PFGE ve CRP analizi arasındaki temel fark, PFGE'nin periyodik olarak değişen bir elektrik alanı uygulayarak büyük DNA moleküllerinin ayrılması için kullanılan bir laboratuvar tekniği olması, CRP (c-reaktif protein) analizinin ise kan plazmasında halka şeklindeki bir proteini tespit eder.
PFGE ve CRP analizi, bilim adamları tarafından insan vücuduna zarar veren farklı patojenik organizmaları tespit etmek için kullanılan iki tekniktir. Darbeli alan jel elektroforezi (PFGE), bir patojenin, özellikle bir bakteri izolatının DNA parmak izini tespit eden doğrudan bir laboratuvar tekniğidir. CRP ise, bir iltihaplanma sonucu kanda belirli bir proteini tespit etmek için kullanılan dolaylı bir testtir. Bu iltihaplar normalde bakteriyel veya diğer patojenlerin enfeksiyonlarından kaynaklanır.
PFGE nedir?
Pulsed-field jel elektroforezi, bir elektrik alanı uygulayarak bir jel matrisindeki büyük DNA moleküllerinin ayrılması için kullanılan bir tekniktir. Elektrik alanı periyodik olarak yönünü değiştirir. Genetik mühendisliği veya farklı organizmaların genotiplenmesi için kullanılabilir. PFGE prosedürü, standart jel elektroforez tekniğine nispeten benzerdir. Tek fark, üç yön arasında periyodik olarak değişen voltajdır. Bir yön jelin merkezi ekseninden geçerken diğer ikisi her iki tarafta 60 derecelik bir açıyla ilerler. Darbe süresi her yön için eşit olduğundan, DNA'nın net ileri göçü ile sonuçlanır.
Şekil 01: PFGE Analizi
Bu prosedür, çözülen parçaların boyutundan dolayı genel jel elektroforezinden daha uzun sürer. PFGE tekniğinde, elektrik alan yönünün değişmesiyle birlikte, çeşitli uzunluklardaki DNA değişimlere farklı oranlarda tepki verir. Büyük DNA fragmanları, hızlı bir şekilde yeniden hizalanan daha küçük DNA fragmanlarına kıyasla daha yavaş yeniden hizalanır. Bu nedenle, bu teknikle DNA parçalarının daha iyi ayrılması mümkündür.
PFGE, Listeria monocytogenes gibi bakteriyel patojenleri tespit etmek için yaygın olarak kullanılır. Klinik enfeksiyonları tespit etmek için popüler bir yöntemdir.
CRP Analizi Nedir?
C-reaktif protein (CRP), kan plazmasında bulunan halka şeklinde (halka şeklinde) pentamerik bir proteindir. Genel olarak, CRP, inflamasyona yanıt olarak konsantrasyonlarda artar. CRP analizi, bu proteinin kan plazmasında saptanmasına dayanır. CRP proteini, makrofajlar ve yağ hücreleri tarafından salgılanan belirli faktörlere yanıt olarak karaciğer tarafından sentezlenir. CRP proteini, tanımlanacak ilk model tanıyan reseptördür (PRR).
Şekil 02: CRP Analizi
Artan CRP protein seviyesi travma, kalp krizi, otoimmün bozukluklar ve sepsis gibi bakteriyel enfeksiyonlardan sonra gözlemlenebilir. Kan plazmasındaki normal CRP protein seviyesi litre başına 0.3-10 miligramdır (mg/L). Kan, bir damardan, genellikle hastanın kolundan alınır. Analiz, bir biyokimyasal ölçüm prosedürü kullanılarak gerçekleştirilir. Bir CRP testi sonucunda 10 mg/L'den yüksek CRP seviyeleri ciddi bir enfeksiyonun (sepsis) işaretidir. CRP testi iltihabın yerini veya nedenini açıklamaz. Bu nedenle, doktorlar iltihabın nedenini açıklamak için daha fazla test önermek zorundadır. Bazen sigara, obezite ve egzersiz eksikliği nedeniyle CRP protein seviyesi yükselir.
PFGE ve CRP Analizi Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- PFGE ve CRP analizi, laboratuvarlarda kullanılan test prosedürleridir.
- Her iki test de biyomolekülleri hedefler.
- İnsan hastalıklarını tespit etmek için kullanılırlar.
- Bu testler patojenleri tespit edebilir.
PFGE ve CRP Analizi Arasındaki Fark Nedir?
PFGE, periyodik olarak değişen bir elektrik alanı uygulayarak büyük DNA moleküllerinin ayrılması için kullanılan bir laboratuvar tekniğidir. Buna karşılık, CRP analizi, kan plazmasındaki halka şeklindeki proteinleri tespit eden bir tekniktir. Dolayısıyla, PFGE ve CRP analizi arasındaki temel fark budur. Ayrıca, PFGE patojenleri doğrudan tespit ederken, CRP analizi patojenleri dolaylı olarak tespit eder.
Aşağıda, PFGE ve CRP analizi arasındaki önemli farkların bir listesi tablo halinde verilmiştir.
Özet – PFGE ve CRP Analizi
PFGE ve CRP analizi, klinik laboratuvarlarda rutin olarak kullanılan iki testtir. PFGE, bilim adamları tarafından DNA parmak izleri, özellikle bakteriyel patojenler üretmek için kullanılan bir laboratuvar tekniğidir. C-reaktif protein (CRP) testi, kan plazmasındaki yükseltilmiş c-reaktif proteini tespit ederek iltihabı tespit etmek için kullanılır. Her iki test de insan hastalıklarını tespit etmede önemlidir. Böylece bu, PFGE ve CRP analizi arasındaki farkı özetler.
