pBR322 ve pUC19 arasındaki temel fark, pBR322'nin 4361 baz çifti uzunluğunda bir plazmit vektörü, pUC19'un ise 2686 baz çifti uzunluğunda bir plazmit vektörü olmasıdır.
Klonlama vektörü, bir organizmada kararlı bir şekilde korunabilen küçük bir DNA parçasıdır. Aynı zamanda, klonlama amacıyla içine yabancı bir DNA parçasının yerleştirilebileceği küçük bir DNA parçasıdır. Bir vektör, kısıtlama bölgeleri, seçilebilir bir işaretleyici, raportör gen ve ifade unsuru gibi yabancı bir DNA parçasının vektörlere uygun şekilde yerleştirilmesine izin veren önemli özellikler içerir. Klonlama ilk olarak E kullanılarak yapıldı.koli. E. coli için klonlama vektörleri, plazmitleri, bakteriyofajları, kozmitleri ve bakteriyel yapay kromozomları (BAC) içerir. En yaygın olarak kullanılan vektörler, genetik olarak tasarlanmış plazmitlerdir. pBR322 ve pUC19, iki tür plazmit vektörüdür.
pBR322 nedir?
pBR322 bir plazmit vektörüdür. E. coli için yaygın olarak kullanılan ilk klonlama vektörlerinden biridir. Bu vektör ilk olarak 1977'de San Francisco'daki California Üniversitesi'ndeki Herbert Boyer laboratuvarında oluşturuldu. 4361 baz çifti uzunluğunda dairesel çift sarmallı bir DNA'dır.
Şekil 01: pBR322
Bu plazmit vektörünün özel özellikleri vardır. Normalde, iki antibiyotik direnç geni vardır: ampisilin direnci (AmpR) proteinini kodlayan gen bla ve tetrasiklin direncini kodlayan gen tetA (TetR) proteini. Ayrıca, pMB1 replikasyonunun kaynağını içerir. Bu plazmit vektörü ayrıca plazmit kopya sayısının bir sınırlayıcısını kodlayan rop genine sahiptir. Ayrıca, bu vektör, 40'tan fazla kısıtlama enzimi için benzersiz kısıtlama bölgelerine sahiptir. Bu kırk kısıtlama alanından on biri TetR gen içinde yer alır. TetRgen promotörü içinde HindIII ve ClaI kısıtlama enzimleri için iki kısıtlama bölgesi vardır. Ayrıca, AmpR geninde çok önemli altı kısıtlama bölgesi vardır. pBR322, düşük kopya numaralı bir klonlama vektörüdür. Bakteri hücresi başına yaklaşık olarak 20 plazmit kopyası sağlar. Vektörün moleküler ağırlığı 2.83×106 d altondur.
pUC19 nedir?
pUC19, uzunluğu 2686 baz çifti olan bir plazmit vektörüdür. Joachim Messing ve iş arkadaşları tarafından oluşturulan plazmit vektör serilerinden biridir. Bu plazmit serisi üzerindeki ilk çalışmalar California Üniversitesi'nde yapıldı. Dairesel çift sarmallı bir DNA'dır.
Şekil 02: pUC19
Bu plazmit vektörü de önemli özellikler içerir. β glaktosidaz (lacz) geninin N terminal parçasına sahiptir. Ayrıca çoklu klonlama sitesi (MCS) bölgesine sahiptir. Bu bölge lacz geninin 6 ve 7 kodonlarına bölünmüştür. MCS bölgesi, birçok kısıtlama endonükleaz kısıtlama bölgesi sağlar. p glaktosidaz genine ek olarak, pUC19 ayrıca bir ampisilin direnç genini (AmpR) kodlar. Ayrıca, replikasyonun kaynağı plazmit pMB1'den türetilir. pUC19 küçük olmasına rağmen kopya sayısı yüksektir (bakteri hücresi başına 500-700 kopya). Bu plazmit vektörünün moleküler ağırlığı 1.75×106 d altondur.
pBR322 ve pUC19 Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- pBR322 ve pUC19, iki tür plazmit vektörüdür.
- Koli için popüler klonlama vektörleridir.
- Her iki plazmit vektörü, plazmit pMB1'in replikasyon formunun aynı orijinine sahiptir.
- Bu vektörlerin birden fazla kısıtlama sitesi var.
- Her iki plazmit vektörü de seçilebilir bir işaretleyici olarak bir ampisilin direnç genine sahiptir.
pBR322 ve pUC19 arasındaki fark nedir?
pBR322 4361 baz çifti uzunluğunda bir plazmit vektörüyken, pUC19 2686 baz çifti uzunluğunda bir plazmit vektörüdür. Bu nedenle, pBR322 ve pUC19 arasındaki temel fark budur. Ayrıca, pBR322 düşük kopya numaralı bir plazmit vektörüdür, pUC19 ise yüksek kopya numaralı bir plazmit vektörüdür.
Aşağıdaki infografik, yan yana karşılaştırma için pBR322 ve pUC19 arasındaki farkları tablo biçiminde sunar.
Özet – pBR322 ve pUC19
E.coli için en yaygın kullanılan klonlama vektörleri, genetik olarak tasarlanmış plazmitlerdir.pBR322 ve pUC19, iki tip plazmit vektörüdür. pBR322, 4361 baz çifti uzunluğunda bir plazmit vektörüyken, pUC19, 2686 baz çifti uzunluğunda bir plazmit vektörüdür. Bu, pBR322 ve pUC19 arasındaki temel farktır.
