Korunmuş ve konsensüs sekansı arasındaki temel fark, korunmuş sekans, nesiller boyunca farklı veya aynı türlerde meydana gelen benzer nükleik asit veya amino asit sekanslarına atıfta bulunurken, konsensüs sekansı yaygın olarak karşılaşılan bir nükleotid sekansı veya bulunan amino asit sekansıdır. yüksek oranda korunmuş bir DNA veya RNA veya protein bölgesinde.
Organizmalar hem benzer hem de farklı özelliklere sahiptir. Organizmalar arasındaki ilişkileri incelerken ve onları sınıflandırırken, organizmaların genomu veya genetik yapısı çok önemlidir. Farklı organizmalar arasında ortak olan bazı nükleotid veya amino asit dizileri vardır. Korunmuş bir dizi, türler arasında tutarlı olan bir nükleik asit veya amino asit dizisidir. Bu nedenle filogenetik ağaçlar oluştururken filogenetik olarak önemlidirler. Korunmuş dizilerde, daha yaygın olarak bulunan spesifik nükleotid dizileri vardır. Konsensüs dizileri olarak bilinirler.
Korunan Dizi Nedir?
Korunmuş bir dizi, türler arasında benzer olan bir nükleik asit dizisi veya amino asit dizisidir. Bu nedenle, evrim boyunca türler arasında tutarlıdır. Genel olarak, bu diziler doğal seçilim tarafından korunur. Filogenetik ağacın çok gerilerinde değişmeden kalırlar. Bu nedenle, korunan diziler filogenetik ağaçların oluşturulmasında önemlidir. Yüksek düzeyde korunmuş dizilerin genellikle önemli bir işlevsel değere sahip olduğuna inanılmaktadır. Genetik hastalıkların belirlenmesinde de faydalıdırlar. Bununla birlikte, korunan diziler, kodlayan veya kodlamayan nükleik asit dizileri olabilir. Ek olarak, korunmuş diziler daha yavaş mutasyon oranları gösterir. Bu nedenle, bileşimlerinde çok az değişiklik gösterirler; bazen nesiller boyunca değişiklik göstermezler.
Şekil 01: Korunmuş Dizi
Ribozomların RNA bileşenleri yaşamın tüm alanlarında bulunur, ökaryotlardaki homeobox dizileri ve bakterilerdeki tmRNA, yüksek düzeyde korunmuş dizilerin birkaç örneğidir. Biyoinformatik yaklaşımlar, özellikle dizi hizalama aracı kullanıldığında, korunan dizilerin tanımlanması kolaydır. Ayrıca, çoklu dizi hizalaması, korunan dizilerin görselleştirilmesini kolaylaştırır.
Uzlaşma Sırası Nedir?
Konsensüs dizisi, DNA veya RNA'nın belirli bir korunmuş bölgesinde yaygın olarak bulunan bir dizidir. Çok spesifik bir nükleotid dizisidir. Örnek olarak, yüksek oranda korunmuş diziler olan E. coli promotörlerinde -10 as TATAAT'ta (Pribnow kutusu) bir konsensüs dizisi vardır. Benzer şekilde, başka bir konsensüs dizisi vardır: -35'te de E. coli promotörlerinde TTGACA. Konsensüs dizileri "kutular" olarak da bilinir.
Şekil 02: Konsensüs Sırası
DNA ve RNA'ya ek olarak, proteinler ayrıca amino asitlerin konsensüs dizilerine sahiptir. Protein bağlanma bölgeleri genellikle konsensüs dizileri ile temsil edilir. Kısıtlama enzimleri ayrıca konsensüs dizilerine sahiptir. Ayrıca, ekleme yerleri aynı zamanda konsensüs dizileridir. Korunan dizilere benzer şekilde, konsensüs dizileri biyoinformatik araçlarla hesaplanabilir ve görselleştirilebilir.
Korunan ve Konsensüs Dizisi Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Korunmuş ve konsensüs dizileri, türler arasında yaygın olan nükleik asit veya amino asit dizileridir.
- Hem korunmuş hem de konsensüs dizileri biyoinformatik araçlarla görselleştirilebilir.
- Moleküler biyolojide yaygın olarak kullanılırlar.
Korunan ve Konsensüs Sırası Arasındaki Fark Nedir?
Korunan sekans, türler arasında tutarlı olan bir nükleik asit veya amino asit sekansıdır, oysa konsensüs sekansları çok spesifiktir ve belirli bir korunmuş bölgede yaygın olarak bulunan bazlar veya amino asitlerdir. Bu, korunmuş ve konsensüs dizisi arasındaki temel farktır. Ayrıca, korunmuş ve konsensüs dizileri arasındaki diğer bir fark, korunmuş dizilerin filogenetik olarak önemli olmalarıdır, oysa konsensüs dizileri genellikle protein bağlama bölgeleri, ekleme bölgeleri, kısıtlama enzimi kesme bölgeleri vb.dir.
Özet – Korunan ve Konsensüs Sırası
Korunmuş diziler, canlı türler arasında benzer olan nükleik asit veya protein dizileridir. Bir promotör, ribozom bağlanma bölgesi, bir replikasyon orijini ve histon proteininin amino asit dizisi, korunmuş dizilerin birkaç örneğidir. Buna karşılık, konsensüs dizileri, belirli bir korunmuş dizide daha yaygın olarak bulunan spesifik bazlar veya amino asitlerdir. -10 kutu, -35 kutu E. coli promotörü, protein bağlama bölgeleri, ekleme bölgeleri ve bölgeleri tanıyan kısıtlama enzimleri, konsensüs dizilerinin birkaç örneğidir. Bu nedenle, korunan ve konsensüs dizisi arasındaki farkın özeti budur.
