RNA şablonundan gerçekleştiği bir işlemdir. Bu genellikle retrovirüslerde görülür, fakat aynı zamanda Hepatit B virüsü gibi retrovirüs olmayan bazılarında da görülür. Ters transkripsiyon, daha yaygın olarak ters transkriptaz olarak adlandırılan RNA'ya bağlı DNA polimerazın varlığı ile kolaylaştırılır. Retrovirüslerin ters transkriptazı, üç ardışık biyokimyasal aktiviteden oluşur: RNA'ya bağlı DNA polimeraz aktivitesi, ribonükleaz H aktivitesi ve DNA'ya bağlı DNA polimeraz aktivitesi. Üç ardışık süreç, tek iplikli RNA'nın çift iplikli bir cDNA'ya dönüştürülmesinde retrovirüsler tarafından kullanılır. Bu çift sarmallı cDNA, uzun vadeli etkilere neden olacak şekilde konakçı genomuna dahil edilebilir. Diğer DNA polimeraz türlerine benzer şekilde, ters transkriptaz, şablonlara ve primerlere bağlıdır. Ters transkriptazın ribonükleaz H aktivitesi, ilk DNA zinciri sentezlendikten sonra RNA zincirinin bozulmasını kolaylaştıracaktır. Daha sonra enzim, sentezlenen ipliği, çift zincirli DNA molekülünü oluşturan yeni bir iplik oluşturmak için şablon olarak kullanır. Ters transkriptaz 3' ila 5' ekzonükleolitik aktiviteye sahip olmadığından, ters transkripsiyon işlemi hataya açıktır.
Şekil 02: Ters Transkripsiyon
Transkripsiyon ve Ters Transkripsiyon Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Her ikisi de fonksiyonel bir gen ürününün üretilmesiyle sonuçlanan gen ekspresyonu sürecinde yer alır.
- Her iki işlem de enzim aracılıdır.
- Her iki işlem de ökaryotların çekirdeğinde ve prokaryotların sitoplazmasında gerçekleşir.
Transkripsiyon ve Ters Transkripsiyon Arasındaki Fark Nedir?
Transkripsiyon ve Ters Transkripsiyon |
|
| Transkripsiyon, bir DNA dizisindeki bilgilerin yeni bir haberci RNA (mRNA) molekülüne kopyalandığı süreçtir. | Ters transkripsiyon, retrovirüslerde bir RNA şablonundan cDNA'yı sentezleyen işlemdir. |
| İlgili Enzimler | |
| RNA polimeraz transkripsiyonda yer alır. | Ters transkriptaz, ters transkripsiyonda yer alır. |
| Son Ürün | |
| Transkripsiyonun son ürünü mRNA'dır. | Ters transkripsiyonun son ürünü tamamlayıcı DNA'dır. |
| İşlev | |
| Transkripsiyonun işlevi, proteinlere çevrilecek mRNA'yı sentezlemektir. | Ters transkripsiyonun işlevi tamamlayıcı DNA'yı sentezlemektir; bu işlem, DNA'nın kodlama dizilerini tanımlamak ve cDNA kitaplıkları hazırlamak için in vivo olarak kullanılır. |
Özet – Transkripsiyon ve Ters Transkripsiyon
Transkripsiyon ve ters transkripsiyon, gen ekspresyonunu kolaylaştıran iki işlemdir. Transkripsiyon, gen ekspresyonunun ilk aşamasıdır. Transkripsiyon sırasında, bir DNA şablonu kullanılarak bir mRNA molekülü oluşturulur. Bu sentezde yer alan enzim RNA polimerazdır. Ters transkripsiyon, retrovirüsler tarafından daha yaygın olarak kullanılan bir işlemdir. Bu işlem sırasında, bir RNA şablonu kullanılarak bir cDNA molekülü oluşturulur. Retrovirüsler, genlerini konakçı genomuna dahil etmek için bu mekanizmayı kullanır. Ters transkriptaz, bu işlemde kullanılan enzimlerdir. Bu, transkripsiyon ve ters transkripsiyon arasındaki farktır.
Transkripsiyonun PDF Versiyonunu İndirin ve Ters Transkripsiyon
Bu makalenin PDF sürümünü indirebilir ve alıntı notlarına göre çevrimdışı amaçlarla kullanabilirsiniz. Lütfen PDF sürümünü buradan indirin Transkripsiyon ve Ters Transkripsiyon Arasındaki Fark
