Uyumlu ve sıralı allosterizm modeli arasındaki temel fark, uyumlu modda enzim alt birimlerinin, bir alt birimdeki konformasyonel bir değişikliğin diğer tüm alt birimlere verilmesi gerektiği şekilde bağlanmasıdır, oysa sıralı modelde alt birimler bir alt birimde meydana gelen yapısal bir değişiklik diğerlerinde de benzer bir değişikliğe neden olacak şekilde bağlantılı değildir.
Allosterizmin uyumlu modeli ve sıralı modeli, allosterik enzimlerin iki temel davranış modeli olarak tanımlanabilir. Bu modeller sırasıyla 1965 ve 1966'da tanıtıldı. Şu anda, deneysel sonuçları yorumlamak için bu modellerin her ikisini de kullanıyoruz. Uyumlu model, nispeten basit olma avantajına sahiptir ve bazı enzim sistemlerinin davranışını çok iyi tanımlar. Öte yandan sıralı model, belirli bir miktarda basitlik gösterir, ancak yalnızca proteinlerin yapılarının ve davranışlarının bazı gerçekçi resimleri için. Bu mod aynı zamanda bazı enzim sistemlerinin davranışlarıyla da çok iyi ilgilenir.
Alosterizmin Uyumlu Modeli Nedir?
Uyumlu allosterizm modeli, enzim alt birimlerinin, bir alt birimdeki konformasyonel bir değişikliğin diğer tüm alt birimlere zorunlu olarak verildiği şekilde bağlı olduğunu varsayar. Bu aynı zamanda simetri modeli veya MWC modeli olarak da bilinir. Bu modele göre, tüm alt birimler aynı konformasyonda mevcut olmalıdır.
Şekil 01: Allosterik Düzenleme (A – Aktif Bölge B – Allosterik Bölge C – Substrat D – İnhibitör E – Enzim)
Bu model 1965 yılında Jacques Monod, Jeffries Wyman ve Jean-Pierre tarafından tanıtıldı. Bu modele göre, bir proteinin iki yapısı vardır: aktif konformasyon R ve inaktif konformasyon T. R konformasyon substratı sıkıca bağlarken, T konformasyonunda, substrat daha az sıkı bir şekilde bağlanır.
Uyumlu modelin ayırt edici bir özelliği, tüm alt birimlerin uyumunun aynı anda değişmesidir. Örneğin, iki alt birime sahip varsayımsal bir proteinde, her iki alt birim de konformasyonu inaktif T konformasyonundan aktif R konformasyonuna değiştirebilir.
Allosterizmin Sıralı Modeli Nedir?
Sıralı allosterizm modeli, allosterik davranışın doğrudan sıralı modeli olarak tanımlanabilir. Bu model, T formundan R formuna konformasyonel değişikliği indükleyen substratı bağlamanın ayırt edici özelliğine sahiptir. Bu, bu modelin işbirlikçi bağlama ifadesinin oluşumuna yol açtı.
Şekil 02: Sıralı Model
Ayrıca, bu modelde, tüm aktivatörler ve inhibitörler indüklenmiş uyum mekanizmasına bağlıdır. Burada, alt birimlerden birindeki inhibitör veya aktivatördeki konformasyonel değişiklik, diğer alt birimlerin konformasyonlarını etkiler.
Sıralı modelin en önemli özellikleri şunları içerir: alt birimlerinin aynı konformasyonda var olması gerekmez, konformasyonel değişiklikleri tüm alt birimlere verilmez ve substrat molekülleri indüklenmiş uyum protokolü aracılığıyla bağlanır.
Uyumlu ve Sıralı Allosterizm Modeli Arasındaki Fark Nedir?
Birleştirilmiş ve sıralı allosterizm modeli arasındaki temel fark, uyumlu modda, bir alt birimde meydana gelen bir konformasyonel değişikliğin diğer tüm alt birimlere iletilmesidir, oysa sıralı modelde, bir alt birimde bir konformasyonel bir değişiklik olmaz diğerlerinde de benzer bir değişikliğe neden olur.
Özet – Allosterizmin Sıralı Modeline Karşı Uyumlu
Uyumlu allosterizm modeli, enzim alt birimlerinin, bir alt birimdeki konformasyonel bir değişikliğin zorunlu olarak diğer tüm alt birimlere verildiği şekilde bağlı olduğunu varsayan bir modeldir. Allosterizmin sıralı modeli, allosterik davranışın doğrudan sıralı bir modelidir. Bu modelde, bir alt birimde meydana gelen yapısal bir değişiklik, diğerlerinde benzer bir değişikliğe neden olmaz. Bu, uyumlu ve sıralı allosterizm modeli arasındaki temel farktır.
