Protomerler ve kapsomerler arasındaki temel fark, protomerlerin oligomerik proteinlerin yapısal birimleri olması, kapsomerlerin ise viral kapsidin yapısal alt birimleri olan protomerlerden oluşan ayrı proteinler olmasıdır.
Bir virüs, bulaşıcı bir parçacık olan hücre içi zorunlu bir parazittir. Kapsid, bir virüs partikülünün iki ana bileşeninden biridir. Viral genomu çevreleyen ve koruyan bir protein kaplamadır. Bir kapsid, oligomerik proteinlerin yapısal birimleri olan protomerlerden oluşur. Kapsomer, viral kapsidin yapısal bir alt birimidir ve bir birim olarak birkaç protomerin bir araya gelmesidir. Böylece, protomerler bir kapsomer oluşturmak için kendi kendine toplanır ve kapsomerler bir kapsid oluşturmak için kendi kendine toplanır.
Protomers nedir?
Protomers, oligomerik proteinlerin yapısal birimleridir. Protomer, en az iki farklı polipeptit zinciri içerir. Daha sıklıkla, birkaç polipeptit içerirler. Viral kapsidlerde, protomerler, kapsidlerin morfolojik birimleri olan kapsomerleri oluşturmak üzere kendiliğinden birleşirler. Protomers, belirli bağlar aracılığıyla birbirleriyle bağlantı kurar ve kendi kendine birleşir.
Şekil 01: Protomers
Tütün mozaik virüsünde, protomerler, RNA genomunu sarmak için iki katmanlı bir disk oluşturmak üzere toplanır. Böylece, tütün mozaik virüsünün bu protomerleri, sonunda, ona sarmal bir görünüm veren uzun, sert, içi boş bir tüp oluşturur. İkozahedral simetride, protomerler beş veya altı kapsomerden oluşan birimlerde toplanır ve daha sonra 20 eşkenar üçgen ve 20 tepede yoğunlaşır.
Kapsomer nedir?
Kapasomerler, viral kapsidin yapısal protein alt birimleridir. Ayrıca virüslerin morfolojik alt birimleridir. Yapısal olarak kapsid, bir kapsomerler topluluğudur. Her kapsomerin kendi kendine bir araya gelen birkaç protomeri vardır. Ayrıca kapsomerler, viral kapside bir şekil sağlamak için kapsit içinde farklı şekilde düzenlenir. Bu bağlamda, sarmal, ikosahedral ve kompleks, virüslerdeki üç tip kapsomer düzenlemesidir. Bununla birlikte, kapsomerlerin düzenlenmesi belirli bir virüsün karakteristiğidir. Kapsomerler, bir proteinin iki kopyası ve diğerinin bir kopyasından oluşan interkapsomerik tripleksler yoluyla birbirleriyle birleşirler.
Şekil 02: Kapsomerler
Ayrıca, her virüsün sınırlı sayıda kapsomeri vardır. Hepatit B virüsü, 180 kapsomer içeren bir ikosahedral kapside sahiptir. Rekombinant adenovirüs, 252 kapsomer içeren bir kapside sahiptir. Herpes virüslerinin kapsitlerinde 162 kapsomer bulunur. Ayrıca enterovirüsün kapsitinde 60 kapsomer vardır. Benzer şekilde, farklı virüslerin protein kabuklarında farklı sayıda kapsomer bulunur.
Kapasomerler virüslerde çeşitli işlevleri yerine getirir. Kapsomerler viral genomu fiziksel, kimyasal ve enzimatik hasarlardan korur. Ayrıca kapsomerler, konakçı hücre yüzeylerine kolayca adsorbe edilerek bir viral genomun konakçıya sokulmasında önemlidir.
Protomers ve Kapsomerler Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Protomers ve kapsomerler protein yapılarıdır.
- Protomers, kapsomerlerin alt birimleridir, kapsomerler ise viral kapsidin alt birimleridir.
- Hem protomerler hem de kapsomerler kendi kendine birleşebilir.
Protomers ve Kapsomerler Arasındaki Fark Nedir?
Protomers, oligomerik proteinler yapan yapısal birimlerdir, kapsomerler ise viral kapsidlerin morfolojik birimleridir. Bu, protomerler ve kapsomerler arasındaki temel farktır. Ayrıca, protomerler kapsomer oluşturmak için toplanırken kapsomerler kapsid oluşturmak için toplanır.
Aşağıdaki infografik, protomerler ve kapsomerler arasındaki farkı özetler.
Özet – Protomers vs Kapsomerler
Protomers, kapsomerlerin alt birimleridir, kapsomerler ise viral kapsidin protein alt birimleridir. Bu nedenle kapsomer, protomerlerin bir toplamı iken kapsid, kapsomerlerin bir toplamıdır. Protomerlerin düzenlenmesi veya kapsomerlerin düzenlenmesi, belirli bir virüse şekil veya simetri verir. Kapsomer düzenlemesine dayanarak, sarmal ve ikosahedral, virüslerde görülen iki şekil veya simetridir. Bu, protomerler ve kapsomerler arasındaki farkı özetler.
