Rho'ya bağlı ve Rho'dan bağımsız sonlandırma arasındaki temel fark, Rho'ya bağlı sonlandırmada, Rho faktörünün transkripte bağlanması ve şablon ile transkript arasındaki hidrojen bağlarını kırarak transkripsiyonu sonlandırmasıdır, Rho'dan bağımsız sonlandırma ise transkripsiyonu sonlandırır. bir saç tokası döngü yapısı ve ardından transkriptte U açısından zengin bölge üretilmesi.
Transkripsiyon, gen ifadesinin iki aşamasından biridir. Genin DNA dizisinde saklı olan genetik bilgiden bir mRNA dizisi üreten süreçtir. Transkripsiyon üç adımda gerçekleşir: başlatma, uzama ve sonlandırma. RNA polimeraz enzimi, genin promotör dizisine bağlanır ve RNA zincirinin sentezini katalize etmeye başlar. Sonlandırıcı dizi bulunana kadar, RNA polimeraz nükleotidleri ekler ve RNA zincirini oluşturur. Prokaryotlarda sonlandırma iki ana sonlandırma stratejisi aracılığıyla gerçekleşir: Rho'ya bağlı sonlandırma ve Rho'dan bağımsız sonlandırma. Rho faktörü, helikaz aktivitesine sahip bir proteindir.
Rho Bağımlı Sonlandırma Nedir?
Rho bağımlı sonlandırma, prokaryotlarda meydana gelen iki tip transkripsiyon sonlandırma stratejisinden biridir. Rho faktörü, helikaz aktivitesine sahip bir proteindir.
Şekil 01: Rho Bağımlı Sonlandırma
Rho proteini RNA transkriptine bağlanır ve RNA polimerazı boyunca 5'-3' yönünde hareket ederek DNA şablonu ile RNA transkripti arasındaki hidrojen bağlarının ayrışmasını teşvik eder. Rho faktörü, transkripsiyon balonuna ulaştığında, DNA/RNA hibridini çeker ve transkripsiyon balonundan transkripti serbest bırakır. Bu gerçekleştiğinde, transkripsiyonu sonlandırır.
Rho Bağımsız Sonlandırma Nedir?
Rho bağımsız sonlandırma, prokaryotik transkripsiyonu sonlandıran ikinci stratejidir. Genellikle, bir sonlandırıcı bölge, ters çevrilmiş bir tekrar dizisine sahiptir. Ters çevrilmiş tekrar dizisinden hemen sonra, Adenin açısından zengin bir bölge (AAAA) vardır. RNA polimeraz ilerlediğinde, bir mRNA dizisi üretir. Ters çevrilmiş tekrar dizisi bölgesinde iki bölge tamamlayıcı olduğundan, hidrojen bağından dolayı bir firkete ilmek yapısı oluşturur. Bir sonraki bölge U zengin bölgesi olacak. Firkete yapısı RNA polimeraz aktivitesini durdurur.
Şekil 02: Rho Bağımsız Sonlandırma
Ayrıca, U açısından zengin bölgelerde, transkriptin U bazları ile şablonun A bazları arasında zayıf etkileşimler vardır. Bu zayıf Adenin-Urasil bağları, DNA şablonunu ve RNA transkriptini destabilize eder ve birbirini ayırır. Sonunda, transkript, transkripsiyon sitesinden kurtulur.
Rho Dependent ve Rho Bağımsız Fesih Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Rho'ya bağlı ve Rho'dan bağımsız sonlandırma, prokaryotlarda bulunan iki ana sonlandırma stratejisidir.
- Her iki form da transkripsiyonu sonlandırmak için DNA şablonundan transkripti serbest bırakır.
Rho Dependent ve Rho Bağımsız Fesih Arasındaki Fark Nedir?
Rho'ya bağlı sonlandırmaya bir Rho proteini aracılık eder, Rho'dan bağımsız sonlandırmaya ise bir saç tokası ilmek yapısının oluşumu yoluyla gerçekleşir. Bu, Rho'ya bağlı ve Rho'dan bağımsız sonlandırma arasındaki temel farktır. Ayrıca, Rho proteini ATP enerjisini kullanırken Rho bağımsız sonlandırma, Rho proteinini içermez ve ATP enerjisini kullanmaz. Bu nedenle, bu aynı zamanda Rho bağımlı ve Rho bağımsız sonlandırma arasında önemli bir farktır.
Aşağıdaki infografik, Rho'ya bağlı ve Rho'dan bağımsız sonlandırma arasındaki farkla ilgili daha fazla karşılaştırma gösteriyor.
Özet – Rho Dependent vs Rho Bağımsız Fesih
Rho'ya bağlı ve Rho'dan bağımsız sonlandırma, prokaryotlarda meydana gelen iki ana transkripsiyon sonlandırma mekanizmasıdır. Bir Rho proteini, Rho bağımlı sonlandırmada transkripsiyon sonlandırmasından sorumludur. Buna karşılık, Rho'dan bağımsız sonlandırma, saç tokası ilmek yapısının oluşumu yoluyla gerçekleşir. Bu, Rho'ya bağlı ve Rho'dan bağımsız sonlandırma arasındaki temel farktır.
