Homodimer ve heterodimer arasındaki temel fark, homodimer iki özdeş proteinden yapılmış bir protein iken heterodimer iki farklı proteinden yapılmış bir proteindir.
Protein, amino asit zincirlerinden oluşan bir biyomoleküldür. Bir protein dimeri, iki protein monomerinin veya iki amino asit zincirinin birleşmesinden oluşan dörtlü bir protein yapısıdır. Genellikle birbirlerine kovalent olmayan bağlarla bağlanırlar. Protein dimerleri ya homodimerler ya da heterodimerlerdir. Bir homodimer, kovalent olmayan bir şekilde bağlı iki özdeş proteine sahiptir. Heterodimer birbirine bağlı iki farklı proteine sahiptir. Bu protein dimer etkileşimi, düzenleme ve katalizde önemlidir.
Homodimer nedir?
Homodimer, iki özdeş monomerden oluşan bir tür protein dimeridir. Monomerler kovalent olmayan bağlarla bağlanır. Genel olarak, homodimerlerde ortalama 18 H bağı sayısı vardır. Ayrıca, homodimerdeki H-bağları ile arayüzey kalıntıları arasındaki korelasyon katsayısı 0.85'tir. Ayrıca, homodimerin arayüz artığı başına maksimum H bağı sayısı 0,44'tür. Sadece bu değil, aynı zamanda homodimerlerde de daha fazla moleküller arası H bağı var. Bununla birlikte, homodimerlerde arayüz kalıntısı başına H bağlarının yoğunluğu daha düşüktür.
Şekil 01: Homodimer
Homodimer örnekleri düşünüldüğünde, sınıf 1 RNA'lar homodimerlerdir. Bu homodimerde, R1 proteini nükleotid indirgemesinden sorumludur, R2 proteini ise diiron tirosil dizisini barındırmaktan sorumludur. Diğer bir protein homodimeri, tiroid bezi tarafından üretilen tiroglobulindir. Ksantin oksidaz ve etanersept de protein homodimerleridir.
Heterodimer nedir?
Heterodimer, aynı olmayan iki monomerden oluşan bir tür protein dimeridir. Başka bir deyişle, bir heterodimer, iki farklı protein monomerinden oluşan bir proteindir. Genel olarak, heterodimerlerde ortalama 12 sayıda H bağı vardır. Ayrıca, heterodimerdeki H-bağları ve ara yüzey kalıntıları arasındaki korelasyon katsayısı 0,83'tür. Ayrıca, heterodimerin arayüz artığı başına maksimum H bağı sayısı 0.65'tir. Homodimerlerle karşılaştırıldığında, heterodimerlerde daha az moleküller arası H bağı vardır. Bununla birlikte, arayüz kalıntısı başına H bağlarının yoğunluğu heterodimerlerde daha yüksektir.
Şekil 02: Heterodimer
Enzim ters transkriptaz, iki farklı amino asit zincirinden oluşan bir heterodimerdir. Bir heterodimerin başka bir örneği opioid reseptörleridir. Ayrıca tubulin bir heterodimer proteindir.
Homodimer ve Heterodimer Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Homodimer ve heterodimer, iki tür protein dimmeridir.
- İkisinin de iki monomeri vardır.
- Kuaterner protein yapılarıdır.
- Dimerler kataliz ve regülasyonda yaygındır.
Homodimer ve Heterodimer Arasındaki Fark Nedir?
Homodimer, iki özdeş protein monomerinden oluşan bir protein dimeridir, heterodimer ise iki farklı protein monomerinden oluşan bir protein dimeridir. Yani, bu homodimer ve heterodimer arasındaki temel farktır. Ayrıca, homodimerlerde ortalama 18 H bağı sayısı varken, heterodimerlerde ortalama 12 H bağı sayısı vardır.
Ayrıca, homodimer ve heterodimer arasındaki diğer bir fark, H-bağları ile arayüz kalıntıları arasındaki korelasyon katsayısının homodimerlerde 0.85 iken heterodimerlerde 0.83 olmasıdır.
Homodimer ve heterodimer arasındaki farkı gösteren aşağıdaki bilgi grafiği, her iki dimer arasında daha fazla karşılaştırma gösterir.
Özet – Homodimer ve Heterodimer
Protein dimerleri kataliz ve regülasyonda yaygındır. Homodimer veya heterodimer olabilirler. Homodimerler iki özdeş protein monomerinden oluşur. Buna karşılık, heterodimerler iki özdeş olmayan protein monomerinden oluşur. Dolayısıyla homodimer ve heterodimer arasındaki temel fark budur.
