Kompozit transpozonlar ve IS öğeleri arasındaki temel fark, kompozit transpozonların antibiyotik direnç genleri gibi yardımcı genleri taşıyan bir tür transpozon olması, IS öğelerinin (veya Ekleme Dizisi öğelerinin) ise yalnızca genleri taşıyan transpozonlar olmasıdır. transpozisyon aktivitesini katalize eden kod transpozazı.
A transpozon, bakteri genomu içindeki konumunu değiştirebilen bir DNA parçasıdır. Bu nedenle, hareketli DNA dizileridir. Genomun yeni yerlerine taşınırlar, bakteri genomunun dizilişinde değişiklikler yaparak genetik bilgide önemli değişikliklere neden olurlar. Transpozonlar, genlerin transkripsiyonunu bloke edebildikleri ve bakterinin genetik materyalini yeniden düzenleyebildikleri için zıplayan genler olarak da bilinirler. Ayrıca ilaç direnci, antibiyotik direnç genlerinin plazmitler ve kromozomlar arasındaki hareketinden sorumludurlar. Kompozit transpozonlar ve IS elementleri, bakterilerde bulunan iki tip mobil genetik elementtir. Her ikisi de genomda bir konumdan diğerine hareket edebilir.
Kompozit Transpozon nedir?
Kompozit transpozon, benzer ekleme dizisi elemanlarının iki kopyası ile çevrili bir DNA parçasıdır. Kompozit transpozonda merkezi bir protein kodlayan bölge vardır. Genler genellikle antibiyotiğe dirençli genlerdir. Ayrıca katabolik genler içerebilirler. Ayrıca, bileşik transpozon iki ters çevrilmiş tekrardan oluşur. Kompozit transpozonun tüm uzunluğu tam bir birim olarak hareket eder.
Şekil 01: Kompozit Transpozon
Tn10 bir bileşik transpozondur. 6.5 kb'lik bir merkezi kodlama bölgesinden (tetrasikline dirençli gen) ve her bir uçta 1.4 kb'lik ters çevrilmiş yerleştirme dizisi elemanlarından oluşur. IS elemanları transpozaz sağlar. Transpozaz, transpozonun hareketini katalize eden bir enzimdir. Bileşik transpozonlar, IS elemanları için primerler tasarlanarak amplifiye edilebilir.
Elementler nedir?
Ekleme dizisi öğeleri veya IS öğeleri, bir tür mobil genetik öğedir. Bunlar basit bir transpozon şeklidir. Sadece transpozaz enzimlerini kodlayan genleri taşırlar. Transpozaz enzimleri, transpozonların transpozisyonunu katalize eder. Yapısal olarak, IS öğelerinin kodlama dizisi, iki ters çevrilmiş tekrarla çevrilidir. Örneğin, IS911 olarak adlandırılan IS elemanı, iki 36bp ters çevrilmiş tekrar ucu ile çevrilidir.
IS elementleri, bakteri genomunda en bol bulunan otonom transpoze olabilen elementlerdir. Bu nedenle prokaryotik genom organizasyonu ve evrimi için son derece önemlidirler. Ayrıca, IS elemanları kompozit transpozonların parçaları olarak ortaya çıkar. Genel olarak, bileşik transpozonun kodlama dizisinin yanında iki IS elemanı bulunur. Ancak birim transpozonları, yan IS öğelerini taşımaz.
IS elemanları genom içinde hareket edebildiğinden, diğer genlerin kodlama dizisini kesebilir ve ifadeyi bloke ederek genleri etkisiz hale getirebilirler.
Kompozit Transpozonlar ve IS Elementleri Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- Hem kompozit transpozonlar hem de IS elementleri bakteri genomundaki pozisyonu değiştirebilir.
- Her iki transpozondaki kodlama bölgesi genellikle ters çevrilmiş tekrarlarla çevrilidir.
- Bir bileşik transpozon iki ayrı IS öğesiyle çevrilidir.
Kompozit Transpozonlar ve IS Elementleri Arasındaki Fark Nedir?
Kompozit transpozonlar, genellikle bir veya daha fazla antibiyotik direnç genini çevreleyen iki ekleme dizisinden (IS) oluşan mobil genetik elemanlardır. Öte yandan, IS elementleri, transpozisyonu katalize etmek için transpozaz enzimini kodlayan genleri içeren basit bir transpoze edilebilir element türüdür. Bu, bileşik transpozonlar ve IS öğeleri arasındaki temel farktır.
Aşağıda, yan yana karşılaştırma için tablo biçiminde bileşik transpozonlar ve IS öğeleri arasındaki farkların bir listesi bulunmaktadır.
Özet – Kompozit Transpozonlar ve IS Elements
Bir bakteri genomu, hareketli olan genetik öğelere sahiptir. Kompozit transpozonlar ve IS elementleri, iki tür mobil genetik elementtir. Kompozit transpozonlar, antibiyotiğe dirençli genleri ve yan IS elementlerini taşır. IS elemanları, transpozonların hareketini katalize eden transpozazı üretmek için genetik kodu taşır. Bu nedenle, bileşik transpozonlar ve IS öğeleri arasındaki temel fark budur.
