Aktivatör promotör ve baskılayıcı arasındaki temel fark, işlevleridir. Bir aktivatör, güçlendiricilere bağlanarak transkripsiyon işleminin yukarı regülasyonunu kolaylaştırırken, promotör, RNA polimerazın bağlandığı ve transkripsiyonun başladığı yerdir ve baskılayıcı, susturuculara bağlanarak transkripsiyonu aşağı regüle eder.
Transkripsiyon, bir DNA şablonu kullanarak tamamlayıcı mRNA'yı sentezleme işlemidir. İşlem ökaryotlarda çekirdekte, prokaryotlarda ise sitoplazmada gerçekleşir. Transkripsiyonun üç ana aşaması vardır: başlama, uzama ve sonlandırma. Aktivatörler ve baskılayıcılar, transkripsiyonun başlamasını düzenlerken, promotörler RNA polimerazın bağlanmasında önemlidir. RNA polimeraz, transkripsiyona aracılık eden ana enzimdir.
Aktivatör Nedir?
Aktivatör, transkripsiyonu yukarı regüle etmek için güçlendirici bölgelere bağlanan bir transkripsiyonel faktördür. Bir kez bağlandığında, transkripsiyonu aktive ederek veya yukarı regüle ederek şablon ipliğin oryantasyonunda bir değişiklik ile sonuçlanır. Ayrıca, transkripsiyonu başlatmak için RNA polimerazın promotör bölgesine bağlanmasını teşvik edecektir.
Şekil 01: Aktivatör
Aktivatörler genellikle protein molekülleridir. Gen ekspresyonunun anabolik yolunu desteklerler. Aktivatör işlevi ağırlıklı olarak ökaryotik transkripsiyonel düzenlemede gözlenir.
Promoter nedir?
Bir genin promotör bölgesi, transkripsiyonun başlangıcında RNA polimeraz bağlanmasının gerçekleştiği bölgedir. Prokaryotlarda ve ökaryotlarda promotör bölgeler değişiklik gösterir. Promoter aktivasyonu, transkripsiyonel kontrol ve aktivasyonda önemli bir adımdır. Prokaryotik promotör bölgeleri, transkripsiyon başlangıç bölgesinin yukarısındaki -35 ve -10 bölgelerinde mevcuttur. -10 promotör bölgesi ayrıca TATA kutusu veya pribnow kutusu olarak da adlandırılır. Bakteriyel RNA polimerazın sigma faktörü, promotörü tanır ve kapalı promotör kompleksini oluşturmak için bağlanır. Daha sonra çift sarmalların çözülmesi gerçekleşir ve bu da açık bir promotör kompleksi ile sonuçlanır. Son olarak, RNA polimerazın sigma faktörü, transkripsiyonun başlamasını sağlar.
Şekil 02: Destekleyici
Ökaryotlarda, promotör aktivasyonu, çoklu transkripsiyon başlatma faktörleri aracılığıyla gerçekleşir. Ökaryotlarda iki ana promotör türü vardır. Bunlar TATA'sız destekleyiciler ve TATA destekleyicileridir.
Baskılayıcı nedir?
A baskılayıcı, susturucu bölgelere bağlanarak transkripsiyon sürecini aşağı regüle eden bir transkripsiyon faktörüdür. Bu, RNA polimerazın promotöre bağlanmasını önler. Bu, hücrenin transkripsiyonu durdurma mekanizmasının anahtar birimidir. Burada, baskılayıcı susturucu bölgeye bağlanır ve hızı düşürerek ve işlemi tamamen durdurarak transkripsiyon sürecini bloke eder.
Şekil 03: Bastırıcı
Transkripsiyonel baskılayıcılar dış uyaranlara tepki verir. Bu aynı zamanda aktivatör promotörlerinin promotör bölgelerine bağlanmasını da önler. Korepresörler, baskılayıcıların bir alt kategorisidir ve histon deasetilaz alımı yoluyla transkripsiyon başlangıcını bastırır. Histon deasetilaz, histon proteini üzerindeki pozitif yükü arttırır. Bu, DNA ve histonlar arasındaki etkileşimi güçlendirir ve DNA'nın transkripsiyon için erişilebilirliğini az altır.
Aktivatör Destekleyici ve Bastırıcı Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Aktivatörler, promotörler ve baskılayıcılar transkripsiyon sürecinde yer alır.
- Asıl rolleri, transkripsiyonun başlatılması sırasındadır.
- Ayrıca, transkripsiyonel düzenleyici faktörler olarak hareket ederler.
- Hepsi RNA polimerazın doğru bağlanmasını kolaylaştırır.
Aktivatör Destekleyici ve Baskılayıcı Arasındaki Fark Nedir?
Activator, güçlendiricilere bağlanarak transkripsiyon sürecinin yukarı regülasyonunu kolaylaştırır. Bu arada, RNA polimeraz, transkripsiyon başlangıcı sırasında promotör bölge ile bağlanır. Oysa baskılayıcı, susturuculara bağlanarak transkripsiyon sürecini aşağı regüle eder. Bu nedenle, aktivatör promotörü ve baskılayıcı arasındaki temel fark budur. Ayrıca, aktivatörler ve baskılayıcılar genellikle transkripsiyonu düzenleyen proteinlerdir, promotör ise genin yukarı akış alanlarında bulunan bir DNA elementidir. Ayrıca, hem aktivatörler hem de promotörler transkripsiyon sürecini geliştirirken, baskılayıcılar transkripsiyon sürecini engeller.
Aşağıdaki infografik, yan yana karşılaştırma için aktivatör promotör ve baskılayıcı arasındaki farkları tablo şeklinde sunar.
Özet – Aktivatör ve Promoter ve Bastırıcı
Aktivatör, promotör ve baskılayıcı, transkripsiyon hızını etkileyen transkripsiyonel faktörlerdir. temel fark aktivatör promotör ve baskılayıcı arasında bir aktivatör, güçlendiricilere bağlanarak transkripsiyon işleminin yukarı regülasyonunu kolaylaştırırken, promotör, transkripsiyon başlatma sırasında RNA polimerazın bağlanmasını kolaylaştırır ve baskılayıcılar, susturuculara bağlanarak transkripsiyonu aşağı düzenler. Aktivatörler ve baskılayıcılar genellikle gendeki düzenleyici bölgelere bağlanan ve DNA'da oryantasyon değişikliklerine neden olan protein molekülleridir. Destekleyiciler akış yukarı sitelerdir. RNA polimeraz bağlanması, promotör bölgelerinde gerçekleşir. Yani, aktivatör promotör ve baskılayıcı arasındaki fark budur.
