Çoğ altıcı aktarım ile kes ve yapıştır aktarımı arasındaki temel fark, kopyalayıcı aktarımda aktarım yeni bir konuma kopyalanırken, kes ve yapıştır aktarımında aktarım yeni bir konuma taşınır.
Transposable elementler veya zıplayan genler, genom içindeki konumlarını değiştirebilen DNA dizileridir. Buna transpozisyon denir. Transpozisyon bazen mutasyonlar yaratabilir veya tersine çevirebilir ve hücrenin genetik kimliğini ve genom boyutunu değiştirebilir. Transpozisyon, 1983 yılında Barbara McClintock tarafından keşfedilmiştir. Transpozisyon, çoğ altma ve kes-yapıştır olmak üzere iki teknikle gerçekleşebilir.
Çoğ altma Aktarımı Nedir?
Replikatif transpozisyon, eksizyonun yerel konumdan diğerine çoğ altılmış veya çoğ altılmış teknikle aktarılmasına yardımcı olan bir aktarım mekanizması türüdür. Bu mekanizma ilk olarak 1979'da James A Shapiro tarafından bulunmuştur. Bu mekanizmada, transpoze edilebilir eleman, transpozisyon reaksiyonu sırasında kopyalanır, böylece transpoze edilen varlık orijinal elemanın bir kopyası olur. Ayrıca, bu mekanizmada, donör ve reseptör DNA dizileri, Shapiro ara maddesi (eşbütünleşme) adı verilen karakteristik bir ara "teta" konfigürasyonu oluşturur. Replikatif transpozisyon, karakteristik bir retrotranspozondur. Bu mekanizma normalde sınıf I transpozonlarında gerçekleşir.
Şekil 01: Replikatif Transpozisyon
İyi bir replikatif transpozisyon örneği, E. coli TN3 transpozonunda gözlemlenebilir. TN3 transpozonu, kopyalanmış veya kopyalanmış teknik yoluyla orijinal plazmitten başka bir hedef plazmide geçebilir. Tüm bu olaya transpozaz ve rezolvaz adı verilen iki önemli enzim aracılık eder. Ayrıca, hem DNA transpozonlarında hem de retropozonlarda replikatif transpozisyon gözlemlenebilir. En çok çalışılan transposable bakteriyel virüs bakteriyofaj Mu'dur.
Kes ve Yapıştır Aktarımı Nedir?
Kes ve yapıştır aktarımı, kes ve yapıştır tekniğiyle eksizyonun yerel konumdan diğerine aktarılmasına yardımcı olan bir aktarım mekanizması türüdür. Bu mekanizma aynı zamanda yer değiştirmenin muhafazakar modeli olarak da bilinir. Bu replikatif olmayan transpozisyonda, bir transpozonun bir genomik konumdan diğerine eksizyonu ve entegrasyonu, geride bir kopya bırakmadan gerçekleşir.
Şekil 02: Transpozisyonu Kes ve Yapıştır
Bu mekanizmada, transpozaz enzimi önce genellikle transpozonların her iki ucunda bulunan terminal tekrarlara bağlanır ve daha sonra sinaptik kompleks (transposozom) adı verilen bir yapı oluşturur. Sinaptik kompleks, transpozonu orijinal genomik konumundan ayırır ve onu yeni hedef konuma entegre eder. Bundan sonra, transpozazlar, transpozonun her iki ucundan ayrılır. Transpozaz enzimi transpozondan ayrıldığında, boşluklar konak polimeraz enzimi tarafından doldurulur. Bu, transpozonun yeni genomik konuma tam olarak bağlanmasına izin verir. Bu mekanizma normalde sınıf II transpozonlarda meydana gelir. Ayrıca, TN5 bakteriyel transpozonlar, konservatif veya kes ve yapıştır transpozisyon mekanizması gösteren iyi bilinen bir örnektir.
Çoğ altıcı Aktarım ile Kes ve Yapıştır Aktarımı Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Çoğ altıcı aktarma ve kes ve yapıştır aktarımı iki tür aktarma mekanizmasıdır.
- Her iki mekanizmada da, yer değiştirebilir elementler bir genomik konumdan başka bir yeni genomik konuma hareket eder.
- Her iki mekanizma da mutasyonlar yaratabilir veya bunları tersine çevirebilir ve hücrenin genetik kimliğini değiştirebilir.
- Bakteriyel transpozonlar her iki mekanizmayı da gösterir.
- Evrim için son derece önemli olaylardır.
Çoğ altıcı Aktarım ile Kes ve Yapıştır Aktarımı Arasındaki Fark Nedir?
Replikatif transpozisyon, transpozonun yeni bir konuma kopyalandığı bir transpozisyon mekanizması türüdür, kes ve yapıştır transpozisyonu ise transpozonun yeni bir konuma taşındığı bir tür transpozisyon mekanizmasıdır. Dolayısıyla, kopyalayıcı aktarım ile kes ve yapıştır aktarımı arasındaki temel fark budur. Ayrıca, kopyalayıcı transpozisyon normal olarak sınıf I transpozonlarında meydana gelirken, kes ve yapıştır transpozisyonu normal olarak sınıf II transpozonlarında meydana gelir.
Aşağıdaki infografik, replikatif aktarım ile kes ve yapıştır aktarımı arasındaki farkları yan yana karşılaştırma için tablo biçiminde sunar.
Özet – Çoğ altma Aktarımı ve Kes ve Yapıştır Aktarımı
Çoğ altıcı aktarma ve kes ve yapıştır aktarımı iki tür aktarma mekanizmasıdır. Replikatif transpozisyon, transpozonun yeni bir yere kopyalandığı bir transpozisyon mekanizması türüdür, kes ve yapıştır transpozisyonu ise transpozonun yeni bir yere taşındığı bir tür transpozisyon mekanizmasıdır. Bu, kopyalayıcı aktarım ile kes ve yapıştır aktarımı arasındaki farkı özetler.
