Proteomik ve metabolomik arasındaki temel fark, proteomik bir organizmanın tüm proteinlerinin incelenmesidir, metabolomik ise bir organizmanın tüm metabolitlerinin incelenmesidir.
Genomik, bir organizmanın genetik yapısının incelenmesidir. Proteomik ve metabolomik, genomik ile ilgili iki omik bilimdir. Proteom, bir hücre veya organizmadaki tüm proteinleri ifade eder. Metabolom ise bir organizmanın tüm metabolitlerini ifade eder. Bu nedenle, proteom çalışması proteomik, metabolom çalışması ise metabolomiktir. Hem proteomik hem de metabolomik, hastalık teşhisinde ve organizmaların karakterizasyonu ve taranmasında önemlidir. Ayrıca, her ikisi de hücre biyolojisinin birçok yönü ile bağlantılıdır, özellikle hücre sinyalizasyonu, protein yıkımı ve üretimi ve translasyon sonrası modifikasyon.
Proteomik nedir?
Proteom, bir hücre, doku veya organizmadaki toplam protein tamamlayıcısıdır. Bu nedenle, proteomik, bir organizmanın proteomunun incelenmesidir. Proteomikte, proteinlerin farklı özellikleri analiz edilir. Bu nedenle, proteomik temel olarak proteinlerin yapısı, yönelimi, işlevleri, protein etkileşimleri, modifikasyonları, uygulamaları ve önemine odaklanır. Bu nedenle günümüzde proteomik alanında birçok araştırma projesi yürütülmektedir.
Escherichia coli'deki protein içeriğini belirlemek için ilk proteomik çalışmalar yapıldı. Toplam protein içeriğinin haritalanması, iki boyutlu (2D) jeller kullanılarak yapıldı. Bu projenin başarısından sonra bilim adamları, kobay ve fare gibi hayvanlardaki toplam protein içeriğini karakterize etmeye başladılar. Şu anda, insan protein haritalaması 2D jel elektroforezi kullanılarak yapılıyor.
Proteomik çalışmanın birçok avantajı vardır çünkü proteinler, proteinlerin katalizör özelliğinden dolayı çoğu aktiviteyi yöneten moleküllerdir. Böylece, bütün proteinlerin incelenmesi, bir organizmanın sağlık durumu hakkında bilgi sağlayabilir. Ayrıca, proteomik, genom açıklama, hastalık tanımlama ve teşhis, deney sırasında protein ekspresyon çalışmaları ve protein modifikasyonları ve etkileşim çalışmaları vb. birçok uygulamaya sahiptir.
Şekil 01: Proteomik
Proteomikte, toplam proteinin ekstraksiyonu, 2D jel elektroforezi kullanılarak ayrılması, ekstrakte edilen proteinlerin Edmund'un dizileme yöntemi veya kütle spektrometrisi gibi yöntemler kullanılarak dizilenmesi ve yapısal ve fonksiyonel analizler dahil olmak üzere farklı teknikler vardır. bilgisayar tabanlı yazılım ve biyoinformatik araçları kullanarak proteinin özellikleri.
Metabolomik nedir?
Metabolomik, bir hücre, doku veya organizmadaki tüm metabolitlerin incelenmesidir. Farklı gelişmiş analitik ve istatistiksel araçlar kullanarak hücresel metabolitlerin tanımlanmasını ve miktarını içerir. Metabolomik, bir organizmanın metabolizması ile ilgili bilgileri ortaya çıkardığı için önemli bir çalışmadır.
Şekil 02: Metabolomik
Metabolik reaksiyonların substratlarını ve ürünlerini incelemek için metabolomik, analitik bir platform olarak kütle spektrometrisini kullanır. Kütle spektrometrisi, hücrelerin veya dokuların gerçek biyokimyasal durumunu yansıtan metabolitler ve bunların konsantrasyonları ile sonuçlanır. Bu nedenle metabolomik, bir organizmanın moleküler fenotipinin en iyi temsili olarak düşünülebilir. Bunlara ek olarak, metabolomikler, proteomiklerin bir uzantısı olarak düşünülebilir, çünkü çoğu metabolit, protein olan enzimlerin aktiviteleri nedeniyle üretilir.
Proteomik ve Metabolomik Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Proteomik ve metabolomik, genomik ile ilgili iki omik bilimdir.
- Metabolomik, proteomiklerin bir uzantısı olarak düşünülebilir.
- Proteom ve metabolom birçok çalışma ile yakından iç içedir.
Proteomik ve Metabolomik Arasındaki Fark Nedir?
Proteomik, bir hücre veya organizma içindeki yapıları ve işlevleri dahil olmak üzere proteinlerin büyük ölçekli çalışmasıdır. Bu arada, metabolomik, belirli bir dizi koşul altında bir hücre, doku veya organizmadaki metabolit profillerinin incelenmesidir. Bu, proteomik ve metabolomik arasındaki temel farktır. Ayrıca, proteomik esas olarak proteinlerin tamamıyla ilgilidir, metabolomik ise esas olarak pep titler, karbonhidratlar, lipitler, nükleositler ve ekzojen bileşiklerin katabolik ürünleri gibi çeşitli küçük moleküller dizisi dahil olmak üzere tüm metabolitler kümesiyle ilgilidir. Bu nedenle, bu proteomik ve metabolomik arasındaki başka bir farktır.
Aşağıdaki infografik, proteomik ve metabolomik arasındaki farkı özetler.
Özet – Proteomik ve Metabolomik
Canlı organizmalar genomları, proteinleri ve metabolitleri kullanılarak incelenebilir. Genomik, proteomik ve metabolomik, sırasıyla bir hücrenin veya organizmanın genetik yapısını, proteinlerini ve metabolitlerini inceleyen üç alandır. Proteomik, hem genlerin hem de çevrenin dinamik bir yansıması olduğu için önemlidir. Metabolomik, hücrelerin biyokimyasal reaksiyonunun mevcut durumunu veya bir organizmanın metabolik durumunu doğrudan yansıttığı için çok önemlidir. Böylece, bu proteomik ve metabolomik arasındaki farkı özetler.
