Hedefli ve hedeflenmemiş proteomik arasındaki temel fark, hedeflenen proteomiklerin belirli bir proteinin bolluğunu ölçmeyi amaçlarken hedeflenmemiş proteomiklerin belirli bir proteini hedeflememesidir.
Proteomik, proteinlerin, yapılarının ve işlevlerinin büyük ölçekli çalışmasıdır. Belirli koşullar altında bir hücre, doku veya organizmadaki tüm protein tamamlayıcısını inceler. Hedefli proteomik ve hedeflenmemiş proteomik olmak üzere iki tür proteomik vardır.
Hedefli Proteomik Nedir?
Adından da anlaşılacağı gibi, hedeflenen proteomik, analiz için karmaşık bir protein karışımındaki belirli bir proteini veya bir peptidi hedefler. Ardından, önceden seçilmiş spesifik proteinin varlığını ve miktarını analiz eder. Bu yöntem yalnızca bir numune için veya birden çok numune için mümkündür. Bu yöntem, belirli bir protein grubu için bile uygundur. Daha kesin, nicel ve hassas verilerle sonuçlanır. Ayrıca, hedeflenen proteomiklerle birleştirilmiş kütle spektrometrisi, daha doğru güvenilir ölçümler üretir. Bu yöntem, analizi için üçlü dört kutuplu kütle spektrometresi (QQQ) kullanır.
Şekil 01: Proteomik
Hedefli proteomik, bir devrilme hedefinin gerçekten devrildiğini doğrulamak istiyorsanız veya kan serumu, beyin sıvısı veya hücre lizatı vb. içindeki belirli bir protein/peptidi ölçmek istediğinizde uygun bir yöntemdir. belirli bir proteinin numuneler arasında veya bir zaman süreci deneyi sırasında farklı şekilde ifade edilip edilmediğini kontrol etmek istiyorsanız bunu kullanın.
Hedefsiz Proteomik Nedir?
Hedeflenmemiş proteomik, adından da anlaşılacağı gibi, analizi için belirli bir proteini veya peptidi hedeflemez. Keşif proteomikleri, Hedeflenmemiş proteomiklerin başka bir adıdır. Aslında, daha 'küresel' bir analizdir. Genel olarak, hedeflenmemiş proteomik yapmak, “bu örnekte veya birden fazla örnekte hangi protein veya proteinler var?” Sorusuna cevap vermektir. Bu yöntem, hedeflenen proteomikler kadar hassas değildir. Ancak yeni proteinler de dahil olmak üzere birçok proteini tanımlayabilir ve ölçebilir. Hedeflenmemiş proteomikler hem nicel hem de nitel ölçümler üretebilir.
Hedefli ve Hedefsiz Proteomik Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Hem hedeflenen hem de hedeflenmeyen proteomikler, numunelerdeki proteinleri ölçer.
- Proteom analizinde önemlidirler.
- Bu yöntemler kütle spektrometrisini kullanır.
Hedefli ve Hedefsiz Proteomik Arasındaki Fark Nedir?
İlk olarak, hedeflenen proteomik, karmaşık protein karışımında belirli bir protein veya peptidin varlığının ve miktarının belirlenmesidir. Buna karşılık, hedeflenmemiş proteomik, belirli bir proteini hedeflemeden bir numunede veya numunelerde bulunan proteinlerin nicel ve nitel çalışmasıdır. Hedefli proteomik, önceden seçilmiş veya hedeflenmiş proteinlerle yapılırken, hedeflenmemiş proteomik, bu numunedeki protein türlerini bulmak için yapılır. Ayrıca, hedeflenen proteomikler, hedeflenmemiş proteomiklerden daha hassastır.
Özet – Hedefli ve Hedefsiz Proteomikler
Özetlemek gerekirse, hedeflenen ve hedeflenmeyen proteomikler iki tür protein çalışmasıdır. Adlarından da anlaşılacağı gibi, hedeflenen proteomik belirli bir proteini hedeflerken, hedeflenmemiş proteomik belirli bir proteini hedeflemez. Bu, hedeflenen ve hedeflenmeyen proteomik arasındaki farktır.
