Maksimum tutumluluk ve maksimum olabilirlik arasındaki temel fark, filogenetik ağacı geliştirmede kullanılan yönteme bağlıdır. Maksimum cimrilik, filogenetik ağaç yapımı sırasında toplam karakter durumlarını minimize etmeye odaklanırken, maksimum olabilirlik, genetik veriler arasındaki olasılığa bağlı olarak filogenetik ağacın çizilmesinde istatistiksel bir yaklaşımdır.
Filojeni, organizmaların sınıflandırılması ve isimlendirilmesine yönelik yeni bir yaklaşımdır. Filogeni, genetik verilere ve evrimsel ilişkilere dayanır. Genetik veriler, DNA dizilemesinin bir sonucudur. Filogenide, organizmaların sınıflandırılması ortak ataya göre gerçekleşir. Bir filogenetik ilişkinin maksimum cimriliği ve maksimum olasılığı, bir filogenetik ağacın doğruluğunu ve güvenilirliğini artırır.
Maksimum Parsimony nedir?
Maksimum tutumluluk tekniğinde, filogenetik analiz sırasında toplam karakter durumu değişikliklerinin en aza indirilmesi gerçekleşir. Filogenetik, evrimsel ilişkileri incelemekle ilgilenen bir biyoloji dalıdır. Filogenetik ağaç, ortak bir ataya dayalı evrimsel ilişkileri gösteren bir ağaçtır. Böylece, maksimum tutumluluk kavramını kullanarak bir filogenetik ağaç çizerken, paralel evrim miktarı en aza indirilir. Bu nedenle, maksimum tutumluluk, ağacı diğer yöntemlerden çok daha hızlı üretecektir. Bunun nedeni, maksimum cimrilikte yalnızca ana ayırt edici özelliklerin dikkate alınmasıdır.
Şekil 01: Maksimum Parsimony
Maksimum bir cimri ağaç çizerken, ağaç her zaman minimum takson sayısına sahip mümkün olan en kısa ağaçtır. Bununla birlikte, maksimum cimri bir ağacın güvenilirliği çok yüksektir. Maksimum tutumluluğa dayalı filogenetik ilişkinin istatistiksel tutarlılığı ve doğruluğu değişecektir. Ayrıca, filogenetik bir ilişkinin maksimum tutumluluğunu analiz eden karmaşık algoritmalar vardır.
Maksimum Olasılık Nedir?
Maksimum olabilirlik, filogenetik ilişkileri analiz eden en çok kullanılan istatistiksel yöntemlerden biridir. Yöntem, olasılık modeline dayalı olarak filogeniyi analiz edecektir. Ayrıca, bu yöntem hem ortalamayı hem de varyansı dikkate alır. Böylece, filogenide, belirli bir organizmanın verilen genetik verileri üzerinde maksimum olabilirlik elde edilir.
Şekil 02: Maksimum Olasılık
Maksimum olabilirlik istatistiksel yöntemini kullanmanın hem avantajları hem de dezavantajları vardır. Yöntem, genetik bilgi içeren basit bir veri setini analiz ederken çok uygundur. Genetik veriler arasındaki varyans derecesi daha düşük olduğunda, maksimum olabilirlik puanları güvenilirdir. Maksimum olabilirlik yoluyla elde edilen sonuçlar, belirli bir filogenetik ilişkinin maksimum tutumluluk puanlarını daha da doğrular. Bu nedenle, maksimum olabilirlik analizi doğrulayıcı bir test görevi görür.
Yukarıda bahsedilen avantajlara kıyasla bu yöntem yavaş ve yoğun bir işlemdir. Ayrıca, tek bir veri setinin yokluğunda hata çıktısı yüksektir. Böylece, maksimum olabilirlik tahmini ile sonuçların tekrarlanabilirliğini de zorlaştırır.
Maksimum Parsimony ve Maximum Olabilirlik Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Maksimum tutumluluk ve maksimum olabilirlik, filogenide önemli rol oynayan iki yaklaşımdır.
- Her iki teknik de mevcut genetik verilere dayalı olarak bir organizmanın atasıyla ilişkisini tasvir eder.
- Filogenetik ağaçlar hem maksimum tutumluluk hem de maksimum olabilirlik kullanılarak yorumlanabilir.
- Her iki teknikte de genetik veriler DNA dizilimine veya RNA dizilimine dayanır.
- Her iki yöntem de filogenetik ağaçların oluşturulmasında önemlidir.
Maksimum Parsimony ile Maksimum Olabilirlik Arasındaki Fark Nedir?
Hem maksimum tutumluluk hem de maksimum olabilirlik, bir filogenetik ağacı yorumlamada iki farklı yaklaşımdır. Maksimum tutumluluk, birkaç özelliği analiz etmeye ve organizmadan organizmaya karakter değişikliklerini en aza indirmeye inanır. Buna karşılık, maksimum olabilirlik yöntemi hem ortalamayı hem de varyansı dikkate alır ve belirli bir organizmanın verilen genetik verileri üzerinde maksimum olabilirlik elde eder. Bu, maksimum cimrilik ile maksimum olabilirlik arasındaki temel farktır.
Ayrıca, maksimum cimriliğin güvenilirliği tek başına bir sonuca varmak için yeterli değildir. Ancak, maksimum olabilirlik yöntemi, maksimum tutumluluk sonuçlarının doğrulayıcı bir testi olarak işlev görür. Bu nedenle, hem maksimum tutumluluk hem de maksimum olabilirlik kullanılarak sonuçlar çıkarılmalıdır.
Aşağıdaki infografik, maksimum tutumluluk ve maksimum olasılık arasındaki farkı özetler.
Özet – Maksimum Tutarlılık ve Maksimum Olabilirlik
Filojeni, filogenetik ağaçlar oluşturarak evrimsel ilişkilerin türetilmesinde önemli bir rol oynar. Maksimum tutumluluk, minimum sayıda karakter durum değişikliği ile bir ağaç oluşturma tekniğidir. Buna karşılık, bir filogenetik ağacın maksimum olasılığı, genetik veriler arasındaki maksimum benzerliğin kullanılmasına dayanır. Her iki analiz için veriler, DNA veya RNA dizi verilerinden gelir. Ağaç yapımı her iki teknik kullanılarak yapıldığında güvenilirlik ve doğruluk yüksektir. Bu, maksimum tutumluluk ve maksimum olabilirlik arasındaki farkı özetler.
