Anahtar Farkı – VNTR ve STR
DNA çalışmaları, filogenetik ilişkileri anlamada ve belirlemede, genetik hastalıkları teşhis etmede ve organizmanın genomlarını haritalamada büyük fayda sağlar. Bilinmeyen bir DNA havuzunda belirli bir genin veya bir DNA dizisinin tanımlanması için DNA analizi ile ilgili çeşitli teknikler kullanılır. Genetik belirteçler olarak bilinirler. Genetik belirteçler, bireyler ve türler arasındaki genetik varyasyonu tanımlamak için moleküler biyolojide kullanılır. Değişken sayı tandem tekrarı (VNTR) ve kısa tandem tekrarı (STR), bireyler arasında polimorfizm gösteren iki tip genetik belirteçtir. Her iki tip de tandem tekrarlar olan kodlamayan tekrarlayan DNA'dır. Kromozomlarda baştan kuyruğa şeklinde düzenlenirler. VNTR, genomun kısa nükleotid dizisinin birkaç kez tekrarlandığı bir bölümüdür. STR, genom içinde iki ila on üç nükleotitten oluşan tekrarlayan birimler olarak yüzlerce kez düzenlenen DNA'nın başka bir bölümüdür. VNTR ve STR arasındaki temel fark, tekrar eden bir dizideki nükleotid sayısıdır. VNTR'nin tekrar eden birimleri 10 ila 100 nükleotitten oluşurken, STR'nin tekrarlayan birimleri 2 ila 13 nükleotitten oluşur. VNTR ve STR adli tıp çalışmalarında yaygın olarak kullanılmaktadır.
VNTR nedir?
tandem tekrarı, belirli bir kromozomal lokusta baştan sona tekrarlanan kısa bir DNA dizisidir. Tandem tekrarında başka bir dizi veya nükleotit yoktur. Genomda birkaç tür tandem tekrarı vardır. VNTR, aralarında 10 ila 100 nükleotitten oluşan tekrarlayan birimlere sahip bir tandem tekrar türüdür. VNTR bir mini uydu türüdür. Bu tandem tekrarları birçok kromozomda bulunabilir. İnsan genomu içinde serpiştirilirler ve ağırlıklı olarak kromozomların subtelomerik bölgelerinde bulunurlar.
VNTR'ler, bireyler arasında tandem tekrar polimorfizmi gösterir. Kromozomun belirli bir yerindeki VNTR'nin uzunluğu, o DNA bölümünde düzenlenen tekrar eden birimlerin sayısındaki çeşitlilik nedeniyle bireyler arasında oldukça değişkendir. Bu nedenle VNTR, bireylerin tanımlanmasında güçlü bir araç olarak kullanılabilir ve VNTR analizi, genetik, biyoloji araştırmaları, adli tıp ve DNA parmak izi gibi birçok alanda kullanılmaktadır. VNTR'ler, kemik iliği transplantasyonunu ölçmek için kullanılan ilk genetik belirteçlerdi. VNTR'ler aynı zamanda adli tıpta DNA profillemede kullanılan ilk polimorfik belirteçlerdi.
Şekil 01: Altı kişide VNTR'lerin varyasyonu
VNTR analizi, kısıtlama parçası uzunluk polimorfizmi ve ardından güney hibridizasyonu yoluyla gerçekleştirilir. Bu nedenle, nispeten büyük bir DNA örneğine ihtiyaç duyar. VNTR profil yorumu da sorunludur. Bu sınırlamalar nedeniyle, VNTR'nin adli genetikte kullanımı sınırlandırılmıştır ve yerini STR analizi almıştır.
STR nedir?
STR, art arda düzenlenmiş iki ila on üç nükleotid tekrarlama biriminden oluşan, oldukça tekrarlı bir DNA bölümüdür. STR, VNTR'ye benzer. Ancak VNTR'den, tekrar eden bir dizideki nükleotit sayısından ve tekrar sayısından farklılık gösterir. STR bir tür mikro uydudur.
STR analizi, tekrarlanan birimlerin tam sayısını ölçmeyi içerir. STR'ler, VNT'lere benzer şekilde bireyler arasında oldukça değişkendir. STR profilleri kişiden kişiye farklılık gösterir. Bu nedenle, moleküler biyolojide STR analizi, iki veya daha fazla numuneden DNA üzerindeki spesifik lokusları karşılaştırmak için kullanılır. Bu nedenle STR'ler moleküler biyolojide güçlü genetik belirteçler olarak kabul edilir. Yüksek derecede polimorfizmleri ve nispeten kısa uzunlukları nedeniyle bireylerin tanımlanması için mükemmel bir araç sağlar.
Şu anda, STR'ler adli genetikte en sık kullanılan analiz edilen genetik polimorfizm aracıdır. Çoğu adli vaka çalışması, STR polimorfik analizini içerir. STR lokusları genom boyunca yayılır. Adli analizlerde kullanılabilecek kromozomlarda yer alan binlerce STR vardır. STR analizi, VNTR analizi gibi kısıtlama uzunluğu polimorfizmi içermez. STR analizi, restriksiyon enzimleri ile DNA'yı kesmez. DNA üzerinde istenilen bölgelerin eklenmesi için spesifik problar kullanılır ve PCR tekniği kullanılarak STR uzunlukları belirlenir.
Şekil 02: Örnekler arasındaki STR varyasyonu
VNTR ve STR Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- VNTR ve STR kodlayıcı olmayan DNA'dır.
- İkisi de ardışık tekrarlardır.
- DNA bölümünün uzunluğundaki farklılık nedeniyle her ikisi de bireyler arasında polimorfizm gösterir.
- Her ikisi de DNA parmak izinde ve adli tıp çalışmalarında güçlü genetik belirteçler olarak kullanılır.
VNTR ve STR Arasındaki Fark Nedir?
VNTR vs STR |
|
| VNTR, art arda tekrarlanan kısa bir nükleotid dizisine sahip, kodlamayan, tekrarlayan bir DNA'dır. | STR, art arda düzenlenmiş iki ila on üç nükleotid tekrar ünitesinden oluşan, oldukça tekrarlayan bir DNA bölümüdür. |
| Boyut | |
| VNTR'ler STR'lerden daha büyüktür. | STR'ler, VNTR'lerden daha küçüktür. |
| Tekrarlanan Dizideki Nükleotid Sayısı | |
| VNTR'nin tekrar eden birimi 10 ila 100 nükleotitten oluşur. | STR'nin tekrar eden birimi 2 ila 13 nükleotitten oluşur. |
Özet – VNTR vs STR
VNTR ve STR, moleküler biyolojide, özellikle adli genetik alanında kullanılan iki güçlü genetik belirteçtir. VNTR bir tür mini uydudur ve STR bir mikro uydudur. VNTR ve STR, kodlamayan, yüksek oranda tekrarlayan DNA'dır. Tandem tekrarlarıdır. VNTR ve STR'nin genel yapısı aynıdır. Ancak tekrar eden dizideki nükleotid sayısı ve uzunluğu farklıdır. VNTR, 10 ila 100 nükleotitten oluşan tekrarlayan dizilere sahiptir. STR, 2 ila 13 nükleotitten oluşan tekrarlayan dizilere sahiptir. VNTR ve STR arasındaki fark budur.
VNTR ve STR'ın PDF Sürümünü İndirin
Bu makalenin PDF sürümünü indirebilir ve alıntı notlarına göre çevrimdışı amaçlarla kullanabilirsiniz. Lütfen PDF sürümünü buradan indirin VNTR ve STR Arasındaki Fark.
