RNA enterferansı ile antisens oligonükleotit arasındaki temel fark, RNA enterferansının çift sarmallı bir RNA tarafından gen ekspresyonunun diziye özgü baskılanmasını içeren bir teknik olmasıdır. tek sarmallı bir DNA oligonükleotidi tarafından gen ifadesinin diziye özgü baskılanmasını içeren bir teknik.
Gen susturma veya bastırma, belirli bir genin ifadesini önlemek için biyolojik bir hücrede gen ifadesini düzenlemenin bir yoludur. Normalde, genler susturulduğunda ifadeleri azalır. Buna karşılık, genler devre dışı bırakıldıklarında organizmanın genomundan tamamen silinirler; dolayısıyla ifadesi olmayacaktır. Bazen gen susturma, gen yıkımı ile aynı kabul edilir. Bunun nedeni, genleri susturmak için kullanılan RNAi, antisens oligonükleotid ve CRISPR gibi gen susturma yöntemlerinin gen ekspresyonunun en az %70 oranında azalmasına neden olmasıdır. RNA interferansları ve antisens oligonükleo titler iki önemli gen susturma tekniğidir.
RNA Girişimi Nedir?
RNA interferansı (RNAi), çift sarmallı RNA moleküllerinin gen ekspresyonunun diziye özgü baskılanmasını gerçekleştirdiği biyolojik bir süreçtir. Andrew Fire ve Craig C. Mello, nematod solucanı: Caenorhabditis elegans'ta RNA etkileşimi konusundaki olağanüstü çalışmaları nedeniyle 2006'da Tıp dalında Nobel ödülünü paylaştılar. RNA etkileşimi üzerine bu öncü araştırma ilk olarak onlar tarafından 1998'de yayınlandı. Genellikle RNAi yolu, hayvanlar da dahil olmak üzere birçok ökaryotik organizmada bulunur.
Şekil 01: RNA enterferansı
İki merkezi molekül, microRNA (miRNA) ve küçük enterferans RNA (siRNA), RNAi yolunda yer alır. Dicer adlı bir enzim bu yolu indükler. Dicer, uzun çift sarmallı RNA'yı kısa çift sarmallı parçalara (21 nükleotid siRNA) ayırır. Daha sonra her bir siRNA, yolcu sarmalı ve kılavuz sarmal olarak bilinen iki tek sarmallı RNA'ya çözülür. Kılavuz iplik RNA ile indüklenen susturma kompleksine (RISC) dahil edilirken yolcu ipliği bozulur. RISC'de, RISC kompleksinin katalitik bileşeni olan Argonaute'u (Ago2) tetikleyen tamamlayıcı mRNA ile iplik çiftlerini yönlendirin. Daha sonra Argonaute, mRNA molekülünü parçalar. siRNA'dan farklı olarak, mikroRNA (miRNA), mRNA'nın 3' çevrilmemiş bölgesini hedefler ve burada kusurlu tamamlayıcılık ile bağlanırlar. Bu, çeviri için mRNA'nın ribozomlara erişimini engeller.
Antisens Oligonükleotid nedir?
Antisense oligonükleotit, tek sarmallı bir DNA oligonükleotidi tarafından gen ekspresyonunun diziye özgü baskılanmasını içeren bir tekniktir. Bu tekniğe antisens tedavisi da denir. Bu, haberci RNA'yı (mRNA) hedeflemek için antisens oligonükleotidleri (ASO'lar) kullanan bir tedavi şeklidir. Antisens oligonükleo titler, pre mRNA'nın ribonükleaz H aracılı bozunması, doğrudan sterik blokaj ve ekson içeriğinin pre mRNA'ya bağlanma yeri bağlanması yoluyla modülasyonu gibi çeşitli mekanizmalar kullanarak mRNA ekspresyonunu değiştirir.
Şekil 02: Antisens Oligonükleotid
Birkaç antisens oligonükleotit, Amerika Birleşik Devletleri ve Avrupa Birliği tarafından hastalık tedavisi için onaylanmıştır. Ayrıca, antisens oligonükleotidler, Batten hastalığı, sitomegalovirüs retiniti, Duchenne musküler distrofisi, ailesel şilomikronemi sendromu, ailesel hiperkolesterolemi, kalıtsal transtiretin aracılı amiloidoz ve spinal müsküler atrofi dahil olmak üzere birçok hastalık için bir tedavi olarak zaten onaylanmıştır.
RNA Girişimi ve Antisens Oligonükleotid Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- RNA interferansı ve antisens oligonükleotid, iki önemli gen susturma tekniğidir.
- Her iki teknik de mRNA moleküllerini hedefler.
- Sekansa özgü tekniklerdir.
- Her iki teknik de birçok hastalık için tedavi olarak kullanılır.
- Her ikisi de gen ifadesini engeller.
RNA Girişimi ve Antisens Oligonükleotid Arasındaki Fark Nedir?
RNA interferansı, çift iplikli bir RNA tarafından gen ekspresyonunun diziye özgü baskılanmasını içeren bir tekniktir, antisens oligonükleotit ise tek iplikli bir DNA oligonükleotidi tarafından gen ekspresyonunun diziye özgü baskılanmasını içeren bir tekniktir. Bu, RNA interferansı ile antisens oligonükleotid arasındaki temel farktır.
Aşağıdaki infografik, yan yana karşılaştırma için RNA interferansı ve antisens oligonükleotit arasındaki farkları tablo şeklinde sunar.
Özet – RNA Girişimi ve Antisens Oligonükleotid
Gen susturma teknikleri, hücresel gen ekspresyonunu az altır. RNA interferansı ve antisens oligonükleotid, iki önemli gen susturma tekniğidir. RNA enterferansı, çift sarmallı bir RNA tarafından gen ekspresyonunun diziye özgü baskılanmasını içeren bir tekniktir, antisens oligonükleotit ise tek sarmallı bir DNA oligonükleotidi tarafından gen ifadesinin diziye özgü baskılanmasını içeren bir tekniktir. Böylece bu, RNA interferansı ile antisens oligonükleotid arasındaki farkı özetler.
