snRNA ve snRNP arasındaki temel fark, snRNA'ların küçük nükleer RNA molekülleri olması, snRNP'lerin veya küçük nükleer ribonükleoproteinlerin ise protein içeren küçük nükleer RNA molekülleridir.
snRNA'lar, ortalama 150 nükleotid boyutuna sahip, kodlama yapmayan, biyolojik olarak aktif küçük RNA molekülleridir. Genellikle doğal halde proteinlerle birlikte snRNP'ler olarak bulunurlar. Bu nedenle, snRNP'ler, birkaç snRNP'ye özgü protein içeren küçük nükleer RNA'lardır. snRNP'ler, ekleme vb. gibi çeviri sonrası RNA işleme olaylarına aracılık etme veya düzenlemede yer alır. Hem snRNA hem de snRNP, ökaryotik hücrelerin çekirdeğinde bulunur.
snRNA nedir?
snRNA, küçük nükleer RNA anlamına gelir. Ökaryotik hücrelerde hücre çekirdeğinin ekleme beneklerinde ve Cajal gövdelerinde bulunan küçük nükleer RNA molekülleridir. Bir snRNA molekülünün ortalama uzunluğu 150 nükleotittir. Bu snRNA'lar, pol II ve pol III tarafından kopyalanır. snRNA'nın ana işlevi, çekirdekte ön haberci RNA'nın (hnRNA) işlenmesidir. Esas olarak, ekleme gibi translasyon sonrası RNA işleme olaylarına aracılık etmek veya düzenlemekle ilgilenirler. snRNA'ların eylemi nedeniyle, intronların hassas hizalanması ve doğru şekilde kesilmesi gerçekleşir. Ayrıca snRNA'lar, transkripsiyon faktörlerinin (7SK RNA) veya RNA polimeraz II'nin (B2 RNA) düzenlenmesine ve telomerlerin korunmasına katılır.
Şekil 01: snRNA
snRNA'lar kodlamayan RNA'lardır. Çekirdekte lokalize edilmiş, yüksek oranda biyolojik olarak aktif RNA sınıfına aittirler. Her zaman protein molekülleri ile ilişkilidirler ve küçük nükleer ribonükleoproteinler (snRNP) olarak bulunurlar. Sm sınıfı snRNA ve Lsm sınıfı snRNA olmak üzere iki ana snRNA türü vardır. U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11 ve U12, Sm sınıfı snRNA'dır, U6 ve U6atac ise Lsm sınıfı snRNA'dır.
snRNP nedir?
snRNP, proteinlerle birleştirilmiş küçük bir nükleer RNA molekülüdür. Genel olarak, her bir snRNP, tek bir snRNA ve birçok protein molekülü içerir. Bu nedenle snRNP'ler küçük nükleer RNA molekülleri ve proteinleridir. snRNP'ler, diğer birçok ek proteinle birlikte, RNA eklenmesinin gerçekleştiği spliceosome adı verilen kompleksi oluşturur. snRNP'ler, intronları birleştirmek için hem RNA kısmına hem de protein kısmına ihtiyaç duyar. RNA bileşeni, enzimatik aktiviteye sahip olduğu için endonükleaz kesimlerinden sorumludur. Farklı snRNP türleri vardır ve bunlar farklı konumlarda kesilir.
Şekil 02: Spliceosome'da snRNP
Splays işlemine ek olarak, snRNP'ler mRNA'larda birincil transkriptlerin nükleer olgunlaşmasına, gen ekspresyon düzenlemesine, kanonik olmayan sistemlerde ekleme donörüne ve replikasyona bağlı histon mRNA'larının 3′-uç işlemesine katılır. Küçük nükleolar RNP'ler (snoRNP'ler) ve küçük Cajal gövdeli RNP'ler (scaRNP'ler) olmak üzere iki özel snRNP grubu vardır.
snRNA ve snRNP Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Hem snRNA hem de snRNP küçük nükleer RNA moleküllerine sahiptir.
- snRNA'lar, snRNP'ler yapmak için proteinlerle birleşir.
- Her snRNP tek bir snRNA içerir.
- Hem snRNA hem de snRNP ökaryotik hücrelerin çekirdeğinde bulunur.
snRNA ve snRNP Arasındaki Fark Nedir?
snRNA, ökaryotik hücre çekirdeği içinde lokalize olan, kodlamayan küçük bir RNA molekülüdür, snRNP ise tek bir snRNA ve snRNP'ye özgü proteinlerin bir kompleksidir. snRNPS, küçük nükleer ribonükleoprotein parçacıklarıdır. snRNA sadece küçük bir RNA molekülüdür, snRNP ise snRNA molekülü ve sıkıca bağlı proteinlerin bir kompleksidir. Bu, snRNA ve snRNP arasındaki temel farktır.
Aşağıdaki infografik, snRNA ve snRNP arasındaki farkları tablo şeklinde gösterir.
Özet – snRNA vs snRNP
snRNA, ökaryotik çekirdekte lokalize olan kodlamayan küçük nükleer RNA sınıfıdır. İntron ekleme ve diğer RNA işleme ile ilgili önemli işlevleri yerine getirirler. Doğal durumda, snRNA proteinlerle ilişkilidir ve küçük nükleer ribonükleoprotein parçacıkları (snRNP'ler) olarak bulunur.snRNP'ler, diğer birçok proteinle birlikte, RNA eklemesini gerçekleştirmek için spliceosome kompleksinin oluşumunda yer alır. Böylece, bu, snRNA ve snRNP arasındaki farkı özetler.
