Aktif site ile bağlanma bölgesi arasındaki temel fark, aktif sitenin kimyasal reaksiyonun katalizine yardımcı olurken, bağlanma bölgesinin bir ligandın büyük bir moleküle bağlanmasına yardımcı olmasıdır.
Bağlanma bölgesi, bir protein, DNA veya RNA üzerinde bir ligandın bağlanabileceği bir bölgedir. Enzimler proteinlerdir. Aktif bölge, bir enzim üzerinde, substratların kimyasal reaksiyona girmek için bağlanabileceği bir bölgedir. Bu spesifik bölge aynı zamanda bir katalitik site ile birlikte bir bağlanma bölgesine de sahiptir. Bu nedenle, bağlanma bölgeleri yalnızca bir ligandın büyük bir moleküle bağlanmasına yardımcı olurken, aktif bölgeler, bir ligandın büyük bir moleküle bağlanmasına yardımcı olurken, onun katalize edilmiş bir kimyasal reaksiyona girmesine izin verir.
Aktif Site Nedir?
Aktif bölge, bir enzim üzerinde, bir kimyasal reaksiyonun substratlarının katalize edilmiş bir kimyasal reaksiyona girmek için bağlandığı bir bölgedir. bu bölge, bağlanma bölgesi ve katalitik bölge olmak üzere iki alt bölgeden oluşur. Bağlanma bölgesi, substratın (reaktanlar) enzime bağlanmasına yardımcı olabilecek bazı kalıntılar içerir. Katalitik bölge, kimyasal reaksiyonu katalize etmeye yardımcı olur. Üstelik bu bölge, enzimin tüm hacmiyle karşılaştırıldığında çok küçüktür; enzimin tüm hacminin yaklaşık %10-20'si.
Şekil 01: Bir Aktif Sitenin Bağlanma Bölgesi ve Katalitik Bölgesi
Genellikle aktif site 3-4 amino asit içerir. enzimin üçüncül yapısının korunmasında rol oynayan enzimdeki amino asitlerin geri kalanı. Daha da önemlisi, aktif bir site, belirli bir alt tabakaya sığabilecek özel bir tasarıma sahiptir. Bu nedenle, bu enzimler sadece belirli substratlarla reaksiyona girer. Ancak bazen enzimlerin işlevleri için kofaktörlere ihtiyacı vardır. Aktif bölgenin ana işlevi, bir kimyasal reaksiyonun aktivasyon enerjisini az altmak ve böylece reaksiyon hızını arttırmaktır.
Bağlayıcı Site Nedir?
Bağlanma bölgesi, bir protein, DNA veya RNA üzerinde ligandların bağlanabileceği bir bölgedir. Orada, ligand bu site ile kimyasal bir bağ oluşturabilir. Bu bölgeler özgüllük gösterir; belirli bir ligand, belirli bir bağlanma bölgesine bağlanacaktır. Bu nedenle, bu site bir moleküle bağlanabilen ligand türlerinin bir ölçüsüdür.
Ayrıca, bu bölgeleri biyomoleküllerin fonksiyonel karakterizasyonu için sıklıkla kullanırız. Örneğin, aktif bir sitenin işlevselliğini bağlama sitesi aracılığıyla karakterize edebiliriz. Ayrıca, DNA durumunda, spesifik bağlanma bölgesi türü, DNA üzerinde mevcut olan transkripsiyon faktörü bağlanma bölgesidir.
Etkin Site ile Bağlayıcı Site Arasındaki Fark Nedir?
Aktif bölge, bir kimyasal reaksiyonun substratlarının katalizli bir kimyasal reaksiyona girmek için bağlandığı enzim üzerindeki bir bölgedir, bağlanma bölgesi ise bir protein, DNA veya RNA üzerinde ligandların bağlanabileceği bir bölgedir. Bu, aktif site ile bağlayıcı site arasındaki temel farktır. Ayrıca aktif bölgeler enzimler üzerinde bulunur ve belirli bir kimyasal reaksiyonun aktivasyon enerjisi bariyerini az altarak reaksiyon hızını artırmaya yardımcı olurlar. Bağlanma bölgeleri ise belirli bir ligandın belirli bir moleküle bağlanmasından sorumludur.
Aşağıdaki infografik, aktif site ile bağlayıcı site arasındaki farkı tablo şeklinde gösterir.
Özet – Aktif Site ve Bağlama Sitesi
Aktif bölgeler, bir kimyasal reaksiyonun aktivasyon enerjisi bariyerini az altarak o kimyasal reaksiyonun reaksiyon hızını artırabilen enzimler üzerindeki bölgelerdir. Bağlanma bölgesi, bir ligandın bağlanabileceği herhangi bir bölgedir. Aktif site ayrıca bir bağlama sitesi içerir. Aktif site ve bağlayıcı siteler arasındaki fark, varlığı ve işlevselliği üzerinde yatmaktadır. Bu nedenle, aktif site ile bağlanma bölgesi arasındaki temel fark, aktif sitenin kimyasal reaksiyonun katalizine yardımcı olurken, bağlanma bölgesinin bir ligandın büyük bir moleküle bağlanmasına yardımcı olmasıdır.
