SEC ve TAT yolu arasındaki temel fark, SEC yolunun katlanmamış proteinleri taşırken TAT yolunun katlanmış proteinleri taşımasıdır.
Protein sentezi ve taşıma mekanizmaları tüm hayvanlarda, bitkilerde, arkelerde ve bakterilerde ortaktır. Protein taşınması, proteinlerin hücresel veya hücre dışı bölmelerden diğerine hareketini ifade eder. SEC yolu ve TAT yolu, proteinlerin taşınmasında rol oynayan bu tür iki sistemdir. Bu sistemler, proteinleri ya sitoplazmik zar ya da plazma zarı boyunca taşır. Bu tür taşıma süreci, gelişmiş doğaya bağlı olarak organizmadan organizmaya değişir. SEC yolu, farklı alt kategorilerden ve daha gelişmiş sinyal sistemlerinden oluştuğu için TAT yolundan daha gelişmiştir. Her iki sistemin de taşıma yolları endositoz, ekzositoz, protein translokasyonu ve membran kaçakçılığı ile kolaylaştırılır.
SEC Yolu nedir?
SEC yolu veya salgı yolu, plazma zarına entegre edilen veya plazma zarı boyunca yer değiştiren çoğu protein için her yerde ve evrensel ihracat makinelerini içeren bir taşıyıcı yoldur. Bu, biyolojik sistemlerde proteinlerin serbest bırakıldıkları hücre zarına taşınmasını indükleyen önemli bir yoldur. Birçok protein için SEC yolu nispeten sabit bir oranda gerçekleşir. Proteinlerin sentezlenme hızı, taşıma hızını doğrudan etkiler. SEC yolu sırasında, proteinlerin taşınması katlanmamış bir şekilde gerçekleşir.
Şekil 01: SEC Yolu Organelleri
SEC yoluna hedeflenen proteinler iki gruptan oluşur. Bir grup protein, uygun protein katlanmasını ve modifikasyonunu (yerleşik proteinler) sağlamak için ER ve Golgi'de işlev gören proteinleri içerir. İkinci grup proteinler, ER ve Golgi'de işlenen ve plazma zarı, lizozomlar ve hücre dışı boşluk gibi sonraki bölümlere taşınan proteinleri içerir. Bu proteinler iki sinyal mekanizmasına sahiptir. Bir sinyal proteinlere salgı yoluna girme talimatını verirken, ikinci sinyal proteinlere onu yol içindeki belirli bir organelde lokalize etme talimatı verir.
TAT Yolu nedir?
TAT yolu veya ikiz arginin translokasyon yolu, bitkilerde, bakterilerde ve arkelerde bulunan bir protein taşıma yoludur. Bu yol boyunca, proteinler bir lipid membran çift tabakası boyunca katlanmış bir şekilde taşınır. Bitkilerde, TAT yolu kloroplastın tilakoid zarında bulunur. Burada proteinler tilakoid lümenine yer değiştirir. Bakterilerde sitoplazmik zarda bulunur ve proteinleri hücre zarfına taşır.
Şekil 02: TAT Yolundaki Proteinler
TAT yolu süreci sırasında, proteinlerin katlanması, sitoplazmaya yerleştirilen redoks kofaktörlerini içerdikleri için taşınmadan önce gerçekleşir. Katlama ayrıca aktif bölgeye yanlış metal iyon kofaktörünün eklenmesini önlemeye yardımcı olur. Bakteriler ve arkeler için TAT yolunun gereksinimi değişir. Bazı organizmalarda gerekli bir taşıma mekanizması iken bazılarında gerekli değildir. Bazı arkelerde ve bakterilerde TAT yolu tamamen yoktur. TAT yolu ayrıca membran kaçakçılığı, protein translokasyonu ve endositoz veya ekzositoz gibi temel taşıma mekanizmalarına da bağlıdır.
SEC ve TAT Yolu Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- SEC ve TAT yolları, ulaşım amaçları için yaşam sistemindeki temel bileşenlerdir.
- Proteinlerin taşınmasında görev alırlar.
- Ayrıca, her iki yol da belirli bir sinyalizasyon sistemine göre çalışır.
- Hem SEC hem de TAT yolları, ya membran kaçakçılığı, protein translokasyonu ve endositoz veya ekzositoz tarafından kolaylaştırılır.
SEC ve TAT Yolu Arasındaki Fark Nedir?
SEC ve TAT yolu arasındaki temel fark, SEC yolunun katlanmamış proteinleri, TAT yolunun ise katlanmış proteinleri taşımasıdır. SEC yolu, hayvanlarda en yaygın olanıdır. TAT yolu en çok bitkilerde, arkelerde ve bakterilerde yaygındır. Ayrıca, SEC yolu tüm hayvanlarda mevcuttur ve temel bir bileşen olarak işlev görür. Öte yandan TAT yolu gerekli, zorunlu olmayan veya tamamen yok olabilir.
Aşağıdaki infografik, yan yana karşılaştırma için SEC ve TAT yolu arasındaki farkları tablo biçiminde sunar.
Özet – SEC ve TAT Yolu
Protein sentezi ve taşıma mekanizmaları tüm hayvanlarda, bitkilerde, arkelerde ve bakterilerde ortaktır. Protein taşınması, proteinlerin hücresel veya hücre dışı bölmelerden diğerine hareketini içerir. SEC yolu ve TAT yolu, proteinlerin taşınmasında rol oynayan bu tür iki sistemdir. SEC ve TAT yolu arasındaki temel fark, SEC yolunun katlanmamış proteinleri, TAT yolunun ise katlanmış proteinleri taşımasıdır. Her iki sistemin de taşıma yolları endositoz, ekzositoz, protein translokasyonu ve membran kaçakçılığı ile kolaylaştırılır.
