CRISPR ve CRISPR Cas9 arasındaki temel fark, CRISPR'nin (kümelenmiş düzenli aralıklarla kısa palindromik tekrar) doğal olarak oluşan bir prokaryotik bağışıklık savunma mekanizması olması, CRISPR cas9'un ise CRISPR adaptifinin bir parçası olan RNA güdümlü bir Cas9 nükleaz olmasıdır. bağışıklık sistemi.
CRISPR, bakteri ve arkelerde bulunan bir antiviral savunma bağışıklık sistemidir. Bakteri genomunda bulunan bir DNA dizisi ailesidir. Daha önce onları enfekte etmiş olan bakteriyofajların DNA parçalarından türetilen aralayıcı dizilerden oluşur. Daha sonraki viral enfeksiyonlarda, bakteriler bu dizileri viral DNA'yı yok etmek için kullanır. CRISPR dizileri kısa palindromik tekrarlara ve boşluk dizilerine sahiptir. Ayrıca, CRISPR tekrar aralayıcı dizileri genellikle Cas proteinlerini kodlayan ilişkili genlere sahiptir. Cas9, RNA güdümlü bir endonükleazdır. CRISPR dizileriyle birlikte Cas9 proteini, bakterilerde bakteriyofajlara karşı adaptif bir bağışıklık sistemi görevi görür.
CRISPR nedir?
CRISPR, Kümelenmiş Düzenli Aralıklı Kısa Palindromik Tekrarlar anlamına gelir. Bakteri genomunda bulunan bir DNA dizisi kümesidir. Bakterilerde doğal bir savunma mekanizması olarak çalışır ve ilk olarak E. coli'de tanımlanmıştır. Bakterilerde, özellikle bakteriyofajlara karşı adaptif bağışıklık koruması görevi görür. Bu nedenle, diziye özgü bir mekanizmadır.
Şekil 01: CRISPR
CRISPR sistemi birkaç kısa segmentli DNA tekrar dizisi içerir. Bu tekrarlar palindromiktir, 5' ila 3' arasında okurken aynı temel diziye sahipken, diğeri 3' ila 5' arasında okurken aynı diziyi verir. Ayrıca, tekrarlar aynıdır. Aynı olmayan kısa “aralayıcı” DNA dizileri arasında bulunurlar. Ancak bu aralayıcı DNA dizileri, yabancı bakteriyofaj DNA'sı ile benzer veya eşleşiyor. CRISPR ile ilişkili genler, CRISPR ile ilişkili genler veya Cas genleri olarak bilinir. Cas genleri, sarmallar veya nükleazlar olan Cas proteinlerini kodlar. Nükleazlar DNA'yı keserken sarmallar DNA'yı gevşetir. Genel olarak, CRISPR düşünüldüğünde, bakteriyofajlara (virüsleri enfekte eden bakteriler) karşı çalışan bir bakteri bağışıklık sistemidir.
CRISPR Cas9 nedir?
Cas9 veya CRISPR ile ilişkili protein 9, bakteriyel RNA yönlendirmeli bir endonükleazdır. Bu nedenle kılavuz RNA'ya tamamlayıcı hedef DNA'yı (özellikle bakteriyofaj DNA'sını) tanıyan ve kesen bir enzimdir. İpliğe özgü bölünme gerçekleştirir. Cas9 proteini, CRISPR ile ilişkili bir gen tarafından kodlanır. CRISPR cas9, genom düzenleme, transkripsiyonel pertürbasyon, epigenetik modülasyon ve genom görüntüleme için RNA ile programlanabilir bir DNA hedefleme ve düzenleme platformu olarak kullanılabilen RNA güdümlü CRISPR-Cas9 nükleaz sistemidir. Bu CRISPR cas9 sistemi, mevcut genom düzenleme sistemlerinde çok popülerdir.
Şekil 02: CRISPR Cas9
Şu anda, CRISPR/Cas9 sistemi, transkripsiyon baskılaması veya aktivasyon yoluyla memeli genomunu değiştirmek veya modifiye etmek için kullanılmaktadır. Memeli hücreleri, bir onarım mekanizması benimseyerek CRISPR/Cas9 aracılı DNA kırılmalarına yanıt verebilir. Homolog olmayan uç birleştirme yöntemi (NHEJ) veya homolojiye yönelik onarım (HDR) kullanılarak yapılabilir. Bu onarım mekanizmalarının her ikisi de çift sarmallı kırılmalar getirerek gerçekleşir. Bu, memeli gen düzenlemesiyle sonuçlanır. NHEJ, gen mutasyonlarının ablasyonuna yol açabilir ve fonksiyon kaybı yaratmak için kullanılabilir. HDR, belirli nokta mutasyonlarını tanıtmak veya değişen uzunluktaki DNA segmentlerini tanıtmak için kullanılabilir. Şu anda CRISPR/Cas sistemi terapötik, biyomedikal, tarım ve araştırma uygulamaları alanlarında kullanılmaktadır.
CRISPR ve CRISPR Cas9 Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Cas9, CRISPR Cas sisteminin bir parçasıdır.
- Crisper cas9 sistemi, bakterilerde doğal olarak bulunan bir bağışıklık sistemidir.
CRISPR ve CRISPR Cas9 Arasındaki Fark Nedir?
CRISPR, bakteriyofajlara karşı doğal bir savunma sistemi olarak çalışan bakteri genomunda bulunan bir DNA dizileri kümesidir. Düzenli aralıklı kısa palindromik tekrarlardan, aralayıcılardan ve ilişkili genlerden oluşur. Buna karşılık, cas9, RNA güdümlü bir endonükleaz enzimi olan CRISPR ile ilişkili bir protein 9'dur. DNA çift sarmal virüslerini tanır ve parçalar. Aslında, CRISPR savunma sisteminin bir parçasıdır. İşte CRISPR ve CRISPR cas9 arasındaki temel fark budur.
Özet – CRISPR ve CRISPR Cas9
CRISPR Cas sistemi bir mikrobiyal savunma sistemidir. CRISPR, palindromik kısa tekrarlar, aralayıcı diziler ve ilişkili genlerden oluşan bir DNA dizileri kümesidir. Cas9, RNA güdümlü bir endonükleaz olan bir Cas proteinidir. CRISPR ve Cas9 proteini, bakterilerde bakteriyofaj enfeksiyonlarına karşı çalışan bir bağışıklık sistemi oluşturur. Cas9 proteini, yabancı viral DNA'yı parçalayabilir ve onları bozabilir. CrRNA, cas9'u viral DNA'yı tanıması için yönlendirir. Dolayısıyla CRISPR cas9 sistemi, virüslere karşı bakterilerde bulunan doğal bir bağışıklık sistemidir. Bu nedenle, CRISPR ve CRISPR cas9 arasındaki farkın özeti budur.
