VNTR ve prob arasındaki temel fark, VNTR'nin genomda tandem tekrarı olarak meydana gelen kısa bir nükleotid dizisi, prob ise yapay olarak sentezlenmiş, radyoaktif olarak etiketlenebilen bir DNA veya RNA kısa dizisidir.
VNTR, değişken sayı tandem tekrarı anlamına gelir. Genomda ardışık tekrarlarda düzenlenen kısa bir nükleotid dizisidir. VNTR'ler genomumuzda doğal olarak oluşur. Bir prob, yapay olarak sentezlenmiş bir kısa DNA veya RNA dizisidir. Hem prob hem de VNTR, nükleik asitler veya kısa nükleotid dizileridir. Farklı moleküler biyolojik tekniklerde, özellikle adli tıp çalışmalarında çok büyük kullanımları vardır. VNTR ve prob, farklılıkların yanı sıra bazı benzerlikleri de paylaşır. Bu nedenle, makale VNTR ve sonda arasındaki farkı vurgulamaya çalışır.
VNTR nedir?
VNTR, genomumuzda tandem tekrarı olarak var olan kısa bir nükleotid dizisidir. VNTR'ler birçok kromozomda bulunur. Ayrıca, farklı kişilerin VNTR'lerinde tekrar sayısı farklı olduğundan, VNTR'ler farklı bireyler arasında uzunluklardan farklıdır. Temel olarak, ebeveynlerinden miras kalan alellerden kaynaklanmaktadır. Bu nedenle, VNTR'leri esas olarak ebeveyn kimlikleri (miras) veya kişisel amaçlar için kullanırız. Benzer şekilde genetik, adli tıp, biyolojik araştırma ve DNA parmak izinde de kullanmak mümkündür. Bu nedenle VNTR moleküler biyolojide önemli bir araçtır.
Şekil 01: VNTR
Kalıtımda, iki temel ilkeyi kullanarak VNTR verilerini analiz ederiz: miras eşleştirme ve kimlik eşleştirme. Kalıtım eşleştirmesi sırasında, bireyin her ebeveyninkiyle eşleşen bir alele sahip olması gerekir. Kimlik eşleştirme sırasında, her iki VNTR aleli de genomun belirli bir yerinde bulunmalıdır.
Sonda nedir?
Moleküler biyoloji bağlamında, bir sonda, 100 ila 1000 baz uzunluğunda yapay olarak sentezlenmiş bir DNA veya RNA parçasıdır. Bu sondaları radyoaktif olarak etiketleyebiliriz. Bu nedenle, bunları, prob dizisine tamamlayıcı olan hedef nükleotid dizilerini saptamada kullanırız. Numuneye prob eklediğimizde, tamamlayıcı diziler veya hedef diziler ile hibridizasyon gerçekleşir ve hedef dizileri tanımlamamızı kolaylaştırır. Problar radyoaktivite taşıdıkları için onları kolayca tespit edebiliriz.
Şekil 02: Sonda
Adli bilimde, kısa tandem tekrar bölgelerinin tespiti, kısıtlama parçası uzunluk polimorfizmleri ve DNA parmak izi gibi DNA profilleme tekniklerinde yaygın olarak problar kullanırız.
VNTR ve Probe Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Nükleik asitler, VNTR ve Probe'un yapı taşlarıdır.
- Onları gen tanımlama işlemlerinde kullanıyoruz.
- Ayrıca her ikisinin de uzunluğu değişkendir.
- Adli tıp çalışmaları, DNA parmak izi, genetik vb. için önemli araçlardır.
VNTR ve Prob Arasındaki Fark Nedir?
VNTR, bir prob, bir numunedeki hedef dizileri tespit etmek için yapay olarak sentezlenen kısa bir DNA veya RNA dizisi iken tandem tekrarlar olarak organize edilen genom bölgesidir. Bu, VNTR ve prob arasındaki temel farktır. Ayrıca, VNTR ve sonda arasındaki önemli bir fark, VNTR'lerin aksine, sondaları radyoaktif olarak etiketleyebilmemizdir.
Ayrıca, VNTR'ler çoğunlukla ebeveyn tanımlamalarını gerçekleştirirken, problar, DNA veya RNA örneklerinde, probun dizisine tamamlayıcı olan hedef nükleotit dizilerini tespit etmeye yardımcı olur. Dolayısıyla, bu aynı zamanda VNTR ve prob arasında önemli bir farktır.
Aşağıdaki infografik, VNTR ve prob arasındaki fark hakkında daha fazla bilgi sunar.
Özet – VNTR ve Probe
VNTR ve probun yaygın kullanımı, adli tıp çalışmaları ve DNA parmak izi gibi moleküler analiz tekniklerindedir. Her ikisi de değişken uzunluklardan oluşur. Bununla birlikte, VNTR ve prob arasındaki temel fark, bir VNTR'nin tandem tekrarlarla düzenlenmiş bir genom bölgesi olması ve bir probun radyoaktif olarak etiketlenebilen bir DNA veya RNA fragmanı olmasıdır. Ayrıca, VNTR'ler genomda bulunur. Ancak, problar yapay olarak sentezlenir ve DNA veya RNA örneklerindeki hedef nükleotid dizilerini saptamak için radyoaktif olarak etiketlenebilir ve probdaki diziye tamamlayıcıdır. Böylece, VNTR ve prob arasındaki farkın özeti budur.
