Sigma faktörü ve rho faktörü arasındaki temel fark, sigma faktörünün bakterilerde transkripsiyonun başlaması için gerekli bir protein iken rho faktörünün bakterilerde transkripsiyonun sonlandırılması için gerekli bir protein olmasıdır.
Sigma faktörü ve rho faktörü, bakteriyel transkripsiyon için iki önemli faktördür. Bakteriyel transkripsiyon, bir bakteri DNA parçasının yeni yapılmış bir mRNA dizisine (haberci RNA) kopyalandığı bir işlemdir. Bu işlem, RNA polimeraz olarak bilinen bir enzim tarafından katalize edilir. Bakteriler, çevrelerine uygun şekilde yanıt verebilmek için büyük ölçüde transkripsiyona ve çeviriye güvenirler. Bakteriyel RNA polimeraz, bir çekirdek ve bir holoenzim yapısından oluşur. Çekirdek β, β′, α ve 2ω alt birimlerini içerirken holoenzim sigma faktörünü içerir. Ayrıca, rho faktörü olarak bilinen RNA polimeraza yardımcı bir faktör de bakteriyel transkripsiyon için çok önemlidir.
Sigma Faktörü Nedir?
Sigma faktörü veya özgüllük faktörü, bakterilerde transkripsiyonun başlatılması için gerekli bir proteindir. Bakteriyel transkripsiyon başlatma faktörüdür. Bu faktör, transkripsiyon sırasında RNA polimeraz enziminin, promotör bölge olarak adlandırılan DNA'nın spesifik bir bölgesine bağlanmasını sağlar. Sigma faktörü normalde arkeal transkripsiyon faktörü B'ye ve ökaryotik transkripsiyon faktörü TF11B'ye homologdur. Ayrıca, belirli bir genin spesifik sigma faktörü, gene ve çevresel sinyallere bağlı olarak değişir. Destekleyiciler, kendisiyle ilişkili sigma faktörüne bağlı olarak RNA polimeraz tarafından seçilir.
Şekil 01: Sigma Faktörü
Sigma faktörü, plastid kodlu polimerazın (PEP) bir parçası olarak bitkilerin kloroplastında da bulunabilir. Sigma faktörü ve RNA polimeraz birlikte, RNA polimeraz holoenzimi olarak bilinir. Sigma faktörünün moleküler ağırlığı 70 kDa civarındadır. Transkripsiyonun başlamasından sonra, sigma faktörü kompleksten ayrılır. Daha sonra RNA polimeraz, transkripsiyon sona erene kadar uzamaya devam eder.
Rho Faktörü Nedir?
Rho faktörü, transkripsiyonun sonlandırılmasında rol oynayan prokaryotik bir proteindir. Rho faktörü genellikle transkripsiyon sonlandırıcı duraklama bölgesine bağlanır. Bu bölge, sitozin bakımından zengin guaninden fakir dizilerde açık okuma çerçevesinin yakınında tek iplikli RNA'nın açıkta kalan bir bölgesidir. Prokaryotlarda önemli bir transkripsiyon proteinidir. Escherichia coli'de rho faktörü, özdeş alt birimlerin yaklaşık 274.6 kDa heksameridir. Her alt birimin bir RNA bağlama alanı ve ATP hidroliz alanı vardır. Ayrıca, rho faktörünün işlevi sarmal aktivitedir.
Şekil 02: Rho Faktörü
Rho faktörü, RNA molekülüne bağlanır ve ardından RNA moleküllerinin yer değiştirmesine enerji sağlamak için ATPase aktivitesini kullanır. Rho faktörü, hibrit (RNA-DNA) dupleks yapısını çözdüğü RNA-DNA sarmal bölgesine ulaşana kadar translokasyon gerçekleştirir. Bu işlem, transkripsiyon işlemini sonlandıran sonlandırma bölgesinde RNA polimerazı duraklatır.
Sigma Faktörü ve Rho Faktörü Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Sigma faktörü ve rho faktörü, bakteriyel transkripsiyon için iki önemli faktördür.
- Her ikisi de yalnızca prokaryotlarda bulunur.
- Amino asitlerden oluşan proteinlerdir.
- Her ikisi de nükleik asit bağlayıcı proteinlerdir.
- Prokaryotlar, özel proteinler üretebilen ve çevrelerine özel olarak yanıt vermelerine yardımcı olan mRNA'yı üretmek için bu faktörlere büyük ölçüde güvenir.
Sigma Faktörü ve Rho Faktörü Arasındaki Fark Nedir?
Sigma faktörü, bakterilerde transkripsiyonun başlatılması için gerekli bir protein iken, rho faktörü, bakterilerde transkripsiyonun sonlandırılması için gerekli bir proteindir. Bu, sigma faktörü ile rho faktörü arasındaki temel farktır. Ayrıca, sigma faktörü bir DNA bağlayıcı proteindir, rho faktörü ise bir RNA bağlayıcı proteindir.
Aşağıdaki infografik, yan yana karşılaştırma için sigma faktörü ve rho faktörü arasındaki farkları tablo şeklinde sunar.
Özet – Sigma Faktörü ve Rho Faktörü
Transkripsiyon, DNA'daki bilgilerin mRNA (haberci RNA) adı verilen yeni bir moleküle kopyalandığı süreçtir. Bu m-RNA, nihai olarak belirli bir proteinin üretilmesinde rol oynar. Sigma faktörü ve rho faktörü, bakteriyel transkripsiyon için iki önemli faktördür. Onlar proteindir. Sigma faktörü, bakterilerde transkripsiyonun başlamasına katılır. Rho faktörü, bakterilerde transkripsiyonun sona ermesinden sorumludur. Bu nedenle, sigma faktörü ve rho faktörü arasındaki farkın özeti budur.
