Anahtar Farkı – Genel ve Özel Transkripsiyon Faktörleri
Transkripsiyon faktörleri, mRNA'yı sentezlerken DNA şablon zinciri üzerinde hareket etmek için RNA polimeraz tarafından gereklidir. Farklı transkripsiyon faktörleri vardır. Bu transkripsiyon faktörleri, DNA zinciri ile bir kompleks oluşturur. Ya şablon ipliğin onayını değiştirirler ya da transkripsiyon adı verilen süreçte RNA polimeraz enziminin mRNA sentezine afinitesini arttırırlar. İki ana transkripsiyon faktörü türü vardır. Bunlar, Genel veya Bazal transkripsiyon faktörleri ve Spesifik Transkripsiyon faktörleridir. Genel transkripsiyon faktörleri, transkripsiyon işlemi sırasında başlangıç öncesi kompleksi oluşturmak için kullanılan faktörlerdir. Hemen hemen tüm ökaryotlarda bulunurlar ve prokaryotlarda daha az karmaşık bir kompleks oluştururlar. Spesifik transkripsiyon faktörleri, genel transkripsiyon sürecini aktive eden veya baskılayan spesifik DNA dizileri olan güçlendiriciler veya baskılayıcılardır. Bazı spesifik transkripsiyon faktörleri DNA dizisinin kendisini değiştirebilir. Genel transkripsiyon faktörleri ile spesifik transkripsiyon faktörleri arasındaki temel fark, işlevselliğe dayanmaktadır. Genel transkripsiyon faktörleri, transkripsiyon sürecinin bir ön-başlama kompleksinin oluşumunda yer alırken, spesifik transkripsiyon faktörleri, transkripsiyon sürecini aktive etmeye veya baskılamaya katılır.
Genel Transkripsiyon Faktörleri nelerdir?
Genel veya Bazal transkripsiyon faktörleri, transkripsiyon sırasında başlama kompleksinin oluşumunda rol oynayan faktörlerdir. Transkripsiyon işlemi için gereklidirler, dolayısıyla başarılı transkripsiyonda hayati bir rol oynarlar. Altı anahtar genel transkripsiyon faktörü vardır. Bunlar; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIE, TFIIF ve TFIIA. İnisiyasyon kompleksinin oluşumu sırasında farklı roller oynarlar.
- TFIID – Bu transkripsiyon faktörü (TF), promotör sekansının (TATA kutusu) tanınmasında rol oynar.
- TFIIB – Destekleyici /TFIID kompleksi, TFIIB tarafından tanınır. Bu, ana katalize edici enzim RNA polimerazın bağlanması için bir sinyal sağlar.
- TFIIF – Bu transkripsiyon faktörü RNA polimerazına bağlıdır. Böylece TFIIF, RNA polimerazı doğru konuma alarak sürece katılır.
- TFIIE ve TFIIH – Bu transkripsiyon faktörlerinin bağlanması, başlangıç öncesi oluşumunun sonunu işaretler Bunların bağlanması, başlangıç öncesi kompleksin oluşumunun verimliliğini artırır.
- TFIA, TFIID'nin TATA kutusuna bağlanmasını destekler.
Şekil 01: Genel Transkripsiyon Faktörleri
Yukarıda bahsedilen genel transkripsiyon faktörleri, mRNA zincirini uzatan RNA polimeraz türü olan RNA polimeraz II'ye özeldir. RNA polimeraz I ve III ile ilgili genel transkripsiyon faktörleri vardır. Genel transkripsiyon faktörleri de etki ettiği hücre tipine göre farklılık gösterebilir.
Belirli Transkripsiyon Faktörleri nelerdir?
Spesifik Transkripsiyon Faktörleri, DNA dizilerinde de yer alan bölgelerdir. Bunlar çoğunlukla ya güçlendirici ya da baskılayıcıdır. Spesifik transkripsiyon faktörleri, şablon DNA zincirinde transkripsiyona uğrayan spesifik cis etkili elementlerdir. Bu spesifik arttırıcıların ve baskılayıcıların aktivasyonu, DNA molekülünün oryantasyonunu değiştirerek veya sinyal bölgeleri olarak hareket ederek enzimin afinitesinin arttırılmasına katılır. DNA şablon zincirinde modifikasyonları indüklemek için spesifik transkripsiyon faktörleri de kullanılır. Bu modifikasyonlar esas olarak metilasyon gibi kovalent modifikasyonları içerir. Böylece, metillenmiş DNA bölgeleri, transkripsiyon sürecinin özel güçlendiricileri veya baskılayıcıları olarak işlev görür.
Şekil 02: Spesifik Transkripsiyon Faktörleri
Belirli Transkripsiyon faktörleri türlerin türüne bağlıdır ve tüm ökaryotlarda yaygın olarak bulunmaz. Bu transkripsiyon faktörleri, sinyal iletim yolları aracılığıyla farklı metabolik koşullar tarafından aktive edilir. Aktivasyon üzerine, genin ekspresyonunu transkripsiyonel düzeyde düzenlerler.
Genel ve Özel Transkripsiyon Faktörleri Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Transkripsiyon sürecinde her iki faktör de gereklidir.
- Her iki faktör de bir organizmanın gen ifadesini etkiler.
- Her iki faktör de transkripsiyon sürecinde RNA polimerazın işlevini düzenlemeye yardımcı olur.
- Her iki faktör de çoğunlukla ökaryotlarda bulunur.
Genel ve Özel Transkripsiyon Faktörleri Arasındaki Fark Nedir?
Genel ve Özel Transkripsiyon |
|
| Genel transkripsiyon faktörleri, transkripsiyon işlemi sırasında başlangıç öncesi kompleksi oluşturmak için kullanılan faktörlerdir. | Spesifik transkripsiyon faktörleri, genel transkripsiyon sürecini aktive eden veya baskılayan spesifik DNA dizileri olan güçlendiriciler veya baskılayıcılardır. |
| Molekül Türü | |
| Genel transkripsiyon faktörleri protein bazlıdır. | Spesifik transkripsiyon faktörleri nükleotid dizileridir. |
| Oluşturma | |
| Genel transkripsiyon faktörleri, transkripsiyon başlangıcı sırasında başlangıç öncesi kompleksi oluşturur. | Belirli transkripsiyon faktörleri, transkripsiyonun geliştiricileri veya baskılayıcıları olarak işlev görür. |
| Türler | |
| Altı ana tür vardır; Genel transkripsiyon faktörlerinin TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIF, TFIIE ve TFIIA'sı. | Spesifik transkripsiyon faktörleri temel olarak güçlendiriciler ve baskılayıcılar olarak kategorize edilir. |
Özet – Genel ve Özel Transkripsiyon Faktörleri
Transkripsiyon faktörleri, transkripsiyonel düzenleme için esastır ve sürecin artan verimliliği ve doğruluğu için gereklidir. Transkripsiyon faktörleri iki ana tiptir; Genel / Bazal ve Spesifik. Genel transkripsiyon faktörleri, transkripsiyon sırasında başlangıç öncesi kompleksin oluşumunda yer alırken, spesifik transkripsiyon faktörleri, DNA'nın kendisinde güçlendirici veya baskılayıcı olarak hareket eden bölgelerdir. Genel transkripsiyon faktörleri protein bazlıdır ve tüm ökaryotlar tarafından gereklidir. Çok çeşitli değildir ve tek tip moleküller olarak kalır. Spesifik bir transkripsiyon faktörü geniş ölçüde değişebilir ve bireylerin genetik yapısına bağlıdır. Bu, genel ve özel transkripsiyon faktörleri arasındaki farktır.
Genel ve Özel Transkripsiyon Faktörlerinin PDF Sürümünü İndirin
Bu makalenin PDF sürümünü indirebilir ve alıntı notuna göre çevrimdışı amaçlarla kullanabilirsiniz. Lütfen PDF sürümünü buradan indirin Genel ve Özel Transkripsiyon Faktörleri Arasındaki Fark
