Entegral periferik ve yüzey proteinleri arasındaki temel fark, integral ve yüzey proteinlerinin plazma zarına kalıcı olarak gömülü olması, periferik proteinin ise plazma zarıyla geçici olarak ilişkili olmasıdır.
Plazma zarı fosfolipidlerden başka moleküller içerir. Bu moleküller proteinler veya karbonhidratlar olabilir. Plazma zarı, hücre fonksiyonunda çok önemli bir rol oynayan belirli protein türlerini içerir. Bir zar proteini, bir hücrenin veya bir organelin hücre zarına bağlanan veya onunla birleşen bir moleküldür. Membranla olan ilişkilerine göre çeşitli tiplere ayrılabilirler. İntegral periferik ve yüzey proteinleri, hücre aktivitesi için çok önemli olan zar proteinleridir.
İntegral Proteinler nelerdir?
İntegral protein, kendini hücre zarına kalıcı olarak kilitleyen bir zar proteinidir. Bu nedenle biyolojik membranların kalıcı bileşenleridir. İntegral protein esas olarak transmembran proteinler ve integral monotopik proteinler olarak iki tipte sınıflandırılır. Transmembran membran proteini tüm plazma zarını kaplar. Öte yandan, integral monotopik protein, zara yalnızca bir taraftan kalıcı olarak bağlanır. Şimdiye kadar yaklaşık 160 farklı integral proteinin üç boyutlu yapısı nükleer manyetik rezonans ile atomik çözünürlükte belirlendi.
Şekil 01: Plazma Membran
Bu proteinleri incelemek, ekstraksiyon ve kristalizasyonlarındaki zorluklar nedeniyle çok zordur. Ayrıca, bu integral proteinlerin birçoğunun yapıları, protein veri bankalarında (PDB) kolayca bulunabilir. İntegral membran proteini birçok farklı işlevi yerine getirir. Taşıyıcılar, bağlayıcılar, kanallar, reseptörler, enzimler, yapısal zar alanları ve hücre yapışma proteinleri olarak işlev görebilir. Ayrıca, enerjinin birikmesini ve iletilmesini de içerir. Bazı örnekler, hücre yapışma proteinleri, rodopsin ve glikoz permeaz, vb.
Çevresel Proteinler nelerdir?
Çevresel protein, plazma zarıyla geçici olarak ilişki kuran bir zar proteinidir. Normalde lipid çift tabakasının çevresel bölgelerine nüfuz etmek için bütünleyici zar proteinlerine bağlanır. Örneğin, iyon kanallarının ve transmembran reseptörlerinin düzenleyici protein alt birimleri, periferal proteinler olarak tanımlanabilir. Bu proteinler, hidrofobik, elektrostatik ve diğer kovalent olmayan etkileşimlerin bir kombinasyonu yoluyla integral proteinlere veya lipid çift katmanlarına bağlanır.
Çevresel protein, polar bir reaktifle (yüksek pH veya yüksek tuz konsantrasyonuna sahip çözelti) işlemin ardından ayrılabilir. Eklenen yağ asidi, diasilgliserol veya prenil zincirleri ile post-translasyonel olarak modifiye edilebilirler. Ayrıca, periferal proteinin ana işlevleri hücre desteği, iletişim, enzimler ve elektron transferi gibi moleküler transferdir.
Yüzey Proteinleri nedir?
Yüzey proteinleri, daha karmaşık organizmaların hücre zarı tabakasına kalıcı olarak gömülü olan veya bu tabakayı kapsayan zar proteinleridir. Çoğu hücre yüzeyi proteini bir karbonhidrat bileşeni içerir. Yüzey proteini, bir hücrenin çevresindeki ortamla etkileşime girme biçiminin ayrılmaz bir parçasıdır.
Bazı yüzey proteinleri zarın dış tarafına maruz kalır ve dış yüzeylerine karbonhidrat grupları bağlamıştır. Bunlara glikoproteinler denir. Yapısal bileşenler, yağlayıcılar, hormonlar, enzimler, taşıma molekülleri, reseptörler, antifriz proteinleri, gelişimin düzenlenmesi, homeostaz vb. gibi farklı işlevleri vardır. Ayrıca, hücre yüzey proteini biyomedikal bilimde çok önemlidir, çünkü onaylanmış insan ilaçlarının %66'sı listelenmiştir. DrugBank veri tabanında bir hücre yüzeyi proteinini hedefleyin.
İntegral Periferik ve Yüzey Proteinleri Arasındaki Benzerlikler
- İntegral periferik ve yüzey proteinleri zar proteinleridir.
- Hepsi amino asitlerden oluşur.
- Hepsi biyolojik hücrelerin lipid çift tabakasına bağlıdır.
- Hücrenin hayatta kalmasında çok önemlidirler.
İntegral Periferik ve Yüzey Proteinleri Arasındaki Fark
İntegral ve yüzey proteinleri kalıcı olarak plazma zarına gömülüdür, periferik protein ise geçici olarak plazma zarıyla ilişkilidir. Bu, integral periferik ve yüzey proteinleri arasındaki temel farktır.
Aşağıdaki infografik, integral periferik ve yüzey proteinleri arasındaki daha fazla farkı tablo şeklinde listeler.
Özet – İntegral ve Periferik ve Yüzey Proteinleri
Zar proteinleri, temel hücresel ve fizyolojik süreçlerde yer alan önemli bir protein sınıfını temsil eder. Bir zar proteini, bir hücrenin veya bir organelin hücre zarına bağlı veya onunla ilişkili bir moleküldür. Membranla olan ilişkilerine göre çeşitli tiplere ayrılabilirler. İntegral periferik ve yüzey proteinleri çok önemli zar proteinleridir. İntegral ve yüzey proteinleri, plazma zarına kalıcı olarak gömülür. Buna karşılık, periferik protein geçici olarak plazma zarı ile ilişkilidir. Bu nedenle, integral periferik ve yüzey proteinleri arasındaki farkın özeti budur.
