TATA ve CAAT kutusu arasındaki temel fark, TATA kutusunun TATAWAW konsensüs dizisine sahip korunmuş bir nükleotit bölgesi olması, CAAT kutusunun ise GGCCAATCT konsensüs dizisine sahip korunmuş bir nükleotit bölgesi olmasıdır.
TATA kutusu ve CAAT kutusu, ökaryotik genlerin transkripsiyonunu etkileyen iki nükleotit bölgesidir. Bunlar, transkripsiyon başlatma bölgesinin yukarısında bulunan kodlamayan DNA dizileridir. Aslında, destekleyici olarak bilinen düzenleyici bölgede bulunurlar. Hem TATA kutusu hem de CAAT kutusu, transkripsiyonun verimliliğinden sorumludur. Bunlar evrimsel süreç boyunca değişmeyen konsensüs dizileridir.
TATA Box nedir?
TATA kutusu veya Goldberg-Hogness kutusu, ökaryotik genlerin promotör bölgesinde bulunan bir konsensüs dizisidir. TATA kutusu, promotörün temel bir unsurudur. Transkripsiyon başlatma bölgesinin yukarısında 25 baz çifti bulunur. Evrimsel süreç boyunca korunur. TATA kutusunun konsensüs dizisi TATAWAW'dır, burada W, A veya T'dir. Kodlamayan bir DNA dizisidir. Ancak TATA kutusu, genin transkripsiyonu için önemlidir. TATA bağlayıcı proteinin (TBP) ve diğer transkripsiyon faktörlerinin bağlanma bölgesidir. TATA kutusuna bağlandıklarında, ökaryotik genlerde RNA polimeraz II'nin alımı ve transkripsiyonun uygun şekilde düzenlenmesi gerçekleşir.
Şekil 01: TATA Kutusu
TATA kutusu transkripsiyonun düzenlenmesinde rol oynadığından, TATA kutusunun mutasyonları mide kanseri, spinoserebellar ataksi, Huntington hastalığı, körlük, β-talasemi, immünosupresyon, Gilbert sendromu gibi hastalıklara yol açan fenotipik değişikliklere neden olabilir. ve HIV-1, vb.
CAAT Box nedir?
CAAT kutusu, GGCCAATCT'nin konsensüs dizisine sahip bir nükleotit bölgesidir. TATA kutusuna benzer şekilde CAAT kutusu da genin promotör bölgesinde yer alır. Bu nedenle, transkripsiyon bölgesinin yukarısında yaklaşık 75-80 baz çifti bulunur.
Şekil 02: CAAT Kutusu
Spesifik transkripsiyon faktörleri CAAT kutusuna bağlanır. Bu bağlanma, RNA polimeraz enziminin daha kolay bağlanması için ön başlatma kompleksini stabilize eder. Aynı şekilde, CAAT kutusu düzenleyici bir dizi olarak çalışır. CAAT kutusu bölgesindeki mutasyonlar, promotör yanıtını ve transkripsiyonun düzenlenmesini büyük ölçüde etkiler.
TATA ve CAAT Box Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- TATA ve CAAT, ökaryotik genlerin düzenleyici dizisinde bulunan iki nükleotit bölgesidir.
- Transkripsiyon başlatma sitesinin akış yukarısında bulunurlar.
- Her ikisi de konsensüs DNA dizileridir.
- Transkripsiyonun düzenlenmesi için gereklidirler, dolayısıyla düzenleyici dizilerdir.
TATA ve CAAT Box Arasındaki Fark Nedir?
TATA kutusu, transkripsiyon başlatma bölgesinin yukarısında yaklaşık 25-30 baz çifti bulunan korunmuş bir nükleotit bölgesidir. Öte yandan, CAAT kutusu, transkripsiyon başlatma bölgesinin yukarısında yaklaşık 75-80 baz çifti bulunan korunmuş bir nükleotit bölgesidir. Bu, TATA ve CAAT kutusu arasındaki temel farktır. Ayrıca, TATA kutusu TATAWAW'ın bir konsensüs dizisine sahipken GGCCAATCT, CAAT kutusunun konsensüs dizisidir.
Ayrıca, TATA ve CAAT kutusu arasındaki bir diğer önemli fark, TATA kutusunun TBP ve transkripsiyon faktörleri için bir bağlanma bölgesi sağlaması ve CAAT kutusunun RNA transkripsiyon faktörü için bağlanma bölgesini işaret ederken transkripsiyon düzenlemesine katılmasıdır.
Aşağıdaki bilgi grafiği, TATA ve CAAT kutusu arasındaki farkları özetler.
Özet – TATA ve CAAT Box
TATA kutusu ve CAAT kutusu, ökaryotik gen promotörlerinin korunan bölgesinin iki parçasıdır. Transkripsiyon başlatma bölgesinin akış yukarısında bulunurlar. Her ikisi de TATA bağlayıcı proteinleri ve transkripsiyon başlatma faktörlerini bağlamak için alanlar sağlayarak genlerin transkripsiyonunu etkiler. TATA kutusu, transkripsiyon başlatma bölgesinin akış yukarısında 25-35 baz çifti bulunurken, CAAT kutusu, transkripsiyon başlatma bölgesinin akış yukarısında 75-80 baz çifti bulunur. TATA kutusunun konsensüs dizisi TATAWAW iken CAAT kutusunun konsensüs dizisi GGCCAATCT'dir. Bu nedenle, TATA ve CAAT kutusu arasındaki farkın özeti budur.
