NFkb1 ve NFkb2 arasındaki temel fark, NFkb1 geninin insanlarda NFkb1 proteinini kodlaması ve NFkb2 geninin insanlarda NFkb2 proteinini kodlamasıdır.
NFkb, DNA'nın transkripsiyonunu, sitokin üretimini ve hücre hayatta kalmasını kontrol eden bir protein kompleksidir. Genellikle stres, sitokinler, serbest radikaller, ağır metaller, ultraviyole ışınlama, oksitlenmiş LDL, bakteriyel veya viral antijenler gibi uyaranlara verilen hücresel tepkilerde yer alır. Ayrıca enfeksiyona karşı bağışıklık tepkilerini düzgün bir şekilde düzenlemede önemli bir rol oynar. NFkb'nin düzensizliği kanser, enflamatuar hastalıklar, septik şok, viral enfeksiyon ve uygun olmayan bağışıklık gelişimi ile ilişkilendirilmiştir. NFkb protein ailesinde beş protein vardır: NFkb1, NFkb2, ReIA, ReIB ve c-ReI.
NFkb1 nedir?
NFkb1, insanlarda NFkb1 geni tarafından kodlanan bir proteindir. NFkb1 geni normalde 105 kDa (P105) büyüklüğünde bir proteini kodlar. Bu protein, bir 50 kDa proteini (P50) üretmek için 26S proteazomu tarafından eş-dönüşümsel işleme tabi tutulabilir. 105 kDa proteini bir Rel proteinine özgü transkripsiyon inhibitörüdür, 50 kDa proteini ise NFkb protein kompleksinin bir DNA bağlama alt birimidir. Ayrıca, P50-RelA dimer, transkripsiyonel bir aktivatördür.
Şekil 01: NFkb1
NFkb sitokinler, serbest radikaller, ultraviyole radyasyon, bakteriyel veya viral ürünler gibi çeşitli uyaranlar tarafından aktive edilen bir transkripsiyon faktörüdür. Aktive edilmiş NFkb transkripsiyon faktörü çekirdeğe yer değiştirebilir ve çeşitli biyolojik fonksiyonlarda yer alan genlerin ekspresyonunu uyarabilir. Spesifik koşullar altında, çeşitli hücre tiplerinde NFkb tarafından 200'den fazla gen hedeflenebilir. NFkb'nin uygun olmayan aktivasyonu, enflamatuar hastalıklarla ilişkilendirilmiştir. Öte yandan, NFkb'nin inhibisyonu, uygun olmayan immün hücre gelişimine veya gecikmiş hücre büyümesine yol açar. Ayrıca, NFkb1 proteininin BCL3, C22orf25, HDAC1, IKK2, ITGB3BP, MEN1, RELA, RELB, STAT3, STAT6, vb. gibi birkaç önemli protein ile etkileşime girdiği gösterilmiştir.
NFkb2 nedir?
NFkb2, insanlarda NFkb2 geni tarafından kodlanan bir proteindir. Bu gen, boyutu 100 kDa (P100) olan tam uzunlukta bir proteini kodlar. Bu protein, boyut olarak 52 kDa (P52) olan aktif bir proteine eş-dönüştürücü olarak işlenir. NFkb2 geni tarafından kodlanan proteinler, dimerizasyon ortağına bağlı olarak hem transkripsiyonel aktivatör hem de baskılayıcı olarak işlev görebilir.
Şekil 02: NFkb2
P52-RELB dimer bir transkripsiyonel aktivatördür, P100 ise bir transkripsiyonel baskılayıcıdır. Ayrıca, bazı B hücreli lenfomalarda bu lokusun kromozomal yeniden düzenlemeleri ve translokasyonu gözlenmiştir. Bu, translokasyondan sonra füzyon proteini oluşumundan kaynaklanmaktadır. Ayrıca kromozom 18 üzerinde bu NFkb2 geni için bir psödogen vardır. NFkb2 proteininin mutasyona uğramış versiyonu adrenokortikotropik hormon eksikliğine ve DAVID sendromuna neden olur. DAVID sendromu bir hipofiz hormonu eksikliği ve CVID'dir (yaygın değişken bağışıklık eksikliği).
NFkb1 ve NFkb2 Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- NFkb1 ve NFkb2, NFkb protein ailesindeki iki proteindir.
- Her iki protein de 1. sınıf NFkb protein kompleksine aittir.
- Her iki protein de transkripsiyonel aktivatör ve baskılayıcı olarak davranabilir.
- Her iki proteinin de düzensizliği çeşitli hastalıklara neden olabilir.
- Amino asitlerden oluşurlar.
NFkb1 ve NFkb2 Arasındaki Fark Nedir?
NFkb1, insanlarda NFkb1 geni tarafından kodlanan bir proteindir, NFkb2 ise insanlarda NFkb2 geni tarafından kodlanan bir proteindir. Bu nedenle, NFkb1 ve NFkb2 arasındaki temel fark budur. Ayrıca, NFkb1 proteini tam uzunluktaki P105 formu, aktif form P50'ye eş çevirir. Öte yandan, NFkb2 proteini tam uzunluktaki P100 formu, aktif form P52'ye eş çevirir.
Aşağıdaki infografik, yan yana karşılaştırma için NFkb1 ve NFkb2 arasındaki farkları tablo biçiminde sunar.
Özet – NFkb1 ve NFkb2
NFkb protein kompleksi, DNA transkripsiyonunun, sitokin üretiminin ve hücre hayatta kalmasının kontrolünde rol oynar. NFkb1 ve NFkb2 proteinleri, sınıf 1 NFkb protein ailesine aittir. NFkb1, insanlarda NFkb1 geni tarafından kodlanan bir protein iken NFkb2, insanlarda NFkb2 geni tarafından kodlanan bir proteindir. Bu, NFkb1 ve NFkb2 arasındaki farkı özetler.