Oligopeptit ve polipeptit arasındaki temel fark, oligopep titlerin birkaç amino asit kalıntısı içermesine karşın, polipep titlerin çok sayıda amino asit kalıntısı içermesidir.
Oligopep titler ve polipep titler terimleri, protein kategorisine girer. Pep titler, amino asitlerin kısa zincirleridir. Amino asitler birbirlerine peptit bağları ile bağlanır. Bu nedenle, bu pep titleri, bu pep titlerde bulunan amino asitlerin sayısına göre kategorize edebiliriz. Ör. dipep titler, tripep titler, tetrapep titler, oligopep titler ve polipep titler.
Oligopeptid nedir?
Oligopeptid, molekül başına az sayıda amino asit içeren bir amino asit zinciridir. Bu moleküllere genellikle genel bir terim olarak "peptidler" diyoruz. Bu peptit moleküllerinde bulunan amino asit kalıntılarının sayısı iki ila yirmi amino asit arasında değişebilir. Oligopeptidler ayrıca dipep titler, tripep titler vb. gibi bazı küçük peptit formlarını da içerebilir. Doğal olarak oluşan oligopep titlerin bazı yaygın örnekleri arasında mikroviridin, siyanopeptolinler, mikrosistinler vb. bulunur.
Şekil 01: Bir Tripeptidin Yapısı
Bu oligopep titler, ribozomal olmayan peptit sentazları veya NRPS tarafından üretilir. Ama bazı istisnalar var. Örneğin, siklamitler ve mikroviridin, ribozomik yollardan sentezlenir. Oligopeptidlerin izolasyon süreci, oligopeptid zenginleştirme, saflaştırma ve tanımlamayı içerir. Tanımlama işlemi için jel kromatografisi, HPLC, HPLC-kütle spektroskopisi, iyon değişim kromatografisi vb. kullanabiliriz.
Polipeptid nedir
Bir polipeptit, çok sayıda amino asit içeren bir amino asit kalıntıları zinciridir. Bir protein, bir veya daha fazla polipeptit zinciri içerir. Bu polipeptit zincirlerinde amino asitler, bir tür kovalent kimyasal bağ olan peptit bağları yoluyla birbirine bağlanır. Her polipeptit zinciri iki terminal içerir: N-terminali ve C-terminali. N-terminali, bir serbest amino grubu ile biten amino-terminali iken, C-terminali, bir serbest karboksil grubu ile biten karboksil-terminalidir. Bir peptitte bulunan amino asitlerin dizisi, şablon ipliğin çevrilmesi yoluyla polipeptit veya proteinin üretiminde yer alan mRNA'daki kodonlar tarafından belirlenir.
Bir proteindeki polipep titlerin sayısına ve düzenine göre, aşağıdaki gibi dört ana protein yapısı türü vardır:
- Birincil yapı – Bir proteinin birincil yapısı, aynı zincirdeki bazı amino asitler arasında katlanmış bir yapı oluşturan disülfid köprülerine sahip tek bir polipeptit zinciri içerir.
- İkincil yapı – Bir proteinin ikincil yapısının iki ana formu vardır: alfa sarmal yapısı ve beta yaprağı yapısı.
Şekil 02: Alfa Sarmal Yapısı
- Üçüncül yapı – Bu, çok katlı bir ağ yapısıdır. Bu yapı çok önemlidir çünkü bir proteinin işlevini belirler.
- Kuaterner yapı – Bu, birbirine bağlı iki veya üç polipeptit zincirinden oluşan oldukça karmaşık bir yapıdır.
Oligopeptid ve Polipeptid Arasındaki Fark Nedir?
Oligopep titler ve polipep titler, iki farklı protein kategorisidir. Protein moleküllerinde bulunan amino asit kalıntılarının sayısına bağlı olarak birbirlerinden farklılık gösterirler. Bu nedenle, oligopeptit ve polipeptit arasındaki temel fark, oligopep titlerin birkaç amino asit kalıntısı içermesine karşın, polipep titlerin çok sayıda amino asit kalıntısı içermesidir.
Aşağıdaki infografik, oligopeptit ve polipeptit arasındaki farkı özetler.
Özet – Oligopeptid ve Polipeptid
Oligopep titler ve polipep titler, iki farklı protein kategorisidir. Bu protein moleküllerinde bulunan amino asit kalıntılarının sayısına bağlı olarak birbirlerinden farklılık gösterirler. Yani, oligopeptit ve polipeptit arasındaki temel fark, oligopep titlerin birkaç amino asit kalıntısı içermesine karşın polipep titlerin çok sayıda amino asit kalıntısı içermesidir.
