Lac vs Trp Operon
Operon, prokaryotlarda özel bir gen hizalamasıdır. Bir operonda, belirli bir işlev için gereken tüm genleri hizalar. Bu organizasyon, tek bir promotörün belirli bir işleve katılan tüm genleri etkinleştirmesine, devre dışı bırakmasına ve düzenlemesine izin verir. Bu doğası nedeniyle, operon, prokaryotik gen ekspresyonunun fonksiyonel birimi olarak adlandırılır. Lac operon ve Trp operon, E.coli bakteri genomunda ve diğer birçok bakteride bulunan iki operondur. Bu operonlar farklı işlevleri kontrol eder. Operon, prokaryotik gen ifadesinin işlevsel birimidir.
Lac Operon
Lac operon, E.coli'de laktoz taşınması ve metabolizmasından sorumlu gen kümesidir.koli bakterisi. Operonun bir promotör bölgesi ve lac Z, lac Y, lac A ve lac I genleri vardır. Operon, laktoz varlığı ile aktive edilir. Lac Z, lac Y, lac A, beta galaktosidaz, laktoz permeaz ve tiyogalaktozid transasetilaz enzimleri üretir.
Permease enzimi, laktozun hücre içine girmesini sağlar ve beta galaktosidaz, laktozu hidrolize ederek glikoz ve galaktoza dönüştürür. Transasetilaz, substratları işlevselleştirmek için kullanılır. Daha fazla tercih edilen bir substrat mevcutsa veya laktoz yoksa, lac I aktive olur. Bu, bir allolaktoz bağlayıcı protein üretir. Allolktoz varlığında, baskılayıcı protein molekülleri allolaktoz moleküllerine bağlanır. Bu, transkripsiyonun rahatsız edilmeden devam etmesini sağlar. Laktoz yokluğunda, bu protein, lac operon bloke eden ve gen transkripsiyonunu durduran promotör bölgesine (kontrol ünitesi) bağlanır. Bu olduğunda, laktoz permeaz veya beta galaktosidaz üretilmez. Bu nedenle, laktoz katabolizması durdurulur.
Trp Operon
Trp operonu aynı zamanda tek bir promotör tarafından kontrol edilen bir gen kümesidir. Bu operon, Trp sentezi için gerekli tüm genleri içerir. Genellikle Trp olarak kıs altılan triptofan alışılmadık bir amino asittir. Operon, toplu olarak triptofan sentetazı kodlayan trp E, trp D, trp C, trp B ve trp A'dan oluşur; triptofan üreten enzim.
trp operonu ayrıca gerektiğinde bir baskılayıcı üreten trp R içerir. Triptofanın varlığında bu operon devre dışı kalır çünkü represör konformasyonunu aktif forma değiştirir ve promotör bölgeye bağlanır. Triptofanın yokluğunda, promotör bölgeden baskılayıcı protein salınır veya promotör bölgeye bağlanamayan inaktif konformasyondadır ve bunun sonucunda triptofan yapan genlerin transkripsiyonu başlatılır. Lac operonundan farklı olarak bu operon triptofan varlığında devre dışı bırakılır, bu mekanizmaya “negatif baskılayıcı geri besleme mekanizması” adı verilir.
Lac operonu ile Trp operonu arasındaki fark nedir?
• Lac operon bir şekerin katabolik süreci ile ilgilidir, ancak Trp operon bir amino asidin anabolik süreci ile ilgilidir.
• Lak operonu laktoz varlığında aktive olur, ancak Trp operonu triptofan varlığında devre dışı kalır.
• Lac operon üç yapısal gen ve bir baskılayıcı genden oluşur, ancak Trp operon beş yapısal gen ve bir baskılayıcı genden oluşur.
• Lac operonu “zayıflama” mekanizmasını kullanmaz, ancak Trp operonu “zayıflama” mekanizmasını kullanır.
