Agaroz ve Poliakrilamid
Agaroz ve Poliakrilamidin ikisi de suda çözünür polimerlerdir, ancak aralarında kökenlerinden başlayarak birçok farklılık görülebilir. Hem Agaroz hem de Poliakrilamid, gözenekli jel matrisleri oluşturma yeteneklerinde ortak bir şeye sahiptir. Buna rağmen, ikisi arasında bir takım belirgin farklılıklar vardır. Bu polimerlerin her ikisi arasındaki en büyük farklar, kökenlerinin doğasında, kimyasal yapılarında, farklı kullanımlarında ve jel elektroforezi açısından performanslarında yatmaktadır.
Agaroz nedir?
Agaroz, deniz yosununda bulunan agar adı verilen karmaşık bir polimerden türetilen, doğal olarak oluşan doğrusal bir polimerdir. Agaroz, agaropektin adı verilen protein bileşeninin çıkarılmasıyla agardan ekstrakte edilir. Agaroz, agar'a jel oluşturma yeteneğini veren şeydir.
Agarozun başlıca kullanımı mikrobiyolojik ve moleküler biyolojik çalışmalardadır. Mikrobiyolojik çalışmalarda agaroz, uygun besinlerle desteklendiğinde bakteri ve mantar gibi mikroorganizmaların yetiştirilmesi için sağlam bir temel sağlar. Yarı katı konsantrasyonlarda kullanıldığında, bu mikroorganizmaların hareketliliğinin değerlendirilmesinde faydalı olabilir. Moleküler biyolojide, 'jel elektroforezi' veya 'agaroz jel elektroforezi' (AGE) olarak adlandırılan en temel çözünürlük süreçlerinden biri için önemli bir araç olarak hizmet eder. Jel elektroforezi, boyutlarına ve yüklerine göre nükleik asitlerin veya proteinlerin çözülmesine veya ayrılmasına izin veren bir işlemdir. Burada agaroz, ayırmanın gerçekleştiği gözenekli elek benzeri bir jel görevi görür.
Agaroz Yapı
Poliakrilamid nedir?
Poliakrilamid sentetik bir polimerdir ve çok çeşitli endüstrilerde kullanılır. Daha önce belirtildiği gibi, kullanımı jel oluşturma yeteneğine bağlıdır. Ancak buna ek olarak, farklı konsantrasyonlarda suyu tutma ve tahliye etme yeteneği de çeşitli endüstrilerde kullanılmaktadır.
Poliakrilamidin en yaygın ve yaygın kullanımı atık su arıtımındadır. Burada, herhangi bir askıdaki organik materyali çıkarmak için bir topaklaştırıcı ajan olarak kullanılır; dolayısıyla bulanıklığı iyileştirir ve suyu berraklaştırır. Poliakrilamidin diğer bir kullanımı kağıt endüstrisindedir. Burada, gerektiği gibi kağıt hamurundan suyu tutmak veya boş altmak için kullanılır. Benzer şekilde tarım ve inşaat sektörlerinde de toprak erozyonunu önlemek ve kalitesini artırmak için toprak düzenleyici olarak kullanılmaktadır.
Agaroz gibi, poliakrilamid de moleküler biyolojide "Poliakrilamid jel elektroforezi" (PAGE) adı verilen benzer bir süreçte önemli bir çözümleme aracı olarak kullanılır. Tüm bunlara ek olarak, Poliakrilamid, cevher işlemede ve askıda kalmış herhangi bir organik materyali çıkarmak için topaklaştırıcı madde üretiminde de kullanılır; dolayısıyla bulanıklığı iyileştirir ve suyu berraklaştırır. Poliakrilamidin diğer bir kullanımı kağıt endüstrisindedir. Burada, gerektiği gibi kağıt hamurundan suyu tutmak veya boş altmak için kullanılır. Benzer şekilde tarım ve inşaat sektörlerinde de toprak erozyonunu önlemek ve kalitesini artırmak için toprak düzenleyici olarak kullanılmaktadır. Tüm bunlara ek olarak, Poliakrilamid, gıda katkı maddeleri, yumuşak kontakt lensler ve tekstil üretiminde de kullanılmaktadır.
Poliakrilamid Yapı
Agaroz ve Poliakrilamid arasındaki fark nedir?
Agaroz ve Poliakrilamidin Kökeni:
Agaroz: Agaroz, doğal kökenli bir polimerdir. Deniz yosunundan elde edilir.
Poliakrilamid: Poliakrilamid sentetik kökenlidir ve hiçbir doğal durumda bulunmaz.
Agaroz ve Poliakrilamidin Moleküler Formülü:
Agaroz: Agarozun moleküler formülü şudur: C24H38O19.
Poliakrilamid: Poliakrilamidin moleküler formülü (C 3H5NO)n.
Agaroz ve Poliakrilamidin Kimyasal Yapısı:
Agaroz: Agaroz doğrusal bir polisakkarittir. Hidrojen bağlarıyla bir arada tutulan agrobiyoz adı verilen tekrarlayan disakkarit birimlerinden oluşur.
Poliakrilamid: Poliakrilamid, kimyasal olarak çapraz bağlı bir polimerdir. Akrilamid monomerlerinden ve çapraz bağlama maddesi N, N'-metilenbisakrilamidden oluşur.
Agaroz ve Poliakrilamidin Toksisitesi:
Agaroz: Hem agaroz hem de monomer birimi agrobiyoz doğada toksik değildir.
Poliakrilamid: Poliakrilamidin monomer birimi olan akrilamid, tahmin edilen bir kanserojendir ve bilinen bir nörotoksindir, polimerize şekli ise doğada toksik değildir.
Agaroz ve Poliakrilamid Jellerin Özellikleri:
YAŞ ve SAYFA:
Agaroz: AGE için agaroz jel hazırlama daha az zaman alır, kolay ve basittir ve bir başlatıcı veya polimerleştirici katalizör gerektirmez.
Poliakrilamid: PAGE için poliakrilamid jel hazırlama zaman alıcı ve sıkıcıdır ve ayrıca bir başlatıcı (amonyum persülfat) ve polimerleştirici katalizör (N, N, N', N'-tetrametiletilendiamin – TEMED) gerektirir.
Doğa:
Poliakrilamid jeller, agaroz jellerden kimyasal olarak daha stabildir.
Gözenek Boyutu:
Aynı konsantrasyon göz önüne alındığında, poliakrilamid jel matrisleri, agaroz jel matrisine kıyasla daha küçük gözenek boyutlarına sahip olma eğilimindedir.
Gözenek Boyutunu Değiştirme:
Poliakrilamid jellerin gözenek boyutu, agaroz jellerinkinden daha kontrollü bir şekilde değiştirilebilir.
Çözümleme Gücü:
Poliakrilamid jeller yüksek çözme gücüne sahipken, agaroz jeller düşük çözme gücüne sahiptir.
Nükleik Asit Yerleştirme:
Poliakrilamid jeller, çözünürlük araçları için agaroz jellerden daha büyük miktarlarda nükleik asit barındırabilir.