Gen nakavt ve nakavt arasındaki temel fark, gen nakavtının, genin işlevlerini incelemek için ilgilenilen genin tamamen kaldırıldığı (çalışmayan durum) bir teknik olması, gen nakavtının ise genin nakavt olduğu başka bir teknik olmasıdır. belirli bir genin biyolojik bir sistemdeki rolünü araştırmak için ilgi susturulur.
Yaşayan biyolojik sistemlerdeki genlerin işleyişini araştırmak için farklı genetik teknikler uygulanmaktadır. Gen nakavt ve nakavt bu tür iki tekniktir. Bu teknikler, bilim adamlarının canlı organizmalardaki farklı genlerin işlevsel yönlerini belirlemelerine yardımcı olur.
Gen Knockout nedir?
Gen nakavt, canlı organizmalarda bir veya daha fazla geni çalışmaz hale getiren genetik bir tekniktir. Bu aynı zamanda bir organizmanın genini kapatma veya silme işlemidir. Bu tekniğin birincil uygulaması, gen fonksiyonunu incelemektir. İşlem, kaybolan veya çıkarılan genin etkisini değerlendirir. Nakavt işlemi ayrıca belirli enzimleri ve ekleme tekniklerini de içerir.
Şekil 01: Gen Knockout
Gen nakavt tekniğinde ilgili genlerin sayısına bağlı olarak birkaç varyasyon vardır. Bunlar çift nakavt (iki genin nakavtı), üçlü nakavt (üç genin nakavtı) ve dörtlü nakavt (dört genin nakavtı). Gen nakavt ayrıca iki gruba ayrılır; heterozigot nakavtlar ve homozigot nakavtlar.
Gen Knockdown nedir?
Gen yıkımı, bu prosedürün bir organizmanın belirli bir geninin veya genlerinin ekspresyonunu baskıladığı veya az alttığı deneysel bir prosedürdür. Gen susturma, gen yıkımının ortak tanımıdır. Bu prosedür sırasında, üretilen mRNA'nın aktivasyonu veya bozulması, RNA interferansını (RNAi), küçük enterferans yapan RNA'yı (siRNA) ve kısa firkete RNA'sını (shRNA) içerir.
Şekil 02: Gen Susturma
Gen yıkımının birincil kullanımı, belirli bir genin biyolojik sistemdeki rolünü araştırmaktır. Bu nedenle, bu teknik nörolojik hastalıklara, viral enfeksiyonlara ve kalıtsal hastalıklara neden olan onkogenlerin (Bcl-2 ve P53) ve genlerin incelenmesini başarır.
Gen Knockout ve Knockdown Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Gen nakavt ve gen nakavtının her ikisi de genetik tekniklerdir.
- Bu iki teknik gen ifadesini önleyebilir.
- Her iki tekniğin de birincil kullanımı, ilgilenilen genin işlevini araştırmaktır.
- Her ikisi de farklı hastalık koşullarını (genetik) tanımlama yeteneğine sahiptir.
- İkisi de ilgi duyulan bir veya daha fazla gen için kullanılabilir.
Gen Knockout ile Knockdown Arasındaki Fark Nedir?
Gen Knockout vs Knockdown |
|
| Gen nakavt, bir organizmanın genlerinin (DNA'dan genlerin çıkarılması) farklı genetik tekniklerle çalışmasıdır. | Gen yıkımı, bir organizmanın belirli bir geninin veya genlerinin ifadesini bastırmak (az altmak veya susturmak) için deneysel bir prosedürdür. |
| Fonksiyon | |
| Kayıp genin sonuçlarını analiz ederek genlerin işlevlerinin çalışılmasını kolaylaştırır. | Onkogenlerin, nörolojik hastalıklara, viral enfeksiyonlara ve kalıtsal hastalıklara neden olan genlerin çalışılmasını kolaylaştırır. |
| RNA Ajanlarının Katılımı | |
| RNA ajanlarının katılımı bu teknikte önemsizdir. | Süreç, mRNA'yı etkisiz hale getirmek için siRNA, shRNA ve RNAi gibi ajanları içerir. |
| Kimyasal Ajanların Kullanımı | |
| Enzimatik ajanlar kullanılır. | Böyle kimyasal maddeler kullanılmaz. |
| Gen Üzerindeki Etki | |
| Gini DNA'dan tamamen çıkarır. | Gini bastırın veya susturun. |
| Sınıflandırma | |
| Çift nakavt, üçlü nakavt ve dörtlü nakavt ile heterozigot ve homozigot nakavt farklı gen nakavt türleridir. | Gen susturma için böyle bir sınıflandırma sistemi yok. |
Özet – Gen Knockout vs Gen Knockdown
Burada tartıştığımız iki teknik; gen nakavt ve nakavt, farklı genlerin işlevlerini araştırmak için yöntemlerdir. Gen nakavt, geni tamamen çalışmaz hale getirirken, gen nakavt, ilgili geni susturur. Ancak her iki prosedür de gen ekspresyonunu engeller. Farklı ajanlar bu iki işlemi gerçekleştirme yeteneğine sahiptir. Gen nakavt, bir tür silme, gen nakavt ise bir tür inaktivasyondur. Bu, gen nakavt ve nakavt arasındaki farktır.
