Asilasyon ve prenilasyon arasındaki temel fark, asilasyonun yağ asitlerinin proteinlere kovalent bağlanmasına atıfta bulunmasıdır, prenilasyon ise prenil gruplarının proteinlere kovalent bağlanmasına atıfta bulunur.
Translasyon sonrası modifikasyonlar, proteinlerin ilk sentezinden sonra gerçekleşen bir tür protein modifikasyonudur. Birkaç tür mekanizma vardır. Asilasyon ve prenilasyon, lipid gruplarının kovalent bağlanmasının, hem hücre içi hem de hücre dışı olarak membranlarla birleşmek için proteinleri değiştirdiği iki tiptir. Prenilasyonda, proteinlere farnesil veya geranilgeranil gibi prenil grupları eklenir. Asilasyonda, yağ asitleri proteinlere kovalent olarak bağlanır. Ökaryotik hücrelerde birçok proteinde asilasyon ve prenilasyon meydana gelir. Sonuç olarak, modifiye edilmiş proteinler, membran trafiği, protein salgılanması, sinyal iletimi ve apoptoz gibi sayısız biyolojik yolu düzenler.
Asilasyon nedir?
Asilasyon, yağ asitlerinin proteinlere kovalent bağlanmasıdır. Çeviri sonrası bir değişikliktir. Asilasyonda, bağlantı tipi ve yağ asidi türleri farklı olabilir. Buna dayanarak, N-terminal miristoilasyon (N-açilasyon) ve palmitoilasyon (S-açilasyon) olmak üzere iki asilasyon kategorisi vardır.
Şekil 01: Açilasyon
N-açilasyon veya N terminal miristoilasyon, 14 karbonlu doymuş bir yağ asidi olan miristatın bir amid bağlantısı yoluyla N terminal glisin tortusuna bağlanmasıdır. Bu geri dönüşü olmayan bir süreçtir. S-açilasyon veya palmitoilasyon ise uzun zincirli doymuş bir yağ asidi olan palmitik asidin bir tioester bağı yoluyla sistein kalıntısına kovalent bağlanmasıdır. Palmitoilasyon, geri dönüşümlü bir translasyon sonrası protein modifikasyonudur. Yağ asilasyonu, hücre içi trafiği, hücre altı lokalizasyonu, protein-protein ve protein-lipid etkileşimlerini düzenler.
Prenilasyon Nedir?
Prenilasyon, proteinlerin translasyon sonrası bir modifikasyonudur. Bir proteine hidrofobik bir grubun eklenmesini içerir. Genel olarak, ya bir farnesil ya da bir geranilgeranil parçası olmak üzere iki tip prenil grubu, hedef proteinin C-terminal sisteinine eklenir. Üç enzim, hücrelerde prenilasyonu katalize eder. Bunlar farnesil transferaz, Caax proteaz ve geranilgeranil transferazdır.
Şekil 02: Prenyl Grubu
Protein prenilasyonu, izoprenoidin bağlanmasından başlayarak, C-terminal prenile edilmiş sisteinin proteolizi ve metil esterifikasyonundan başlayarak üç adımda gerçekleşir. Prenilasyon, protein-protein etkileşimlerine ve protein-membran etkileşimlerine aracılık etmek için önemli bir süreçtir.
Asilasyon ve Prenilasyon Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Asilasyon ve prenilasyon, iki tür çeviri sonrası değişikliktir.
- Her iki işlem de proteinlerde hidrofobik modifikasyonlar yapar.
Asilasyon ve Prenilasyon Arasındaki Fark Nedir?
Asilasyon, sırasıyla amid bağı ve tiyoester bağı yoluyla miristat yağ asitlerinin N terminal glisin tortusuna ve palmitik asidin bir proteinin sistein tortusuna kovalent bağlanmasıdır. Prenilasyon, farnesil veya geranilgeranilin, bir tiyoeter bağı yoluyla spesifik proteinlerin karboksi terminalinde veya yakınında bir sisteine kovalent bağlanmasıdır. Asilasyon ve prenilasyon arasındaki temel fark budur.
Aşağıdaki infografik, asilasyon ve prenilasyon arasındaki daha fazla farkı tablo haline getiriyor.
Özet – Açilasyon ve Prenilasyon
Asilasyon ve prenilasyon, translasyon sonrası iki protein modifikasyonudur. Asilasyon, yağ asitlerinin proteinlere kovalent olarak bağlanmasıdır. Prenilasyon, proteinlere prenil gruplarının eklenmesidir. Hem yağ asitleri hem de prenil grupları, proteinlerin hidrofobik değiştiricileridir. Asilasyonda miristat ve palmitat, en yaygın yağ asidi değiştirici grupları temsil eder. Prenilasyonda, farnesil veya geranilgeranil grupları değiştiriciler olarak işlev görür. Yağ asilasyonu, hücre içi trafiği, hücre altı lokalizasyonu, protein-protein ve protein-lipid etkileşimlerini düzenler. Prenilasyon, protein-protein etkileşimlerine ve protein-membran etkileşimlerine aracılık etmek için önemli bir süreçtir. Bu, asilasyon ve prenilasyon arasındaki farkın özetidir.
