DNA ve protein mikrodizisi arasındaki temel fark, DNA mikrodizisinin cam slayt gibi katı bir yüzeye tutturulmuş mikroskobik DNA noktalarının bir koleksiyonu olması, protein mikrodizisinin ise cam gibi katı bir yüzey üzerinde saflaştırılmış proteinlerin bir düzenlemesi olmasıdır. slayt.
Microarray, bir çip (LOC) cihazındaki bir laboratuvardır. Minyatür, multipleks, paralel işleme ve algılama cihazıdır. Aynı zamanda, cam slayt veya silikon ince film hücresi gibi katı bir yüzey üzerinde iki boyutlu bir dizidir. Bir mikrodizi, yüksek verimli tarama kullanarak büyük miktarda biyolojik materyali analiz eder. İlk mikrodizi, 1983'te Tse Wen Chang tarafından tanıtılan antikor çipiydi. İlk gen çipi 1995 yılında Stanford Üniversitesi'nde Ron Davis ve Pat Brown tarafından tanıtıldı. Bu nedenle, DNA ve protein mikrodizisi iki tür mikrodizi cihazıdır.
DNA Mikroarray nedir?
DNA mikrodizisi, cam slayt gibi katı bir yüzeye eklenmiş mikroskobik DNA lekeleri koleksiyonudur. Bilim adamları, aynı anda çok sayıda genin ifadesini ölçmek için DNA mikrodizisini kullanır. Ayrıca bir genomun birden çok bölgesini genotiplemek için kullanılır. DNA mikrodizisi robotik makineler kullanılarak hazırlanır. Bu makineler, tek bir mikroskobik slayt üzerinde yüzlerce veya binlerce gen dizisini (sonda) düzenler.
Şekil 01: DNA Mikrodizi
DNA mikrodizisinde, her bir DNA lekesi, belirli bir DNA dizisinin pikomolü (10−12 mol) içerir. Bu DNA dizileri ayrıca problar veya raportörler olarak da bilinir. Bu problar, bir genin veya başka bir DNA elementinin kısa bir DNA segmentidir. Yüksek katı koşullar altında bir numunede cDNA veya CRNA ile hibritlenebilirler. Problara bağlanan floresan etiketli numune dizileri, sıcaklık gibi hibridizasyon koşullarına bağlı sinyaller üretir. Bu nedenle, bu yöntem, numunedeki nükleik asit dizilerinin nispi bolluğunu belirlemek için kullanılabilir. Ayrıca, DNA mikrodizi tekniği gen ekspresyon çalışmalarında, karşılaştırmalı genomik çalışmalarda, gıda veya hücre kültürlerinin patojenler tarafından kontaminasyonunun kontrol edilmesinde, gen mutasyonlarının değerlendirilmesinde, ilaç adaylarının belirlenmesinde, genetik bağlantı analizinde vb. yaygın olarak kullanılmaktadır.
Protein Mikroarray nedir?
Protein mikrodizisi, cam slayt gibi katı bir yüzey üzerinde saflaştırılmış proteinlerin bir düzenlemesidir. Proteinlerin etkileşimlerini ve aktivitelerini tespit etmek için kullanılan bir yöntemdir. Ayrıca proteinlerin işlevlerini büyük ölçekte belirlemek için kullanılır. Protein mikrodizisinin ana avantajı, çok sayıda proteinin paralel olarak izlenebilmesidir. Protein mikrodizisi, cam slayt, nitroselüloz membran, boncuk veya mikrotitre plakası gibi bir destek yüzeyinden oluşan bir çiptir. Yakalama proteinleri (antikorlar, antijenler) bu katı yüzeye bağlıdır. Genellikle bir floresan boya ile etiketlenen prob molekülleri diziye daha sonra eklenir. Prob ve hareketsizleştirilmiş proteinler arasındaki hibridizasyon, bir lazer tarayıcı tarafından algılanabilen bir floresan sinyali yayar.
Şekil 02: Protein Mikrodizi
İlk protein dizisi, 1983'te tanıtılan bir antikor mikrodizisidir (antikor matrisi). Protein mikrodizileri hızlı, otomatik, oldukça hassas ve ekonomiktir. Ayrıca sadece az miktarda numune ve reaktif tüketirler. Ayrıca, protein mikrodizileri, hastalık teşhisi, protein fonksiyonel analizi, antikor karakterizasyonu ve tedavi geliştirmede yaygın olarak kullanılmaktadır.
DNA ve Protein Mikrodizisi Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- DNA ve protein mikrodizisi iki tür mikrodizi cihazıdır.
- Her iki cihaz da hibridizasyon ilkesine dayanmaktadır.
- Her iki cihaz da prob kullanır.
- Ayrıca hibridizasyonu tespit etmek için floresan sinyalleri kullanırlar.
- İkisi de tıpta hastalık teşhisinde son derece faydalıdır.
DNA ve Protein Mikrodizisi Arasındaki Fark Nedir?
DNA mikrodizisi, cam slayt gibi katı bir yüzeye eklenmiş mikroskobik DNA lekeleri koleksiyonudur. Buna karşılık, protein mikrodizisi, cam slayt gibi katı bir yüzey üzerinde saflaştırılmış proteinlerin bir düzenlemesidir. Bu, DNA ve protein mikrodizisi arasındaki temel farktır. Ayrıca, bir DNA mikrodizisinde numune ve prob, DNA dizileridir. Öte yandan, protein mikrodizisinde numune ve prob proteinlerdir.
Aşağıdaki infografik, DNA ve protein mikrodizisi arasındaki farkları tablo şeklinde sunar.
Özet – DNA ve Protein Mikroarray
Bir mikrodizi, yüksek verimli ve çip üzerinde multipleks bir laboratuvardır. Hibridizasyon prensibine göre yapılır. DNA ve protein mikrodizisi, iki tür mikrodizi cihazıdır. DNA mikrodizisi, cam slayt gibi katı bir yüzeye tutturulmuş mikroskobik DNA lekeleri topluluğudur. Öte yandan, protein mikrodizisi, cam slayt gibi katı bir yüzey üzerinde saflaştırılmış proteinlerin bir düzenlemesidir. Dolayısıyla, bu DNA ve protein mikrodizisi arasındaki farkın özetidir.
