GAP ve GEF arasındaki temel fark, GAP'nin (GTPaz aktive edici protein), G proteinine bağlandıktan sonra hücrenin aşağı akış sinyalini kapatabilen bir protein olması, GEF'in (guanin nükleotid değişim faktörü) ise bir protein olmasıdır. G proteinine bağlandıktan sonra hücrenin aşağı akış sinyalini açabilir.
G proteinleri, guanin nükleotid bağlayıcı proteinler olarak da bilinir. Bir G proteini, biyolojik hücre içinde moleküler bir anahtar görevi görebilen bir proteindir. Bir hücrenin dışındaki çeşitli uyaranlardan hücrenin içine sinyallerin iletilmesinde rol oynar. Ayrıca, G proteinleri, GTPaz adı verilen daha büyük bir enzim grubuna aittir. G proteininin aktivitesi, G proteininin GTP'yi GDP'ye hidrolize etme yeteneğini kontrol eden faktörler tarafından düzenlenir. G proteini GTP'ye bağlandığında aktiftir. Ancak G proteini GDP'ye bağlandığında aktif değildir. Bu nedenle GAP ve GEF, G proteininin işlevini düzenleyebilen iki faktördür.
GAP nedir?
GTPaz aktive edici protein (GAP), G proteinine bağlandıktan sonra hücreye sinyal göndermeyi kapatabilen bir proteindir. Bu protein aynı zamanda GTPaz hızlandırıcı protein olarak da adlandırılır. Aktive G proteinlerine bağlanabilir ve GTPaz aktivitelerini uyarabilir. Bu, aşağı akış sinyal olaylarının sona ermesiyle sonuçlanır. GAP, GTP hidrolizini indükleyerek sinyal olaylarını sonlandırır. G proteininin GTP hidroliz (GTP⇒GDP) reaksiyonunu arttırdığında, G proteini sonuçta GDP ile bağlanır. Bu, G proteinini inaktive eder ve aşağı akış sinyalini kapatır.
Şekil 01: GAP
Bu anlamda, GAP işlevi, G proteini aracılı aşağı akış sinyalini artıran guanin nükleotid değişim faktörünün (GEF) işlevinin tersidir. GAP kuralsızlaştırması genellikle kanserlerle ilişkilidir. Bunun nedeni ya G proteinleriyle ilişkili GAP'lerin işlev kaybı ya da G proteininin GAP'ına yanıt verme yeteneğinin kaybıdır.
GEF nedir?
Guanine nükleotid değişim faktörü (GEF), G proteinine bağlandıktan sonra hücrenin aşağı akış sinyalini açabilen bir proteindir. Küçük GTPazların (G proteinleri) aktivasyonunda yer alan bir protein veya protein alanıdır. Normalde GDP, aktif olmayan G proteinlerinden çok yavaş ayrışır. GEF'in G proteinine bağlanması GDP'nin ayrışmasını katalize ederek yerine bir GTP molekülünün bağlanmasına izin verir.
Şekil 02: GEF
Ayrıca, GTP'nin G protein molekülüne bağlanması GEF'in salınmasıyla sonuçlanır. Böylece G protein molekülünü ve G protein aracılı aşağı akış hücre sinyalini aktive eder. Ayrıca, bazı GEF'ler birden fazla G proteinini aktive edebilirken diğerleri tek bir G proteinine özgüdür.
GAP ve GEF Arasındaki Benzerlikler Nelerdir?
- GAP ve GEF, G proteininin işlevini düzenleyebilen iki faktördür.
- Her iki faktör de proteindir.
- Bu faktörler G proteinlerine veya GTPazlara bağlanır.
- Her iki faktör de alt hücre sinyalleşmesini düzenleyebilir
- Hücresel işlev için rolleri son derece önemlidir.
GAP ve GEF Arasındaki Fark Nedir?
GAP, G proteinine bağlandıktan sonra hücrenin aşağı sinyalleşmesini kapatabilen bir proteindir, GEF ise bir G proteinine bağlandıktan sonra hücrenin aşağı sinyalleşmesini açabilen bir proteindir. Dolayısıyla, GAP ve GEF arasındaki temel fark budur. Ayrıca GAP, G proteininin GTP hidroliz reaksiyonunu geliştirirken GEF, GDP'nin G proteininden ayrılmasını artırır.
Aşağıdaki infografik, yan yana karşılaştırma için GAP ve GEF arasındaki farkları tablo biçiminde sunar.
Özet – GAP vs GEF
GAP ve GEF, G proteinlerine bağlandıktan sonra hücrenin aşağı akış hücre sinyalini düzenleyebilen iki faktördür. GAP, G proteinine bağlandıktan sonra hücrenin downstream sinyallemesini kapatabilen bir protein iken GEF, G proteinine bağlandıktan sonra hücrenin downstream sinyalini açabilen bir proteindir. İşte GAP ve GEF arasındaki farkın özeti bu.
