Jel ve kağıt elektroforezi arasındaki temel fark, jel elektroforezinde ayırma ortamının agaroz jel olması, kağıt elektroforezinde ayırma ortamının ise bir tampon çözeltisine batırılmış bir kağıt şerit olmasıdır.
Elektroforez, o numunede bulunan kimyasal türlerin elektriksel özelliklerini kullanarak bir numuneyi analiz etmek için yararlı olan analitik bir tekniktir. Burada, analiz edilen ortamdaki dağılmış çözünen maddenin hareketini gözlemleyebiliriz. Bu nedenle, kimyasal türlerin ortama göre hareketini belirleyebiliriz. Jel elektroforezi ve kağıt elektroforezi kimyada iki önemli tekniktir.
Jel Elektroforezi Nedir?
Jel elektroforezi, büyüklük ve yüke bağlı olarak makromoleküllerin ayrılması ve analizi yöntemi olarak tanımlanabilir. Bu bağlamda makromoleküller, DNA, RNA, proteinler ve bunların parçalarına atıfta bulunabilir. Bu yöntem, klinik kimyada proteinlerin yük veya boyuta göre ayrılması için yararlıdır. Ek olarak, DNA ve RNA fragmanlarının boyutunu tahmin etmek için karışık bir DNA ve RNA fragmanı popülasyonunun uzunluklarına göre ayrılması için biyokimya ve moleküler biyolojide önemlidir. Ayrıca, proteinleri yüklerine göre ayırmak için kullanabiliriz.
Şekil 01: Jel Elektroforez Aletleri
Negatif yüklü moleküllerin bir agaroz matrisi veya diğer maddeler yoluyla hareketi için bir elektrik alanı uygulayarak nükleik asit moleküllerini ayırabiliriz. Bu süreçte, daha kısa moleküller daha hızlı hareket ederken, daha uzun moleküller daha yavaş hareket edebilir. Bunun nedeni, daha kısa moleküllerin jel gözeneklerinden kolayca geçebilmesidir. Parçaların gözeneklerden bu hareketine “eleme” diyoruz. Ayrıca, proteinler jel gözeneklerinden elenemeyecek kadar büyük olduğundan, genellikle bu yöntemden proteinleri boyutlarına göre ayıramayız. Ancak bu işlemi nanoparçacıkları ayırmak için kullanabiliriz.
Kağıt Elektroforezi Nedir?
Kağıt elektroforezi, tampon çözeltisine batırılmış filtre kağıdı gezileri kullanılarak ayırma olarak tanımlanabilir. Genellikle tampon çözelti olarak dietilbarbitürik asit ve alkali içinde çözülmüş barbitürik asit kullanırız. Bu tampon çözeltinin pH değeri pH 8.6'dır. Ayrıca, kağıda az miktarda serum koyabiliriz ve ardından birkaç saat boyunca içinden bir doğru akım geçirilir.
Kağıt elektroforezi, amino asitler ve küçük proteinler dahil olmak üzere küçük, yüklü moleküllerin ayrılması için önemlidir. Burada bir filtre kağıdı şeridini tamponla nemlendirip şeridin uçlarını elektrot içeren tampon haznelerine batırmamız gerekiyor. Bu yöntemi kullanan ilk kişi 1937'de Konig'di. Bulgularında, zon elektroforezi için kağıtla ıslatılmış bir tampon tanıttı ve ayrıca UV tespiti önerdi.
Jel ve Kağıt Elektroforezi Arasındaki Fark Nedir?
Elektroforez, o numunede bulunan kimyasal türlerin elektriksel özelliklerini kullanarak bir numuneyi analiz etmek için yararlı olan analitik bir tekniktir. Jel elektroforezi ve kağıt elektroforezi iki önemli elektroforez yöntemidir. Jel ve kağıt elektroforez arasındaki temel fark, jel elektroforezinde ayırma ortamının agaroz jel olması, kağıt elektroforezinde ayırma ortamının ise bir tampon çözeltisine batırılmış bir kağıt şerit olmasıdır.
Aşağıda, yan yana karşılaştırma için jel ve kağıt elektroforezi arasındaki farkın tablo şeklinde bir özeti bulunmaktadır.
Özet – Jel ve Kağıt Elektroforezi
Jel elektroforezi, boyut ve yüke bağlı olarak makromoleküllerin ayrılması ve analizi yöntemidir, kağıt elektroforezi ise tampon çözeltiye batırılmış filtre kağıdı gezileri kullanılarak ayırmadır. Jel ve kağıt elektroforez arasındaki temel fark, jel elektroforezinde ayırma ortamının agaroz jel olması, kağıt elektroforezinde ayırma ortamının ise bir tampon çözeltisine batırılmış bir kağıt şerit olmasıdır.
