snRNA ve snoRNA arasındaki temel fark, snRNA'nın alternatif mRNA öncesi eklemeyi içermesi, snoRNA'nın ise rRNA ve tRNA'yı değiştirmeyi, mRNA düzenlemeyi ve genom baskılamayı içermesidir.
Küçük RNA, 200'den az nükleotitten oluşan polimerik RNA molekülleridir. Genellikle kodlayıcı değildirler. Sinyalleri taşımak için haberci RNA'lar arasında bulunurlar. Küçük RNA'lar, RNA'ya bağımlı RNA polimerazın etkisiyle üretilen mükemmel çift sarmallı RNA'dan kaynaklanır. Küçük RNA'lar hücre farklılaşması, büyümesi ve çoğalması, apoptoz, metabolizma, göç ve savunmada önemli bir rol oynar. Bu nedenle, küçük RNA'lar, gelişim ve fizyolojinin önemli ve kritik düzenleyicileridir. Küçük nükleer RNA ve küçük nükleolar RNA, küçük RNA moleküllerinin iki sınıfıdır.
snRNA nedir?
Küçük nükleer RNA veya snRNA, ökaryotik hücrelerin çekirdeğinde bulunan küçük RNA moleküllerinin bir sınıfıdır. Bir snRNA'nın ortalama uzunluğu yaklaşık 150 nükleotittir. RNA polimeraz II veya RNA polimeraz III, snRNA'yı kopyalar. snRNA'nın ana işlevi, çekirdekte ön haberci RNA'nın işlenmesidir. Ayrıca transkripsiyon faktörlerini veya RNA polimeraz II'yi düzenlemeye ve telomerleri korumaya yardımcı olurlar.
Şekil 01: Küçük RNA'nın Etki Mekanizması
Ortak dizi özelliklerine ve RNA bağlayıcı LSm proteini gibi ilişkili protein faktörlerine dayanan iki snRNA sınıfı vardır. İki sınıf, Sm sınıfı snRNA ve Lsm sınıfı snRNA'dır. Sm sınıfı snRNA, U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11 ve U12'nin yüksek üridin içeriğinden oluşur. RNA polimeraz II, SM sınıfı snRNA'yı kopyalar. Pre-snRNA'nın transkripsiyonundan sonra, genellikle çekirdekte bir 7-metilguanozin 5' başlığı alırlar. Daha sonra daha fazla işlem için nükleer gözenekler yoluyla sitoplazmaya ihraç edilirler. Lsm sınıfı snRNA, yüksek bir U6 ve U6atac üridin içeriğine sahiptir. RNA polimeraz III, Lsm sınıfı snRNA'yı kopyalar ve çekirdeği terk etmez. En yaygın insan snRNA bileşenleri U1 spliceosomal RNA, U2 spliceosomal RNA, U4 spliceosomal RNA, U5 spliceosomal RNA ve U6 spliceosomal RNA'dır.
snoRNA nedir?
Küçük nükleolar RNA veya snoRNA, ribozomal RNA, transfer RNA ve küçük nükleer RNA gibi diğer RNA'daki kimyasal modifikasyonlara rehberlik eden küçük RNA moleküllerinin bir sınıfıdır. Her snoRNA molekülü, modifikasyon işlemi sırasında RNA/protein kompleksindeki yaklaşık dört çekirdek protein ile ilişkilidir. SnoRNA, yaklaşık 10-20 nükleotid olan bir antisens elementi içerir. Bu bazlar, pre-RNA molekülündeki modifikasyonu hedefleyen nükleotidleri çevreleyen diziyi tamamlayıcı niteliktedir.
Şekil 02: Küçük Nükleolar RNA
SnoRNA'ların iki sınıfı vardır. Bunlar C/D kutusu snoRNA ve H/ACA kutusu snoRNA'dır. C/D kutusu snoRNA, metilasyon ile ilişkilidir ve H/ACA kutusu snoRNA, psödo-üridilasyon ile ilişkilidir. Her snoRNA molekülü, bir hedef RNA'da bir veya iki modifikasyon için bir kılavuz görevi görür. C/D kutusu snoRNA, sırasıyla snoRNA'nın 5' ve 3' uçlarına yakın iki kısa korunmuş dizi motifi C ve D içerir. 5 nükleotitten oluşan kısa bölgeler, C kutusunun yukarısında ve D kutusunun aşağısında yer alır ve bir gövde kutusu yapısı oluşturur. Bu, C ve D kutu motiflerini yakınlaştırır. Doğru snoRNA sentezi ve nükleolar lokalizasyon için kök kutu yapısı önemlidir. H/ACA kutusu snoRNA, iki saç tokası ve iki tek sarmallı bölgeden oluşan ikincil bir yapıya sahiptir. Bu genellikle firkete-menteşe-firkete-kuyruk yapısı olarak bilinir. H/ACA kutusu snoRNA ayrıca iki korunmuş motif H ve ACA'dan oluşur. Her ikisi de tek sarmallı bölgelerde bulunur. H kutusu menteşededir ve ACA kuyruk bölgesindedir. Dizinin 3' ucunu üç nükleotit oluşturur.
snRNA ve snoRNA Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- snRNA ve snoRNA küçük RNA'lardır.
- Her ikisi de ökaryotik hücrelerde bulunur.
- Her ikisi de kodlamayan RNA molekülleridir.
- Ayrıca, transkripsiyon işlemi sırasında RNA'nın değiştirilmesine katılırlar.
snRNA ve snoRNA arasındaki fark nedir?
snRNA, pre-mRNA'nın alternatif eklenmesine katılırken, snoRNA esas olarak RNA moleküllerini değiştirir. Dolayısıyla, bu snRNA ve snoRNA arasındaki temel farktır. Ayrıca, snRNA'lar yaklaşık 150 nükleotit uzunluğundadır ve genellikle küçük nükleer ribonükleoproteinler adı verilen bir grup protein ve kompleks ile bağlantılı olarak bulunur. snoRNA'lar yaklaşık 60-170 nükleotit uzunluğundadır ve esas olarak nükleolusta bulunur.
Ayrıca, snRNA'lar ya RNA polimeraz II ya da RNA polimeraz III tarafından kopyalanırken, snoRNA yalnızca RNA polimeraz II tarafından kopyalanır.
Aşağıdaki infografik, yan yana karşılaştırma için snRNA ve snoRNA arasındaki farkları tablo biçiminde sunar.
Özet – snRNA vs snoRNA
snRNA ve snoRNA, küçük RNA moleküllerinin sınıflarıdır. snRNA, mRNA öncesi alternatif eklemeye katılırken, snoRNA esas olarak RNA moleküllerini değiştirir. Dolayısıyla, bu snRNA ve snoRNA arasındaki temel farktır. Küçük RNA, uzunluğu 200'den az nükleotitten oluşan ve genellikle kodlamayan polimerik RNA molekülleridir. snRNA'lar ökaryotların çekirdeğinde bulunur. snoRNA'lar arke ve ökaryotlarda bulunur.snRNA'nın transkripsiyonu, RNA polimeraz II ve II aracılığıyla gerçekleşirken, snoRNA'nın transkripsiyonunda sadece RNA polimeraz II yer alır. Bu, snRNA ve snoRNA arasındaki farkı özetler.
