İzoşizomerler ve izokaudomerler arasındaki temel fark, izoşizomerlerin aynı kısıtlama veya tanıma bölgesini tanıması ve parçalaması, izokokudomerlerin ise biraz farklı kısıtlama bölgelerini tanıması ve aynı bölgede parçalanmasıdır.
Kısıtlama enzimleri veya kısıtlama endonükleazları, çift sarmallı DNA'yı parçalayan bir tür nükleazdır. Kökeninde palindromik olan kısıtlama bölgeleri adı verilen spesifik dizileri tanıyabilirler. Bakteriler, yabancı patojenlere, özellikle virüslere karşı kısıtlama enzimleri üretir. Bakterilerin gösterdiği bir savunma mekanizması şeklidir. Enzimin yapısına ve kesimlerin doğasına bağlı olarak tip I restriksiyon enzimleri, tip II restriksiyon enzimleri ve tip II restriksiyon enzimleri olmak üzere üç tip restriksiyon enzimi vardır. Ayrıca biyokimyasal aktiviteye ve izolasyon kaynağına bağlı olarak izoşizomerler, neoşizomerler ve izokaudomerler olmak üzere üç tip restriksiyon enzimi vardır.
İzoşizomerler nelerdir?
İzoşizomerler, farklı kaynaklardan gelen ancak DNA'daki aynı kısıtlama bölgesini tanıyan ve parçalayan bir tür kısıtlama enzimidir. Bu nedenle, iki izoşizomer aynı tanıma bölgesine sahiptir. Aynı bölgede bölünürler, dolayısıyla aynı tanıma dizisine özgüdürler. Örneğin, kısıtlama enzimleri SphI ve BbuI, CGTAC/G'yi tanıyan ve parçalayan iki izoşizomerdir.
Şekil 01: Kısıtlama Enzim
Başka bir izoşizomer çifti HpaII ve MspI'dir. Her ikisi de 5′-CCGG-3′ dizisini tanır ve DNA'yı parçalar. Ayrıca, Bsp EI ve Acc III ayrıca sırasıyla bir Bacillus türünden ve Acinetobacter calcoaceticus'tan olan izoşizomerlerdir. İzoşizomerlerin izolasyonu farklı bakterilerden yapılabilir. Farklı bakterilerden geldikleri için kısıtlama koşulları birbirinden farklı olabilir.
Isocaudomers nedir?
İzokaudomerler, biraz farklı dizileri tanıyan bir tür kısıtlama enzimidir, ancak aynı uçları üretmek için aynı bölgede bölünürler. İzokadomerler ayrıca farklı bakterilerden gelir. Sau3a ve BamHI bir çift izokaudomerdir. Aynı sitenin bölünmesinden sonra 5'-GATC-3' yapışkan uç üretirler. Başka bir izokaudomer çifti, Nocardia corallina'dan NcoI ve Pseudomonas alcaligenes'den PagI'dir. Bu iki enzim de farklı tanıma dizilerinde bağlanır ancak aynı bölgede kesilir ve aynı yapışkan uçları üretir. Bu nedenle kesici uçlar üretmek birbiriyle uyumludur ve birbirine bağlanabilir. XhoI, PspXI ve SalI aynı zamanda izokaudomerlerdir.
İzoşizomerler ve İzokadomerler Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- İzoşizomerler ve izokudomerler iki tür kısıtlama enzimidir.
- İki izoşizomer, aynı sindirim bölgesine sahip olan iki izokaudomere benzer şekilde aynı sindirim bölgesine sahiptir.
- Orijinal olarak prokaryotturlar.
- Her ikisinin de bir kısıtlama tanıma sitesi ve sindirim sitesi vardır.
- Birbiriyle uyumlu uçlar üretirler.
- Ayrıca, bu enzimler rekombinant DNA teknolojisinde faydalı araçlardır.
İzoşizomerler ve İzokaudomerler Arasındaki Fark Nedir?
İzoşizomerler, aynı DNA dizisini tanıyan ve aynı kısıtlama bölgesinde parçalanan kısıtlama enzimleridir, izokaudomerler ise biraz farklı DNA dizilerini tanıyan ancak aynı bölgede keserek aynı yapışkan uçları üreten kısıtlama enzimleridir. Bu, izoşizomerler ve izokaudomerler arasındaki temel farktır.
Aşağıdaki infografik, izoşizomerler ve izokaudomerler arasındaki farkı tablo halinde göstermektedir.
Özet – İzoşizomerler ve İzokaudomerler
İzoşizomerler, aynı DNA dizisini tanıyan ve aynı bölgede parçalanan kısıtlama enzimleridir. Öte yandan, izokaudomerler, biraz farklı dizileri tanıyan ve aynı bölgede bölünerek aynı uçları üreten kısıtlama enzimleridir. Bu nedenle, izoşizomerler ve izokaudomerler arasındaki temel fark budur. SphI, Bbul, HpaII ve MspI, izoşizomerlerin birkaç örneğidir, Sau3a ve BamHI ise iki izokaudomer örneğidir. Hem izoşizomerler hem de izokaudomerler bakteriler tarafından doğal olarak üretilir.
