Anahtar Fark – Metabolomik ve Metabonomik
Metabolitler, hücrelerde metabolik reaksiyonlarda yer alan küçük moleküllerdir. Metabolitler, metabolik ara ürünleri, hormonları, ikincil metabolitleri, sinyal moleküllerini vb. içerir. Bunlar, hücrelerin biyokimyasal reaksiyonlarının işleyen molekülleridir. Biyolojik bir numunenin veya tek bir organizmanın eksiksiz bir metabolit seti metabolom olarak bilinir. Metabolome, vücutta her saniye değişen dinamik bir koleksiyondur. Metabolomik ve metabonomik, bir organizmanın metabolomunun incelenmesiyle ilgili iki terimdir. temel fark metabolomik ve metabonomi arasında metabolomik, normal endojen metabolizma ve hücresel veya organ düzeyinde metabolik profil oluşturma ile daha fazla ilgilenirken, metabonomi, çevresel faktörler, hastalıklar, bağırsak nedeniyle metabolizma bozulmaları bilgisi ile metabolik profil oluşturmayı genişletmekle daha fazla ilgilenir. mikroorganizmalar ve metabolik profillemenin karşılaştırılması vb. Metabolomik temel olarak kütle spektrometrisi tarafından yönlendirilir ve metabonomik, metabolit analizi için NMR spektroskopisini kullanır.
Metabolomik nedir?
Metabolomik, hücrelerde, biyoakışkanlarda, dokularda veya organizmalarda meydana gelen metabolik süreçlerin incelenmesidir. İyi analitik ve istatistiksel araçlar kullanarak hücresel metabolitlerin tanımlanmasını ve miktarını içerir. Metabolomik, bir organizmanın metabolizması hakkında bilgi verdiği için önemli bir çalışma olarak kabul edilir.
Metabolik reaksiyonların substratlarını ve ürünlerini incelemek için metabolomik, analitik bir platform olarak kütle spektrometrisini kullanır. Kütle spektrometrisi, hücre veya dokuların gerçek biyokimyasal durumunu yansıtan metabolit türlerini ve bunların konsantrasyonlarını ortaya çıkarır. Bu nedenle, metabolomik, bir organizmanın moleküler fenotipinin en iyi temsilcisi olarak kabul edilebilir. Metabolomik, organizmaların küçük moleküllerinin bir omik teknolojisidir ve diğer omik çalışmalarla karşılaştırıldığında; Metabolomik, hücrelerin biyokimyasal reaksiyonunun mevcut durumunu doğrudan yansıttığı için çok önemlidir.
Metabolomik, aşağıdaki şekilde gösterildiği gibi protein olan enzimlerin aktiviteleri nedeniyle üretildikleri için proteomiklerin bir uzantısı olarak da düşünülebilir.
Şekil 01: Metabolomik şema
Metabonomik nedir?
Metabonomi, belirli zamanlarda patofizyolojik stresler veya genetik modifikasyonla ilgili olarak multiparametrik metabolik tepkilerin nicel bir ölçümü olarak tanımlanır. Bu genellikle insan beslenmesi ve ilaçlara veya hastalıklara verilen tepkiler hakkında yürütülen çalışmalara uygulanır. Bu yaklaşım, Londra'daki Imperial College'da Jeremy Nicholson tarafından öncülük edilmiştir ve toksikoloji, hastalık teşhisi, beslenme vb. gibi birçok alanda kullanılmıştır. Tarihsel olarak metabonomik, sistem biyolojisinin kapsamını çalışmalara uygulamak için ilk yöntemlerden biriydi. metabolizmanın.
Metabonomi, metabolomikteki tek tek metabolik bileşikleri tanımlamak yerine biyokimyasal profilleri karşılaştırmakla daha fazla ilgilenir. Bu nedenle metabonomik, metabolomiklerin bir alt kümesi olarak tanımlanabilir. Hastalıklar, çevresel stresler, genetik modifikasyon, beslenme, ilaçlar vb. ile ilgili olarak farklı popülasyonların metabolik profillerinin karşılaştırmasını esas olarak vurgular çünkü metabolitler hastalık koşullarını, ilaçların etkilerini, çevresel stresleri, toksinlere maruz kalmayı işaret eden iyi belirteçlerdir., vb.
Metabonomik çalışmalar hem hücre içi hem de hücre dışı metabolitleri ortaya çıkarır. Çok sayıda metaboliti aynı anda ve tekrar tekrar analiz etmek için yüksek verimli teknikler kullanır ve hücrelerin fizyolojik durumunun geçici olarak araştırılmasını sağlar. Ayrıca metabolitler ile organizmanın patolojik durumu arasındaki ilişkiyi de ortaya koyar. Yukarıdaki şekilde gösterildiği gibi birbirleriyle ilişkili olduklarından, metabonomik çalışmaları desteklemek için genomik ve proteomik kullanılabilir.
Metabolomik ve Metabonomik arasındaki fark nedir?
Metabolomik ve Metabonomik |
|
| Metabolomik, bir organizmanın tüm metabolitlerinin incelenmesidir | Metabonomi, canlı sistemlerin patofizyolojik uyaranlara veya genetik modifikasyona zamansal bazda multiparametrik metabolik tepkilerinin nicel çalışmasıdır. |
| Ana Sorun | |
| Metabolomik, daha çok metabolik profil oluşturma ve hücrelerde bulunan tek tek metabolitleri tanımlama ile ilgilenir. | Metabonomi daha çok genetik modifikasyonlar, hastalıklar, çevresel stresler, patolojik uyaranlar, ilaçlar vb. ile ilgili olarak popülasyonların metabolitlerini veya metabolik profillerini karşılaştırmakla ilgilenir. |
| Bilgi | |
| Metabolomik temel olarak endojen metabolizmaya odaklanır. | Metabonomi, endojen metabolizma ile sınırlı değildir. Diyet kalıpları, toksinler, hastalık süreçleri vb. gibi iç ve dış faktörlerin neden olduğu metabolizma bozuklukları hakkında bilgi bulmak için uzanır. |
| Analitik Araçlar | |
| Ana analitik platform olarak kütle spektrometrisini kullanır | Metabonomics, ana analitik platform olarak NMR spektroskopisini kullanır. |
Özet – Metabolomik ve Metabonomik
Metabolom, bir hücrede veya bir organizmada bulunan metabolitler adı verilen küçük moleküllerin tam setini temsil eder. Metabolomik, metabolik profili oluşturmak için tüm metabolomun incelenmesidir. Metabolomik bilim adamlarının hücrenin veya organizmanın gerçek fizyolojik durumunu ölçmesine olanak tanır. Metabonomik, canlı sistemlerin patofizyolojik uyaranlara ve genetik değişikliklere karşı multiparametrik metabolik tepkileri hakkında bilgi çıkarmaya uzanan metabolomiklerin bir parçasıdır. Metabonomik, yalnızca metabolomikler gibi bireysel metabolik profil oluşturma ile ilgili değildir; çevresel stresler, hastalıklar, toksinler vb. gibi diğer faktörlerle ilişkili olarak metabolik profilleri karşılaştırır. Hem metabolomik hem de metabonomik, hücrelerin gerçek fizyolojik durumunu ölçmek için organizmaların metabolitlerinin çalışmalarını içerir. Bu nedenle, bazen bu ikisi, metabolomik ve metabonomi arasındaki fark dikkate alınmadan eş anlamlı olarak kabul edilir.
