Anahtar Fark – Ti ve Ri Plasmid
Agrobacterium, dikotiledonlu bitkilerde taç safra hastalığı ve tüylü kök hastalığı dahil olmak üzere çeşitli hastalıklara neden olan bir bakteri cinsidir. Bu iki hastalık, bakterilerin plazmitlerinde (kromozomal olmayan DNA) bulunan genler tarafından kodlanır. Bakteriyel türler Agrobacterium tumerfaciens, bitkilerde taç safra hastalığından sorumlu olan bir tümör indükleyici plazmit (Ti plazmit) taşır. Agrobacterium rhizogenes, bitkilerde tüylü kök hastalığından sorumlu kök indükleyici plazmiti (Ri plazmiti) barındıran başka bir bakteridir. Ti ve Ri plazmitleri, bu bakteri cinsine özgü patojenik plazmitlerdir.temel fark Ti ve Ri plazmidi arasında Ti plazmidi, taç safra hastalığına neden olmaktan sorumlu genlerle kodlanırken, Ri plazmidi bitkilerde tüylü kök hastalığı için genlerle kodlanır. Bu patojenik plazmitler, DNA replikasyonu, virülans, T-DNA, opin kullanımı ve konjugasyondan sorumlu gen kümelerini içerir. Enfeksiyon sırasında Agrobacterium, plazmitin T-DNA (transfer DNA) bölgesini kesip çıkarır ve hastalığa neden olmak için bitki genomu ile bütünleşir. Bu yetenek, moleküler biyologlar tarafından, genetik mühendisliğinde bitkilere önemli genleri sokmak için kullanılır. Bu nedenle, Agrobacterium, kimerik DNA'nın farklı bitki türlerine tanıtılması için Biyoteknoloji ve Moleküler Biyoloji alanında önemli bir araç olarak kabul edilir.
Ti Plazmit nedir?
Tümör indükleyici plazmit (Ti plazmit), çok çeşitli dikot bitkilerinde taç safra hastalığına neden olmak üzere Agrobacterium tumerfaciens tarafından barındırılan daha büyük bir plazmittir. A. tarafından bitki hormonları oksin ve sitokininlerin aşırı üretimi nedeniyle toprak yüzeyinin üzerindeki bitkilerin taç kısmında büyük tümör benzeri şişlikler (safralar) oluşması nedeniyle taç safra hastalığı adı kullanılır.tümerfaciens. T-DNA bölgesi, tümör indükleyici genleri içerir. Agrobacterium tumerfaciens, özellikle yaralar olmak üzere hasarlı bitki dokularından bitkilere girer ve hastalığa neden olan genlerle birlikte kendisine ait plazmid DNA'sını (T-DNA) bitki hücrelerine aktarır. Bu T-DNA daha sonra bitki hücre genomuna entegre olur ve kopyalar. Genlerin ekspresyonu, tümör oluşumuna ve hücre metabolizmasında buna bağlı değişikliklere neden olur. Taç safrası hastalığı yaşlı bitkilerde ciddi zararlara neden olmaz. Ancak fidanlık bitkilerinin kalitesini düşürür.
Bu eşsiz enfeksiyon modu nedeniyle, A. tumerfaciens, transgenik bitkilerin üretimi için genetik mühendisliğinde bir araç olarak yaygın olarak kullanılmaktadır. Tümör indükleyen genler bastırılır ve insektisite dirençli genler ve herbisite dirençli genler gibi istenen genler, rekombinant DNA teknolojisi kullanılarak Ti plazmidine eklenir veya yeniden birleştirilir ve bitki yetiştirme programlarında kullanılır. A. tumerfaciens'in bitkilere bulaşması üzerine T-DNA aktarıldığında, bitkiler istenen genlerin etkilerini doğal olarak kazanırlar. Bu nedenle, T-DNA'ya yerleştirilen herhangi bir yabancı DNA, bu bakterinin doğal enfeksiyon süreci yardımıyla bitki hücre genomlarına entegre edilebilir.
Şekil 01: A. tumerfaciens'in Ti plazmidi
Ri Plazmit nedir?
Kök indükleyici plazmit (Ri Plazmit), A. rhizogenes bakterisi tarafından taşınan bir plazmittir. Dikot bitkilerinde kıllı kök hastalığı adı verilen hastalıktan Ri plazmiti sorumludur. A. rhizogenes enfeksiyonu, enfeksiyon bölgesinde veya yakınında geniş çapta maceracı kök oluşumuna neden olur. Tüylü kök indükleyici genler, Ri plazmidinin T-DNA bölgesinde bulunur. Ri plazmiti, Ti plazmitine benzer daha büyük bir plazmittir. A. rhizogenes ayrıca RI plazmitinin T-DNA bölgesini bitki hücrelerine transfer etme ve bitki hücre genomu ile bütünleşerek hastalıklara neden olmak için bitki hücre makinesini kullanarak transkripsiyon elde etme yeteneğine sahiptir. Bu nedenle, Ri plazmitleri ayrıca bitki genetik mühendisliğinde önemli vektörler olarak hizmet eder.
Ti ve Ri Plasmid arasındaki fark nedir?
Ti vs Ri Plazmid |
|
| Ti plazmiti, A tarafından barındırılan dairesel ve daha büyük bir plazmittir. tumerfaciens | Ri plazmiti, A tarafından barındırılan dairesel ve daha büyük bir plazmittir. rizojenler |
| Hastalık | |
| Ti plazmiti bitkilerde taç safra hastalığına yönelik genleri kodlar | Ri plazmidi, dikot bitkilerinde kıllı kök hastalığı genlerini kodlar. |
Özet – Ti vs Ri Plazmitler
Ti ve Ri plazmitleri, sırasıyla A. tumerfaciencs ve A. rhizogenes tarafından barındırılan patojenik plazmitlerdir. Ti plazmid, bitkilerde taç safra hastalığına neden olan tümör indükleyici genlere sahiptir. Ri plazmiti, bitkilerde tüylü kök hastalığına neden olan kök indükleyici genlere sahiptir. Ti ve Ri plazmitleri arasındaki temel fark budur. Bu plazmitler, plazmit DNA'larının bir kısmını konakçı genomuna transfer etme doğal yeteneklerinden dolayı bitki genetik mühendisliğinde vektörler olarak kullanılabilir. Gen kümeleri içerirler ve boyutları yaklaşık 200 kbp'dir. Her plazmit benzersiz genler içerir.
