1D ve 2D jel elektroforezi arasındaki temel fark, jel elektroforezinde proteinlerin ayrılması için kullanılan özelliklerdir. 1D jel elektroforezi proteinleri sadece moleküler ağırlığa göre ayırırken 2D jel elektroforezi proteinleri izoelektrik noktasına ve moleküler ağırlığına göre ayırır.
Jel elektroforezi ile protein ayırma, proteinleri karakterize etmek için önemli bir tekniktir. Proteinlerin değişen özellikleri vardır; bu nedenle ayırma, Agaroz jel elektroforezi ile DNA ayırmaya kıyasla daha karmaşıktır.
1D Jel Elektroforezi Nedir?
1D Jel Elektroforezi, aynı zamanda tek boyutlu jel elektroforezi olarak da bilinir, moleküler ağırlığa dayalı bir protein ayırma yöntemidir. Protein ayrımı esas olarak poliakrilamid jel elektroforezi kullanılarak gerçekleşir. Jel elektroforezi kavramına dayalı olarak, moleküller moleküler ağırlık ve yük özelliklerine göre ayrılırlar.
Bu nedenle, proteinlere eşit bir yük vermek için jel elektroforezinden önce Sodyum dodesil sülfat (SDS) işlemi yapılır. SDS, proteinleri denatüre eder ve protein üzerinde tek tip bir negatif yük sağlar; elektrik alanı uygulandığında, proteinler moleküler ağırlıklarına bağlı olarak pozitif terminale göç ederler. Bu nedenle, ayırmada sadece bir özellik dikkate alınır. Bu yöntemin 1D jel elektroforezi olarak adlandırılmasının nedeni budur.
Şekil 01: 1D Jel Elektroforezi
1D jel elektroforezi sırasında proteinler moleküler ağırlıklarına göre ayrılır. Bu bağlamda, düşük ağırlıklı moleküller, yüksek moleküler ağırlıklı proteinlere kıyasla jel içinde daha hızlı göç eder. Böylece yüksek ağırlıklı proteinler kuyulara yakın kalır.
2D Jel Elektroforez Nedir?
2D jel elektroforezi veya iki boyutlu jel elektroforezi, proteinleri iki özelliğe göre ayırır. İki özellik, proteinin izoelektrik noktası ve moleküler ağırlıktır. Bu protein ayırma yöntemi, protein ayrımının çözünürlüğünü arttırır. Proteinin izoelektrik noktası, proteinin nötr olduğu pH'a bağlıdır.
Şekil 02: 2D Jel Elektroforezi
Böylece, 2D jel elektroforezinde, proteinin birinci boyutta sabit bir pH gradyanı üzerinde çalışmasına izin verilir. İkinci boyutta, proteinler dikey veya yatay poliakrilamid jel elektroforezi kullanılarak ayrılır. Böylece proteinler ikinci boyutta moleküler ağırlıklarına göre ayrılırlar.
Ayrıca, bu jel elektroforezi yöntemi, protein ayrımının çözünürlüğünü arttırır. Bu nedenle, ayrılan proteinler daha saftır. Ancak tekniğin maliyeti tek boyutlu jel elektroforezinden çok daha yüksektir.
1D ve 2D Jel Elektroforez Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Her iki teknik de proteinleri ayırır.
- Dolayısıyla, proteinleri karakterize etmede önemlidirler.
1D ve 2D Jel Elektroforez Arasındaki Fark Nedir?
1D ve 2D jel elektroforezi arasındaki temel fark, 1D jel elektroforezi proteinleri yalnızca moleküler ağırlığa göre ayırırken, 2D jel elektroforezi proteinleri hem izoelektrik noktasına hem de moleküler ağırlığa göre ayırır. 1D ve 2D jel elektroforezi arasındaki bu temel fark nedeniyle, proteinlerin ayrılmasının çözünürlüğü ve iki tekniğin maliyeti de değişir.2D jel elektroforezi, 1D jel elektroforezinden daha yüksek çözünürlük gösterir. Ancak 2D jel elektroforezi, 1D jel elektroforezinden daha maliyetlidir.
Aşağıdaki infografik, 1D ve 2D jel elektroforezi arasındaki farkı özetler.
Özet – 1D ve 2D Jel Elektroforez
Proteinlerin ayrılması birçok faktöre bağlıdır. 1D jel elektroforezi, proteinleri yalnızca moleküler ağırlığa göre ayırır. Bununla birlikte, iki boyutlu veya 2 boyutlu jel elektroforezi, protein ayrımının çözünürlüğünü arttırır. Ayrıca, 2D jel elektroforezi, proteinleri izo-elektrik noktasına ve moleküler ağırlığa göre ayırır. Bu nedenle, bu veriler proteinlerin aşağı yönde işlenmesi ve proteomik alanında önemlidir. Bu nedenle, 1D ve 2D jel elektroforezi arasındaki farkın özeti budur.
