Watson ve Crick ve Hoogsteen baz eşleşmesi arasındaki temel fark, Watson ve Crick'in baz eşleşmesinin pürinler ve pirimidinler arasındaki baz çiftlerinin oluşumunu tanımlayan standart yol olmasıdır. Bu arada, Hoogsteen baz eşleşmesi, pürinin pirimidine göre farklı bir konformasyon aldığı baz çiftleri oluşturmanın alternatif bir yoludur.
Bir nükleotidin üç bileşeni vardır: azotlu bir baz, bir pentoz şekeri ve bir fosfat grubu. DNA ve RNA'nın yapısında yer alan beş farklı azotlu baz ve iki pentoz şekeri vardır. Bu nükleotidler bir nükleotid dizisi oluşturduğunda, tamamlayıcı bazlar, ya pürinler ya da pirimidinler, aralarında hidrojen bağları oluşturur. Bu, baz eşleştirme olarak bilinir. Bu nedenle, iki azotlu bazın hidrojen bağlarıyla birleştirilmesiyle bir baz çifti oluşturulur. Watson ve Crick'in baz eşleştirmesi klasik veya standart yaklaşımdır, Hoogsteen baz eşleştirme ise baz çiftleri oluşturmanın alternatif bir yoludur.
Watson ve Crick Base Eşlemesi nedir?
Watson ve Crick'in baz eşleştirmesi, nükleotidlerdeki azotlu bazların baz eşleşmesini açıklayan standart yöntemdir. 1953'te James Watson ve Francis Crick, DNA'nın çifte standart sarmallarını stabilize eden bu temel soyma yöntemini açıkladılar. Watson ve Crick baz eşleşmesine göre, adenin, DNA'da timin ve RNA'da urasil ile hidrojen bağları oluşturur. Ayrıca guanin, hem DNA hem de RNA'da sitozin ile hidrojen bağları oluşturur.
Şekil 01: Watson ve Crick Base Eşleştirme
G ve C arasında üç hidrojen bağı varken A ve T arasında iki hidrojen bağı vardır. Bu baz çiftleri DNA sarmalının düzenli sarmal yapısını korumasını sağlar. Çoğu nükleotid dizisi (%60), nötr pH'ta kararlı olan Watson ve Crick baz çiftlerine sahiptir.
Hoogsteen Base Pairing nedir?
Hoogsteen baz eşleştirmesi, nükleik asitlerde baz çiftleri oluşturmanın alternatif bir yoludur. Bu ilk olarak 1963'te Amerikalı biyokimyacı Karst Hoogsteen tarafından tanımlanmıştır. Hoogsteen baz çiftleri Watson ve Crick baz çiftlerine benzer. Adenin (A) ve timin (T) ile guanin (G) ve sitozin (C) arasında meydana gelirler. Ancak pürin, pirimidine göre farklı bir biçim alır. A ve T baz çiftinde adenin, glikosidik bağ etrafında 1800 döndürülerek alternatif bir hidrojen bağ şemasına izin verilir. Benzer şekilde, G ve C çiftinde guanin, glikozidik bağ etrafında 180° döndürülür. Ayrıca, Hoogsteen baz çiftlerinde glikozidik bağların açısı daha büyüktür. Ayrıca, Hoogsteen baz çiftlerinin oluşumu nötr pH'ta kararlı değildir.
Şekil 02: Watson ve Crick Base Eşleştirmesi ve Hoogsteen Base Eşleştirmesi
Hoogsteen baz çiftleri, nükleotid dizilerini standart baz eşleşmesinden daha az kararlı hale getiren kanonik olmayan baz çiftleridir. Ayrıca, DNA çift sarmalının bozulmasına neden olabilirler. Hoogsteen baz çiftleri doğal olarak oluşsa da çok nadirdir.
Watson, Crick ve Hoogsteen Baz Eşleştirme Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Watson ve Crick ve Hoogsteen baz eşleştirmesi, nükleik asitlerde baz çiftlerinin oluşumunu tanımlamanın iki yoludur.
- Her ikisi de DNA'da doğal olarak bulunur.
- Ayrıca, birbirleriyle dengede bulunurlar.
- Baz çiftleri her iki yöntemde de benzerdir.
Watson, Crick ve Hoogsteen Baz Eşleştirmesi Arasındaki Fark Nedir?
Watson ve Crick baz eşleştirmesi, pürinler ve pirimidinler arasındaki baz çiftlerinin oluşumunu tanımlayan standart yoldur. Öte yandan, Hoogsteen baz eşleşmesi, pürinin pirimidine göre farklı bir konformasyon aldığı baz çiftleri oluşturmanın alternatif bir yoludur. Bu, Watson ile Crick ve Hoogsteen baz eşleştirmesi arasındaki temel farktır. Watson ve Crick baz çifti James Watson ve Francis Crick tarafından 1953'te, Hoogsteen baz çifti ise 1963'te Karst Hoogsteen tarafından tanımlanmıştır. Ayrıca Watson ve Crick baz çiftleri kararlı iken Hoogsteen baz çiftleri tipik olarak daha az kararlıdır.
Aşağıdaki infografik, Watson ile Crick ve Hoogsteen temel eşleştirme arasındaki farkı özetler.
Özet – Watson ve Crick vs Hoogsteen Base Eşleştirme
Watson ve Crick baz eşleştirmesi ve Hoogsteen baz eşleştirmesi, nükleotit dizilerinde azotlu bazların oluşumunu tanımlayan iki tür yoldur. Hoogsteen baz eşleşmesinde, pürin bazı, pirimidin bazına göre farklı bir konformasyon alır. Bu, Watson ile Crick ve Hoogsteen baz eşleştirmesi arasındaki temel farktır. Ayrıca Watson ve Crick baz çiftleri DNA çift sarmalını stabilize ederken Hoogsteen baz çiftleri sarmalı kararsız hale getirir. Ancak, her iki tip baz çifti de doğal olarak oluşur ve birbirleriyle denge halinde bulunurlar.
