Aminoasil tRNA ve peptidil tRNA arasındaki temel fark, aminoasil tRNA'nın ribozomun A bölgesine bağlı bir tRNA molekülü olması, peptidil tRNA'nın ise ribozomun P bölgesine bağlı bir tRNA molekülü olmasıdır.
Transfer RNA (tRNA), bir mesajcı RNA (mRNA) dizisinin bir proteine dönüştürülmesine yardımcı olan bir RNA molekülüdür. Protein sentezinde tRNA molekülü, mRNA (haberci RNA) üzerindeki tamamlayıcı dizisi ile baz çiftleri oluşturur. Bu, uygun amino asidin büyüyen polipeptit zincirine (protein molekülü) eklenmesini sağlar. Bu nedenle, tRNA, protein sentezinin çeviri aşaması için önemli bir bileşendir. Aminoasil tRNA ve peptidil tRNA, protein sentezinin çeviri aşamasına katılan iki tür tRNA molekülüdür.
Aminoasil tRNA nedir?
Aminoasil tRNA, ucunda tek bir amino asit taşıyan bir tRNA molekülüdür. Genellikle ribozomun bitişik A bölgesine bağlanır. Aminoasil tRNA, belirli uzama faktörleriyle birlikte, translasyon sırasında polipeptit zincirine dahil edilmek üzere spesifik amino asidi ribozoma iletir. Her amino asidin kendine özgü aminoasil tRNA sentetaz enzimi vardır. Bu enzim, amino asitler tarafından spesifik tRNA'ya kimyasal olarak bağlanmak için kullanılır. Bir tRNA'nın aynı kökenli amino asidiyle bağlanması çok önemlidir. Bu, protein sentezi sırasında yalnızca tRNA'nın antikodonuna uyan spesifik amino asidin kullanılmasını sağlar. Translasyon hatalarını önlemek için aminoasil tRNA sentetaz enzimi düzeltme okuma yeteneğine sahiptir. Uygun tRNA molekülü ile misasillenmiş amino asitler genellikle hidrolize uğrar. Bu, aminoasil tRNA sentetaz enziminin deasilasyon mekanizması tarafından gerçekleştirilir. Ayrıca hatalı protein sentezini önlemek için yanlış yüklenen tRNA'nın hidrolize edilmesi gerekir.
Şekil 01: Aminoasil tRNA
Protein sentezindeki işlevine ek olarak, aminoasil tRNA, lipitlerin modifikasyonu ve antibiyotiklerin biyosentezi için gerekli amino asitlerin donörü olarak da işlev görebilir. Ayrıca, gen kümelerinin, kodlanmış polipep titlerin sentezini düzenlemek için aminoasil tRNA'yı kullanabileceği de anlaşılmaktadır.
Peptidil tRNA nedir?
Peptidil tRNA, ribozomun P bölgesine bağlı bir tRNA molekülüdür. Başlatma kompleksi düzgün bir şekilde oluştuktan sonra, translasyon polipeptidin uzamasıyla ilerler. Ribozomun tRNA bağlanması için üç yeri vardır: P (peptidil), A (aminoasil) ve E (vardır).
Şekil 02: Peptidil tRNA
Başlatıcı metionil tRNA her zaman P bölgesine bağlıdır. Bir sonraki aminoasil tRNA, bir uzama faktörü (prokaryotlarda EF-Tu ve ökaryotlarda eEf-1α) ve GTP yardımıyla A bölgesine bağlanır. Bağlandıktan sonra GDP (hidrolize GTP) molekülü serbest bırakılır. Daha sonra, P bölgesindeki metionil tRNA ile A bölgesindeki ikinci aminoasil tRNA arasında bir peptit bağı oluşur. Bu reaksiyon, peptidil transferaz enzimi tarafından katalize edilir. Bu reaksiyon, metionini A bölgesindeki aminoasil tRNA'ya aktarır, böylece bir peptidil tRNA oluşturur. Ayrıca, translokasyon aşamasında, peptidil tRNA, uzama faktörleri (prokaryotlarda EFG ve ökaryotlarda eEf-2) ve GTP hidrolizi yardımıyla ribozomun P bölgesine hareket eder. Ek olarak, yüklenmemiş tRNA önce ribozomun E bölgesine hareket eder, ardından işlemin sonunda E bölgesinden ayrılır.
Aminoasil tRNA ve Peptidil tRNA Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Aminoasil tRNA ve peptidil tRNA, çeviriye katılan iki tür tRNA molekülüdür.
- Her ikisi de ribonükleotid bazlarından oluşan tRNA molekülleridir: adenin, sitozin, guanin ve urasil.
- Amino asitler her iki molekülle de ilişkilidir.
- Protein sentezinde hayati roller oynarlar.
- Her ikisi de çevirinin uzatma aşamasına katılır.
Aminoasil tRNA ve Peptidil tRNA Arasındaki Fark Nedir?
Aminoasil tRNA, ribozomun A bölgesine bağlı bir tRNA molekülüdür, peptidil tRNA ise ribozomun P bölgesine bağlı bir tRNA molekülüdür. Bu, aminoasil tRNA ile peptidil tRNA arasındaki temel farktır. Ayrıca, aminoasil tRNA, terminalde tek bir amino asit taşırken peptidil tRNA, terminalde bir peptit zinciri taşır.
Aşağıdaki infografik, yan yana karşılaştırma için aminoasil tRNA ve peptidil tRNA arasındaki farkları tablo şeklinde listeler.
Özet – Aminoasil tRNA ve Peptidyl tRNA
tRNA, bir mRNA dizisinin bir proteine dönüştürülmesine yardımcı olan bir moleküldür. Aminoasil tRNA ve peptidil tRNA, çeviri sürecine katılan iki tip tRNA molekülüdür. Aminoasil tRNA, çeviri işlemi sırasında ribozomun A bölgesine bağlanırken, peptidil tRNA, çeviri işlemi sırasında ribozomun P bölgesine bağlanır. Böylece bu, aminoasil tRNA ve peptidil tRNA arasındaki farkı özetler.
